More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3568 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3947  peptidase M16 domain-containing protein  91.52 
 
 
448 aa  731    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530134  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3568  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
448 aa  871    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.742239  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1271  peptidase M16 domain protein  43.24 
 
 
452 aa  299  8e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.617151  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0405  peptidase M16 domain protein  36.71 
 
 
449 aa  232  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.445293  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2362  putative proteinase  37.05 
 
 
460 aa  229  8e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0870  peptidase M16 domain protein  38.14 
 
 
451 aa  216  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  32.72 
 
 
439 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  28.76 
 
 
944 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  28.92 
 
 
949 aa  172  9e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  28.76 
 
 
950 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  28.54 
 
 
950 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  29.16 
 
 
949 aa  170  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  28.31 
 
 
950 aa  170  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  29.16 
 
 
949 aa  169  7e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  28.7 
 
 
949 aa  166  9e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  28.48 
 
 
944 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  31.18 
 
 
921 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  31.19 
 
 
439 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  31.69 
 
 
947 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  31.25 
 
 
439 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  30.96 
 
 
439 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  31.24 
 
 
929 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  31.24 
 
 
949 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  25.9 
 
 
969 aa  154  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  25.72 
 
 
945 aa  154  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  26.71 
 
 
974 aa  153  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  27.83 
 
 
944 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  27.23 
 
 
945 aa  152  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  31.71 
 
 
952 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  29.2 
 
 
943 aa  150  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  31.34 
 
 
767 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0110  peptidase M16 domain protein  33.09 
 
 
520 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.282099  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0121  peptidase M16 domain protein  33.09 
 
 
520 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  26.83 
 
 
944 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  30.28 
 
 
956 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  25.89 
 
 
947 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  26.59 
 
 
959 aa  147  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0103  peptidase M16-like  32.84 
 
 
519 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.968685  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  26.76 
 
 
943 aa  147  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  26.8 
 
 
944 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4237  peptidase M16 domain protein  36.43 
 
 
451 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  25.29 
 
 
958 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  26.76 
 
 
945 aa  140  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  28.94 
 
 
954 aa  139  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  26.81 
 
 
954 aa  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  27.98 
 
 
930 aa  138  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  25.82 
 
 
947 aa  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  25.23 
 
 
950 aa  137  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  27.55 
 
 
959 aa  137  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0320  peptidase M16 domain protein  35.43 
 
 
904 aa  136  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812117  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  26.73 
 
 
952 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3795  peptidase M16-like  30.24 
 
 
448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.417189  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0309  peptidase M16 domain protein  36.04 
 
 
901 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0298  peptidase M16-like  36.31 
 
 
903 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0082  peptidase M16 domain-containing protein  30.51 
 
 
477 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.281002 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0928  M16 family peptidase  27.89 
 
 
478 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0109  peptidase M16 domain protein  27.81 
 
 
456 aa  131  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  29.06 
 
 
967 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0932  peptidase M16 domain-containing protein  30.18 
 
 
455 aa  130  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513926  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2615  peptidase M16 domain-containing protein  28.99 
 
 
910 aa  130  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0381043  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5951  peptidase M16 domain protein  29.78 
 
 
426 aa  129  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  31.3 
 
 
949 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02700  putative metallopeptidase, M16 family protein  24.94 
 
 
687 aa  129  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3485  peptidase M16-like protein  24.61 
 
 
502 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.320343  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  30.23 
 
 
447 aa  124  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  29.74 
 
 
437 aa  124  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  28 
 
 
479 aa  123  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0210  peptidase M16 domain protein  24.25 
 
 
497 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.481547 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  26.04 
 
 
474 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  21.7 
 
 
483 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  25.39 
 
 
479 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3239  zinc protease  25.79 
 
 
427 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00842119  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  28.38 
 
 
494 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  24.47 
 
 
444 aa  116  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3492  peptidase M16 domain-containing protein  23.75 
 
 
477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  24.1 
 
 
482 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  25.79 
 
 
449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  27.54 
 
 
496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3443  peptidase M16-like protein  25.32 
 
 
473 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  27.01 
 
 
456 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3947  peptidase M16 domain-containing protein  25.43 
 
 
481 aa  113  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  27.06 
 
 
451 aa  113  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4248  peptidase M16 domain protein  28.12 
 
 
426 aa  113  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1776  peptidase M16 domain-containing protein  29.82 
 
 
438 aa  113  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  28.64 
 
 
444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  25 
 
 
960 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4129  peptidase M16 domain-containing protein  23.8 
 
 
492 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4255  peptidase M16 domain-containing protein  23.8 
 
 
492 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0208  peptidase M16 domain-containing protein  23.8 
 
 
487 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  27.08 
 
 
496 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  26.65 
 
 
465 aa  110  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  25.11 
 
 
962 aa  110  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  24.42 
 
 
945 aa  109  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2284  peptidase M16 domain protein  27.32 
 
 
427 aa  109  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.538642 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  28.78 
 
 
435 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  25.39 
 
 
454 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  26.81 
 
 
496 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  26.78 
 
 
471 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3814  peptidase M16 domain-containing protein  23.02 
 
 
487 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0388  putative Zinc protease-like signal peptide protein  27.02 
 
 
447 aa  107  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886206  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>