More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06880 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_06880  predicted Zn-dependent peptidase  100 
 
 
462 aa  909    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408528  normal  0.0872557 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0864  peptidase M16 domain protein  62.09 
 
 
462 aa  532  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1583  peptidase M16 domain protein  54.99 
 
 
453 aa  421  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115865  normal  0.227723 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3795  peptidase M16-like  49.41 
 
 
448 aa  370  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.417189  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4127  peptidase M16 domain-containing protein  49.77 
 
 
447 aa  363  5.0000000000000005e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0932  peptidase M16 domain-containing protein  47.59 
 
 
455 aa  360  4e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513926  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4237  peptidase M16 domain protein  46.26 
 
 
451 aa  345  1e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3746  peptidase M16 domain-containing protein  48.28 
 
 
447 aa  341  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1776  peptidase M16 domain-containing protein  43.65 
 
 
438 aa  324  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0082  peptidase M16 domain-containing protein  35.08 
 
 
477 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.281002 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  30.04 
 
 
921 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  31.9 
 
 
439 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  31.67 
 
 
439 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3485  peptidase M16-like protein  25.18 
 
 
502 aa  155  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.320343  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0103  peptidase M16-like  32.66 
 
 
519 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.968685  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  30.82 
 
 
439 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0110  peptidase M16 domain protein  32.71 
 
 
520 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.282099  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  30.9 
 
 
439 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0121  peptidase M16 domain protein  32.71 
 
 
520 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  25.65 
 
 
483 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3492  peptidase M16 domain-containing protein  26.95 
 
 
477 aa  145  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3443  peptidase M16-like protein  25.73 
 
 
473 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  30.7 
 
 
767 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0210  peptidase M16 domain protein  26.77 
 
 
497 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.481547 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3741  peptidase M16 domain-containing protein  27 
 
 
486 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  26.4 
 
 
479 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3814  peptidase M16 domain-containing protein  27 
 
 
487 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3939  DNA-directed RNA polymerase  26.59 
 
 
487 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  27.52 
 
 
947 aa  136  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  27.03 
 
 
947 aa  136  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0208  peptidase M16 domain-containing protein  27 
 
 
487 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4255  peptidase M16 domain-containing protein  27 
 
 
492 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  29.13 
 
 
947 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  23.6 
 
 
482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  29.08 
 
 
954 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3947  peptidase M16 domain-containing protein  22.76 
 
 
481 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4129  peptidase M16 domain-containing protein  26.77 
 
 
492 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  25.64 
 
 
930 aa  131  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  25.53 
 
 
952 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0109  peptidase M16 domain protein  24.4 
 
 
456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  28.9 
 
 
949 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  28.9 
 
 
929 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  28.07 
 
 
950 aa  127  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  29.71 
 
 
967 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0928  M16 family peptidase  25.61 
 
 
478 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  24.81 
 
 
943 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0309  peptidase M16 domain protein  33.92 
 
 
901 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  25.76 
 
 
969 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  24.88 
 
 
494 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  25.76 
 
 
471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1271  peptidase M16 domain protein  28.74 
 
 
452 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.617151  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0298  peptidase M16-like  32.74 
 
 
903 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3239  zinc protease  24.02 
 
 
427 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00842119  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  26.54 
 
 
449 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  26.57 
 
 
496 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  28.05 
 
 
876 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5951  peptidase M16 domain protein  26.5 
 
 
426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1590  peptidase M16 domain protein  25 
 
 
424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.508475  normal  0.157035 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  26.96 
 
 
949 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0621  peptidase M16-like  25.95 
 
 
725 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  24.7 
 
 
474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0705  peptidase M16 domain protein  23.28 
 
 
427 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  26.35 
 
 
945 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  25.19 
 
 
495 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  26.68 
 
 
479 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  24.31 
 
 
960 aa  114  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0262  peptidase M16 domain-containing protein  22.99 
 
 
480 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000120782  normal  0.152415 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0320  peptidase M16 domain protein  33.92 
 
 
904 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812117  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  25.12 
 
 
437 aa  113  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  24.2 
 
 
497 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  25 
 
 
496 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  25.67 
 
 
495 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  25.45 
 
 
495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0261  peptidase M16 domain-containing protein  22.38 
 
 
481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  24.94 
 
 
495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  25.21 
 
 
476 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  28.05 
 
 
896 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  26.54 
 
 
937 aa  110  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  26.35 
 
 
959 aa  109  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1592  peptidase M16-like  24.94 
 
 
418 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0267121  normal  0.0196738 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  25.48 
 
 
496 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  24.29 
 
 
945 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  24.76 
 
 
496 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  23.96 
 
 
962 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  25.3 
 
 
945 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1347  peptidase M16 domain protein  28.69 
 
 
426 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33080  predicted Zn-dependent peptidase  31.07 
 
 
449 aa  107  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.519293  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1069  peptidase M16 domain-containing protein  30.02 
 
 
435 aa  107  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.421262  hitchhiker  0.00357472 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  26.9 
 
 
446 aa  107  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3582  peptidase M16 domain protein  26.52 
 
 
444 aa  107  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  26.82 
 
 
945 aa  106  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  27.18 
 
 
438 aa  106  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  25.5 
 
 
436 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3233  peptidase M16 domain protein  25.96 
 
 
426 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  24 
 
 
959 aa  104  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0893  peptidase M16 domain-containing protein  27.08 
 
 
451 aa  104  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0504062  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  25.7 
 
 
949 aa  104  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5792  peptidase M16 domain protein  21.62 
 
 
458 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.047663 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1597  peptidase M16 domain-containing protein  25.24 
 
 
466 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832035  normal  0.315453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  22.47 
 
 
495 aa  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.821712 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>