More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3795 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3795  peptidase M16-like  100 
 
 		 448 aa  863    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.417189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0932  peptidase M16 domain-containing protein  73.09 
 
 		 455 aa  599  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513926  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1776  peptidase M16 domain-containing protein  49.18 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4237  peptidase M16 domain protein  53.43 
 
 		 451 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4127  peptidase M16 domain-containing protein  50.56 
 
 		 447 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06880  predicted Zn-dependent peptidase  49.41 
 
 		 462 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408528  normal  0.0872557 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3746  peptidase M16 domain-containing protein  49.09 
 
 		 447 aa  363  4e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0864  peptidase M16 domain protein  48.58 
 
 		 462 aa  350  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1583  peptidase M16 domain protein  47.92 
 
 		 453 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115865  normal  0.227723 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0082  peptidase M16 domain-containing protein  33.49 
 
 		 477 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.281002 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  31.72 
 
 		 921 aa  172  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  27.81 
 
 		 930 aa  161  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  28.1 
 
 		 943 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  30.04 
 
 		 947 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  29.05 
 
 		 929 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  29.05 
 
 		 949 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  30.86 
 
 		 439 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  29.12 
 
 		 952 aa  149  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0210  peptidase M16 domain protein  26.39 
 
 		 497 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.481547 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3492  peptidase M16 domain-containing protein  26.42 
 
 		 477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3939  DNA-directed RNA polymerase  26.43 
 
 		 487 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5951  peptidase M16 domain protein  27.4 
 
 		 426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3741  peptidase M16 domain-containing protein  26.85 
 
 		 486 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  30.39 
 
 		 439 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3814  peptidase M16 domain-containing protein  26.32 
 
 		 487 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  32.36 
 
 		 439 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0103  peptidase M16-like  32.35 
 
 		 519 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.968685  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0121  peptidase M16 domain protein  31.7 
 
 		 520 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  26.3 
 
 		 952 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0110  peptidase M16 domain protein  31.89 
 
 		 520 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.282099  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  24.34 
 
 		 483 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3485  peptidase M16-like protein  24.82 
 
 		 502 aa  141  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.320343  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  29.37 
 
 		 767 aa  140  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4129  peptidase M16 domain-containing protein  26.39 
 
 		 492 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0208  peptidase M16 domain-containing protein  26.39 
 
 		 487 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4255  peptidase M16 domain-containing protein  26.39 
 
 		 492 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4197  peptidase M16 domain protein  27.72 
 
 		 421 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02700  putative metallopeptidase, M16 family protein  28.02 
 
 		 687 aa  136  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4236  processing peptidase  27.72 
 
 		 421 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385925 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  26.85 
 
 		 954 aa  136  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3239  zinc protease  24.94 
 
 		 427 aa  135  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00842119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3443  peptidase M16-like protein  25.76 
 
 		 473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  29.68 
 
 		 439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  27.35 
 
 		 949 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  27.58 
 
 		 949 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  27.48 
 
 		 949 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  23.28 
 
 		 482 aa  134  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3568  peptidase M16 domain-containing protein  30.53 
 
 		 448 aa  134  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.742239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  26.73 
 
 		 944 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  28.11 
 
 		 950 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  28.11 
 
 		 950 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  28.11 
 
 		 944 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  28.32 
 
 		 949 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  27.9 
 
 		 944 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0261  peptidase M16 domain-containing protein  23.83 
 
 		 481 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  27.88 
 
 		 950 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3947  peptidase M16 domain-containing protein  30.85 
 
 		 448 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530134  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  25.62 
 
 		 969 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  26.79 
 
 		 949 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  24.72 
 
 		 945 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  26.35 
 
 		 950 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  28.33 
 
 		 494 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  27.35 
 
 		 944 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0262  peptidase M16 domain-containing protein  23.06 
 
 		 480 aa  124  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000120782  normal  0.152415 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0966  peptidase M16-like  24.55 
 
 		 413 aa  124  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  24.11 
 
 		 958 aa  123  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  27.35 
 
 		 944 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2704  peptidase M16 domain protein  23.79 
 
 		 458 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1590  peptidase M16 domain protein  24.15 
 
 		 424 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.508475  normal  0.157035 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2615  peptidase M16 domain-containing protein  25.34 
 
 		 910 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0381043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  25.56 
 
 		 947 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  28.12 
 
 		 954 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  24.26 
 
 		 479 aa  121  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3615  peptidase M16 domain protein  25.18 
 
 		 421 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785014 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0365  processing peptidase  25.59 
 
 		 424 aa  120  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1597  peptidase M16 domain-containing protein  24.34 
 
 		 466 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832035  normal  0.315453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  27.48 
 
 		 496 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  26.73 
 
 		 449 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  25.73 
 
 		 959 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3947  peptidase M16 domain-containing protein  21.88 
 
 		 481 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0621  peptidase M16-like  26.52 
 
 		 725 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0738  peptidase M16 domain-containing protein  25.56 
 
 		 506 aa  118  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0705  peptidase M16 domain protein  21.48 
 
 		 427 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4248  peptidase M16 domain protein  26.16 
 
 		 426 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0109  peptidase M16 domain protein  24.15 
 
 		 456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  25.38 
 
 		 956 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  25.38 
 
 		 959 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  24.56 
 
 		 474 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  27.67 
 
 		 429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  24.38 
 
 		 945 aa  114  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  23.9 
 
 		 943 aa  113  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  26.24 
 
 		 967 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2244  peptidase M16 domain-containing protein  24.77 
 
 		 473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.564136  normal  0.0526388 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  23.6 
 
 		 495 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  27.79 
 
 		 496 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2345  peptidase M16 domain protein  22.68 
 
 		 490 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.854323 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  23.67 
 
 		 495 aa  111  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2774  peptidase M16-like  23.57 
 
 		 494 aa  111  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171699  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  27.48 
 
 		 496 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  26.21 
 
 		 896 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>