More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2714 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
437 aa  873    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  56.31 
 
 
457 aa  478  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  55.48 
 
 
437 aa  466  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  53.46 
 
 
444 aa  453  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  55.61 
 
 
435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1096  putative zinc protease  56.46 
 
 
435 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0917813  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2759  peptidase M16 domain-containing protein  56.19 
 
 
435 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482454  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  43.97 
 
 
464 aa  351  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  42.69 
 
 
454 aa  347  2e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  42.69 
 
 
451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  42.79 
 
 
447 aa  332  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  41.28 
 
 
457 aa  322  6e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  41.21 
 
 
460 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  40.6 
 
 
465 aa  308  8e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  41.36 
 
 
462 aa  308  9e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  41.55 
 
 
464 aa  307  3e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  40.62 
 
 
477 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  40.88 
 
 
462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  41.61 
 
 
456 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2864  peptidase M16 domain protein  39.57 
 
 
435 aa  301  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0431623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1802  peptidase M16 domain-containing protein  42.79 
 
 
431 aa  296  6e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2216  peptidase M16 domain-containing protein  42.69 
 
 
433 aa  293  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.384434  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2284  peptidase M16 domain protein  42.36 
 
 
427 aa  291  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.538642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2606  peptidase M16 domain protein  41.48 
 
 
427 aa  289  8e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0395  peptidase M16 domain protein  43.23 
 
 
437 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412071  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2329  peptidase M16 domain-containing protein  41.23 
 
 
427 aa  286  5e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.504761  normal  0.793459 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1010  peptidase M16 domain-containing protein  39.95 
 
 
426 aa  286  5e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.346738  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4179  peptidase M16 domain-containing protein  41.93 
 
 
430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0431  peptidase M16-like  38.66 
 
 
451 aa  247  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0200  peptidase M16 domain protein  35.43 
 
 
412 aa  229  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1058  M16 family peptidase  29.55 
 
 
451 aa  228  1e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7811  putative Zn-dependent protease  32.41 
 
 
439 aa  226  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101927  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0893  peptidase M16 domain-containing protein  34.24 
 
 
451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0504062  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  31.46 
 
 
444 aa  213  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  33.41 
 
 
441 aa  212  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0762  M16 family peptidase putative  29.23 
 
 
439 aa  211  2e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.655264  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  31.34 
 
 
434 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0850  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  27.92 
 
 
451 aa  211  3e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.669926  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  32.13 
 
 
446 aa  210  5e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  33.65 
 
 
495 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  34.69 
 
 
495 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1280  peptidase M16-like  32.95 
 
 
461 aa  206  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1926  peptidase M16 domain-containing protein  31.38 
 
 
445 aa  203  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3518  peptidase M16 domain-containing protein  33.65 
 
 
460 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  32.4 
 
 
435 aa  199  7.999999999999999e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  30.9 
 
 
429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2841  peptidase M16 domain protein  33.41 
 
 
460 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279982  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  33.57 
 
 
496 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  30.34 
 
 
436 aa  196  7e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0913  M16 family peptidase  27.13 
 
 
448 aa  196  1e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.226021  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  32.31 
 
 
453 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0283  peptidase M16-like protein  32.14 
 
 
454 aa  194  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0571104  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  33.57 
 
 
494 aa  193  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  32.78 
 
 
497 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  32.93 
 
 
486 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1670  peptidase M16-like  32.34 
 
 
471 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1631  peptidase M16 domain protein  30.16 
 
 
445 aa  189  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.368966  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0336  peptidase M16, C-terminal  33.73 
 
 
453 aa  187  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.469062  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  31.25 
 
 
495 aa  187  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  29.84 
 
 
437 aa  186  5e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  31.97 
 
 
494 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  30.71 
 
 
450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4763  peptidase M16 domain-containing protein  33.03 
 
 
448 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  27.49 
 
 
434 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3871  peptidase M16 domain-containing protein  31.59 
 
 
453 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  27.25 
 
 
434 aa  179  5.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  31.01 
 
 
496 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0388  putative Zinc protease-like signal peptide protein  31.5 
 
 
447 aa  179  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886206  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4372  peptidase M16 domain protein  31.6 
 
 
448 aa  179  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0243  peptidase M16 domain protein  30.48 
 
 
450 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  30.77 
 
 
496 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  30.53 
 
 
496 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  31.25 
 
 
438 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  30.5 
 
 
479 aa  173  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  29.9 
 
 
439 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1783  peptidase M16 domain-containing protein  27.06 
 
 
504 aa  171  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  30.15 
 
 
439 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0931  insulinase-like peptidase  28.81 
 
 
528 aa  170  5e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0647883  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  29.9 
 
 
439 aa  170  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1483  peptidase M16-like  28.23 
 
 
515 aa  169  7e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0660842  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2106  M16 family peptidase  29.33 
 
 
443 aa  169  7e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0218  non-proteolytic protein, peptidase family M16  29.45 
 
 
443 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  29.13 
 
 
495 aa  166  9e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  28.85 
 
 
495 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  25.41 
 
 
482 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3618  peptidase M16 domain protein  30.56 
 
 
467 aa  162  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  28.54 
 
 
471 aa  159  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0172  peptidase M16 domain protein  29.3 
 
 
441 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  27.03 
 
 
954 aa  158  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  29.68 
 
 
943 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  27.43 
 
 
449 aa  158  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  28.54 
 
 
767 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0928  M16 family peptidase  29.63 
 
 
478 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  28.19 
 
 
439 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0110  peptidase M16 domain protein  33.09 
 
 
520 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.282099  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1597  peptidase M16 domain-containing protein  29.57 
 
 
466 aa  154  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832035  normal  0.315453 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3615  peptidase M16 domain protein  27.57 
 
 
421 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785014 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0121  peptidase M16 domain protein  32.85 
 
 
520 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0262  peptidase M16 domain-containing protein  25.75 
 
 
480 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000120782  normal  0.152415 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  23.43 
 
 
483 aa  151  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>