More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1391 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  72.77 
 
 		 462 aa  669    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  100 
 
 		 456 aa  923    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  74.49 
 
 		 462 aa  686    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  73.13 
 
 		 465 aa  658    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  70.31 
 
 		 477 aa  660    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  73.9 
 
 		 460 aa  649    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  69.11 
 
 		 464 aa  630  1e-179  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  49.43 
 
 		 457 aa  419  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2864  peptidase M16 domain protein  50.24 
 
 		 435 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0431623 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1010  peptidase M16 domain-containing protein  49.17 
 
 		 426 aa  401  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.346738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  44.94 
 
 		 464 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  44.63 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  46.48 
 
 		 451 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1802  peptidase M16 domain-containing protein  47.37 
 
 		 431 aa  356  5e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2284  peptidase M16 domain protein  44.52 
 
 		 427 aa  347  3e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.538642 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2329  peptidase M16 domain-containing protein  44.86 
 
 		 427 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.504761  normal  0.793459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2606  peptidase M16 domain protein  44.86 
 
 		 427 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2216  peptidase M16 domain-containing protein  44.44 
 
 		 433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.384434  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0395  peptidase M16 domain protein  44.93 
 
 		 437 aa  335  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412071  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  42.21 
 
 		 447 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4179  peptidase M16 domain-containing protein  43.68 
 
 		 430 aa  319  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  39.09 
 
 		 457 aa  306  3e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  41.61 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  43.44 
 
 		 435 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  40.62 
 
 		 437 aa  298  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  38.89 
 
 		 444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1096  putative zinc protease  40.98 
 
 		 435 aa  276  6e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0917813  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2759  peptidase M16 domain-containing protein  41.43 
 
 		 435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0200  peptidase M16 domain protein  37.68 
 
 		 412 aa  264  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0431  peptidase M16-like  37.14 
 
 		 451 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7811  putative Zn-dependent protease  35.87 
 
 		 439 aa  239  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101927  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  32.78 
 
 		 441 aa  216  8e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  33.89 
 
 		 429 aa  207  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  33.09 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  31.4 
 
 		 438 aa  201  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  29.55 
 
 		 444 aa  199  7.999999999999999e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0913  M16 family peptidase  29.21 
 
 		 448 aa  199  9e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.226021  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  31.8 
 
 		 446 aa  194  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3518  peptidase M16 domain-containing protein  32.84 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  31.49 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1058  M16 family peptidase  26.86 
 
 		 451 aa  190  4e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  29.67 
 
 		 434 aa  189  9e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  31.31 
 
 		 435 aa  189  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1280  peptidase M16-like  31.71 
 
 		 461 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0850  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  25.51 
 
 		 451 aa  186  6e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.669926  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2841  peptidase M16 domain protein  32.62 
 
 		 460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279982  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  31.72 
 
 		 494 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  32.12 
 
 		 496 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4763  peptidase M16 domain-containing protein  30.18 
 
 		 448 aa  182  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  30.99 
 
 		 497 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1670  peptidase M16-like  31.4 
 
 		 471 aa  180  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2657  peptidase M16 domain-containing protein  31.81 
 
 		 481 aa  179  8e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  29.58 
 
 		 495 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  28.71 
 
 		 495 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  32.12 
 
 		 496 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0172  peptidase M16 domain protein  29.68 
 
 		 441 aa  176  9e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  32.36 
 
 		 496 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3871  peptidase M16 domain-containing protein  32.71 
 
 		 453 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  29.78 
 
 		 496 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  28.57 
 
 		 495 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3618  peptidase M16 domain protein  32.89 
 
 		 467 aa  171  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0762  M16 family peptidase putative  26.63 
 
 		 439 aa  170  5e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.655264  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  30.02 
 
 		 494 aa  170  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0893  peptidase M16 domain-containing protein  30.48 
 
 		 451 aa  168  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0504062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  29.64 
 
 		 439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  28.91 
 
 		 479 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3492  peptidase M16 domain-containing protein  29.05 
 
 		 477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  27.43 
 
 		 434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1783  peptidase M16 domain-containing protein  27.87 
 
 		 504 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  27.43 
 
 		 434 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  27 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2273  peptidase M16 domain-containing protein  31.6 
 
 		 438 aa  163  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.359911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1926  peptidase M16 domain-containing protein  28.03 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  29.07 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3939  DNA-directed RNA polymerase  28.38 
 
 		 487 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1631  peptidase M16 domain protein  29.43 
 
 		 445 aa  160  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.368966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3741  peptidase M16 domain-containing protein  28.22 
 
 		 486 aa  161  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3814  peptidase M16 domain-containing protein  28.16 
 
 		 487 aa  160  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4255  peptidase M16 domain-containing protein  27.83 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4372  peptidase M16 domain protein  30.97 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0210  peptidase M16 domain protein  27.78 
 
 		 497 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.481547 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4371  peptidase M16-like  28 
 
 		 512 aa  157  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.325226 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0218  non-proteolytic protein, peptidase family M16  27.07 
 
 		 443 aa  157  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2106  M16 family peptidase  27.07 
 
 		 443 aa  156  6e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0243  peptidase M16 domain protein  28.84 
 
 		 450 aa  156  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0208  peptidase M16 domain-containing protein  27.6 
 
 		 487 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  27.83 
 
 		 439 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2345  peptidase M16 domain protein  27.71 
 
 		 490 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.854323 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4129  peptidase M16 domain-containing protein  27.38 
 
 		 492 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  27.15 
 
 		 482 aa  155  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  27.83 
 
 		 439 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0388  putative Zinc protease-like signal peptide protein  29.86 
 
 		 447 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0931  insulinase-like peptidase  28.07 
 
 		 528 aa  154  4e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0647883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0738  peptidase M16 domain-containing protein  27.83 
 
 		 506 aa  153  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  27.59 
 
 		 439 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1483  peptidase M16-like  27.66 
 
 		 515 aa  152  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0660842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0283  peptidase M16-like protein  27.1 
 
 		 454 aa  152  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0571104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0621  peptidase M16-like  27 
 
 		 725 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3485  peptidase M16-like protein  27.62 
 
 		 502 aa  150  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.320343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0028  peptidase M16 domain protein  28.57 
 
 		 423 aa  150  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>