More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3947 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_0262  peptidase M16 domain-containing protein  71.52 
 
 
480 aa  694    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000120782  normal  0.152415 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  70 
 
 
482 aa  703    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3492  peptidase M16 domain-containing protein  71.55 
 
 
477 aa  714    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4255  peptidase M16 domain-containing protein  71.7 
 
 
492 aa  702    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3939  DNA-directed RNA polymerase  71.85 
 
 
487 aa  723    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0210  peptidase M16 domain protein  71.28 
 
 
497 aa  717    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.481547 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3443  peptidase M16-like protein  70.23 
 
 
473 aa  660    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4129  peptidase M16 domain-containing protein  71.28 
 
 
492 aa  699    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0261  peptidase M16 domain-containing protein  70.34 
 
 
481 aa  688    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3485  peptidase M16-like protein  64.6 
 
 
502 aa  655    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.320343  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3947  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
481 aa  983    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0208  peptidase M16 domain-containing protein  71.49 
 
 
487 aa  700    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3741  peptidase M16 domain-containing protein  72.25 
 
 
486 aa  719    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3814  peptidase M16 domain-containing protein  71.43 
 
 
487 aa  721    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  66.03 
 
 
483 aa  652    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2704  peptidase M16 domain protein  47.92 
 
 
458 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5792  peptidase M16 domain protein  47.3 
 
 
458 aa  425  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.047663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  31.28 
 
 
439 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  31.05 
 
 
439 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  30.59 
 
 
439 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  29.82 
 
 
439 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  29.14 
 
 
767 aa  209  8e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  30.84 
 
 
943 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0110  peptidase M16 domain protein  28.41 
 
 
520 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.282099  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0121  peptidase M16 domain protein  28.41 
 
 
520 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0103  peptidase M16-like  28.47 
 
 
519 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.968685  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  31.49 
 
 
949 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  31.49 
 
 
929 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  30.88 
 
 
947 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  26.6 
 
 
471 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  26.25 
 
 
474 aa  182  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  25.9 
 
 
479 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  26.26 
 
 
495 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2345  peptidase M16 domain protein  27.69 
 
 
490 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.854323 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0928  M16 family peptidase  24.52 
 
 
478 aa  176  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  26.02 
 
 
495 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  24.2 
 
 
476 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0658  peptidase M16 domain protein  27.27 
 
 
490 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0678  peptidase M16 domain protein  27.27 
 
 
490 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  27.57 
 
 
921 aa  169  9e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  28.12 
 
 
954 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  27.01 
 
 
434 aa  167  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  27.27 
 
 
495 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  25.6 
 
 
457 aa  160  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  25.23 
 
 
449 aa  160  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4371  peptidase M16-like  25.44 
 
 
512 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.325226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0621  peptidase M16-like  25.95 
 
 
725 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1096  putative zinc protease  27.27 
 
 
435 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0917813  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  24.84 
 
 
479 aa  158  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2314  peptidase M16 domain protein  27.08 
 
 
432 aa  157  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.298919  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2759  peptidase M16 domain-containing protein  27.03 
 
 
435 aa  156  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482454  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  26.46 
 
 
446 aa  156  7e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  25.85 
 
 
954 aa  156  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  27.62 
 
 
497 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2752  peptidase M16 domain protein  26.08 
 
 
494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  26.82 
 
 
496 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  27.56 
 
 
950 aa  153  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0738  peptidase M16 domain-containing protein  25.1 
 
 
506 aa  153  7e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2774  peptidase M16-like  25.53 
 
 
494 aa  153  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171699  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  27.21 
 
 
441 aa  152  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  26.3 
 
 
945 aa  152  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  29.85 
 
 
945 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  24.24 
 
 
444 aa  151  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0109  peptidase M16 domain protein  25.72 
 
 
456 aa  150  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  26.59 
 
 
495 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  26.07 
 
 
435 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  27.74 
 
 
486 aa  149  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  26.62 
 
 
969 aa  149  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  27.06 
 
 
494 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  26.42 
 
 
495 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2657  peptidase M16 domain-containing protein  26 
 
 
481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  28.26 
 
 
896 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  25.8 
 
 
947 aa  148  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  27.15 
 
 
465 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  26.44 
 
 
945 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  27.66 
 
 
967 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02700  putative metallopeptidase, M16 family protein  26.96 
 
 
687 aa  147  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  25.41 
 
 
952 aa  145  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  23.39 
 
 
437 aa  144  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  25.84 
 
 
496 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  28.47 
 
 
944 aa  143  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  28.35 
 
 
429 aa  143  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1543  peptidase M16 domain-containing protein  25.36 
 
 
682 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  24.65 
 
 
959 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  26.95 
 
 
464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  25.47 
 
 
960 aa  141  3e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  25.84 
 
 
496 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  25.78 
 
 
496 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  27.18 
 
 
937 aa  140  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  25.38 
 
 
457 aa  140  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  25.36 
 
 
437 aa  140  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  24.38 
 
 
444 aa  140  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  26.29 
 
 
435 aa  139  7.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  26.24 
 
 
945 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  27.23 
 
 
460 aa  139  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  25.57 
 
 
956 aa  139  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  26.14 
 
 
477 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  25.18 
 
 
438 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  24.94 
 
 
436 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  25.62 
 
 
454 aa  137  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>