More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0109 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0109  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
456 aa  936    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02700  putative metallopeptidase, M16 family protein  49.56 
 
 
687 aa  453  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1543  peptidase M16 domain-containing protein  46.27 
 
 
682 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  30.27 
 
 
943 aa  199  7.999999999999999e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4248  peptidase M16 domain protein  30.44 
 
 
426 aa  182  9.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  27.41 
 
 
945 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  27.48 
 
 
439 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  27.25 
 
 
439 aa  170  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  28.05 
 
 
947 aa  170  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  25.66 
 
 
767 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  28.48 
 
 
959 aa  167  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  27.01 
 
 
969 aa  166  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0928  M16 family peptidase  26.91 
 
 
478 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  26.12 
 
 
474 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  27.08 
 
 
439 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0621  peptidase M16-like  26.13 
 
 
725 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  27.41 
 
 
479 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  26.98 
 
 
947 aa  156  8e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  26.52 
 
 
945 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  26.67 
 
 
495 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0082  peptidase M16 domain-containing protein  28.19 
 
 
477 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.281002 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  27.74 
 
 
921 aa  155  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  26.97 
 
 
944 aa  154  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0103  peptidase M16-like  26.27 
 
 
519 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.968685  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1597  peptidase M16 domain-containing protein  27.42 
 
 
466 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832035  normal  0.315453 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0121  peptidase M16 domain protein  26.37 
 
 
520 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0738  peptidase M16 domain-containing protein  27.38 
 
 
506 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  26.11 
 
 
944 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2774  peptidase M16-like  26.65 
 
 
494 aa  152  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171699  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5951  peptidase M16 domain protein  28.07 
 
 
426 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0110  peptidase M16 domain protein  26.15 
 
 
520 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.282099  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3947  peptidase M16 domain-containing protein  25.72 
 
 
481 aa  150  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  26.53 
 
 
495 aa  149  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  26.43 
 
 
439 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  26.91 
 
 
943 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  23.77 
 
 
945 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  26.91 
 
 
949 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3485  peptidase M16-like protein  26.43 
 
 
502 aa  146  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.320343  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  27.58 
 
 
954 aa  146  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  26.68 
 
 
949 aa  146  9e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1590  peptidase M16 domain protein  27.69 
 
 
424 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.508475  normal  0.157035 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0210  peptidase M16 domain protein  26.44 
 
 
497 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.481547 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  26.68 
 
 
944 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  26.35 
 
 
974 aa  145  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3443  peptidase M16-like protein  27.16 
 
 
473 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  26.46 
 
 
949 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2752  peptidase M16 domain protein  25.6 
 
 
494 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  26.68 
 
 
950 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  26.68 
 
 
950 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3814  peptidase M16 domain-containing protein  26.32 
 
 
487 aa  144  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0705  peptidase M16 domain protein  26.67 
 
 
427 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3492  peptidase M16 domain-containing protein  25.85 
 
 
477 aa  143  6e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3741  peptidase M16 domain-containing protein  26.32 
 
 
486 aa  143  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  26.68 
 
 
944 aa  142  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  25.11 
 
 
958 aa  143  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  26.68 
 
 
950 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2345  peptidase M16 domain protein  25.62 
 
 
490 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.854323 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  26.62 
 
 
952 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4371  peptidase M16-like  26.19 
 
 
512 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.325226 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  25.18 
 
 
482 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3939  DNA-directed RNA polymerase  26.08 
 
 
487 aa  141  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  25 
 
 
954 aa  140  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  25.3 
 
 
483 aa  140  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  29.47 
 
 
449 aa  139  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  24.22 
 
 
479 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0208  peptidase M16 domain-containing protein  26.1 
 
 
487 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4255  peptidase M16 domain-containing protein  26.1 
 
 
492 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3239  zinc protease  26.85 
 
 
427 aa  138  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00842119  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0534  hypothetical protein  26.74 
 
 
422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2704  peptidase M16 domain protein  24.88 
 
 
458 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  26.99 
 
 
476 aa  137  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4129  peptidase M16 domain-containing protein  25.85 
 
 
492 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1776  peptidase M16 domain-containing protein  26.82 
 
 
438 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  25.44 
 
 
950 aa  133  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  25.18 
 
 
471 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  25.93 
 
 
944 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  26.68 
 
 
444 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  25.78 
 
 
949 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0864  peptidase M16 domain protein  25.12 
 
 
462 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  26.09 
 
 
441 aa  130  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5792  peptidase M16 domain protein  22.44 
 
 
458 aa  130  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.047663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  25.23 
 
 
967 aa  129  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  25.93 
 
 
435 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0262  peptidase M16 domain-containing protein  25.06 
 
 
480 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000120782  normal  0.152415 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06880  predicted Zn-dependent peptidase  24.4 
 
 
462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408528  normal  0.0872557 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0658  peptidase M16 domain protein  24.42 
 
 
490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3568  peptidase M16 domain-containing protein  27.81 
 
 
448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.742239  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0678  peptidase M16 domain protein  24.19 
 
 
490 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1347  peptidase M16 domain protein  26.9 
 
 
426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  27.34 
 
 
437 aa  127  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2922  peptidase M16 domain protein  26.54 
 
 
903 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.179553  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  24.78 
 
 
947 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0932  peptidase M16 domain-containing protein  26.01 
 
 
455 aa  126  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513926  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4237  peptidase M16 domain protein  24.64 
 
 
451 aa  126  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2273  peptidase M16 domain-containing protein  23.87 
 
 
438 aa  126  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.359911  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0261  peptidase M16 domain-containing protein  24.58 
 
 
481 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4197  peptidase M16 domain protein  26.38 
 
 
421 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4236  processing peptidase  26.38 
 
 
421 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385925 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  24.56 
 
 
949 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  24.34 
 
 
929 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>