More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4248 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4248  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
426 aa  882    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5951  peptidase M16 domain protein  54.73 
 
 
426 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3239  zinc protease  39.86 
 
 
427 aa  341  2e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00842119  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0534  hypothetical protein  37.12 
 
 
422 aa  276  6e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1590  peptidase M16 domain protein  35.13 
 
 
424 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.508475  normal  0.157035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0705  peptidase M16 domain protein  36.68 
 
 
427 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0109  peptidase M16 domain protein  30.44 
 
 
456 aa  182  8.000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0082  peptidase M16 domain-containing protein  30.26 
 
 
477 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.281002 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02700  putative metallopeptidase, M16 family protein  28.71 
 
 
687 aa  166  6.9999999999999995e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  26.81 
 
 
943 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  26.5 
 
 
921 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0121  peptidase M16 domain protein  26.93 
 
 
520 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  28.54 
 
 
435 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0103  peptidase M16-like  26.46 
 
 
519 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.968685  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  26.99 
 
 
479 aa  144  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0110  peptidase M16 domain protein  26.7 
 
 
520 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.282099  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  26.32 
 
 
967 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2759  peptidase M16 domain-containing protein  27.18 
 
 
435 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482454  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1096  putative zinc protease  27.18 
 
 
435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0917813  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  27.4 
 
 
449 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1543  peptidase M16 domain-containing protein  26.14 
 
 
682 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  25.93 
 
 
945 aa  137  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3814  peptidase M16 domain-containing protein  25.23 
 
 
487 aa  136  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  26.78 
 
 
446 aa  136  9e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3939  DNA-directed RNA polymerase  25.23 
 
 
487 aa  135  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3741  peptidase M16 domain-containing protein  25.23 
 
 
486 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  26.32 
 
 
767 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0932  peptidase M16 domain-containing protein  28.4 
 
 
455 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513926  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0928  M16 family peptidase  25.48 
 
 
478 aa  133  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3492  peptidase M16 domain-containing protein  24.77 
 
 
477 aa  133  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2774  peptidase M16-like  26.23 
 
 
494 aa  133  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171699  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3443  peptidase M16-like protein  24.76 
 
 
473 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4129  peptidase M16 domain-containing protein  24.77 
 
 
492 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0208  peptidase M16 domain-containing protein  24.77 
 
 
487 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4255  peptidase M16 domain-containing protein  24.77 
 
 
492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0261  peptidase M16 domain-containing protein  26.27 
 
 
481 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0210  peptidase M16 domain protein  24.53 
 
 
497 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.481547 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  25.12 
 
 
945 aa  131  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  25.35 
 
 
944 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0388  putative Zinc protease-like signal peptide protein  26.45 
 
 
447 aa  130  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886206  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  25.57 
 
 
954 aa  130  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  27.13 
 
 
947 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  24.94 
 
 
434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4371  peptidase M16-like  24.35 
 
 
512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.325226 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  24.94 
 
 
952 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  24.94 
 
 
434 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  24.05 
 
 
483 aa  127  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0243  peptidase M16 domain protein  24.88 
 
 
450 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  24.4 
 
 
474 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1776  peptidase M16 domain-containing protein  25.24 
 
 
438 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  30 
 
 
439 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4372  peptidase M16 domain protein  26.09 
 
 
448 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  25.23 
 
 
945 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2345  peptidase M16 domain protein  23.46 
 
 
490 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.854323 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  25.44 
 
 
450 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0738  peptidase M16 domain-containing protein  24.41 
 
 
506 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  26.09 
 
 
439 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  25.74 
 
 
437 aa  125  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1280  peptidase M16-like  26.68 
 
 
461 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  24.04 
 
 
471 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  24.47 
 
 
476 aa  124  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  26.09 
 
 
429 aa  123  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0218  non-proteolytic protein, peptidase family M16  25.62 
 
 
443 aa  123  6e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  26.44 
 
 
949 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  26.44 
 
 
929 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  25.58 
 
 
944 aa  123  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1670  peptidase M16-like  26.86 
 
 
471 aa  123  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2106  M16 family peptidase  25.62 
 
 
443 aa  123  8e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  25.85 
 
 
439 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  24.83 
 
 
960 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  26.58 
 
 
486 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  24.13 
 
 
959 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  26.39 
 
 
944 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  26.17 
 
 
495 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  25.6 
 
 
439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  25.67 
 
 
462 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3485  peptidase M16-like protein  23.92 
 
 
502 aa  121  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.320343  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3518  peptidase M16 domain-containing protein  26.8 
 
 
460 aa  121  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  23.93 
 
 
495 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  23.32 
 
 
434 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  24.59 
 
 
465 aa  120  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  25.52 
 
 
943 aa  120  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  25.12 
 
 
950 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  25.12 
 
 
944 aa  120  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  25.12 
 
 
950 aa  120  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  25.43 
 
 
462 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  23.61 
 
 
482 aa  119  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2841  peptidase M16 domain protein  26.02 
 
 
460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279982  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  24.5 
 
 
436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  25.43 
 
 
495 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  24.27 
 
 
954 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  25.37 
 
 
497 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3795  peptidase M16-like  26.16 
 
 
448 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.417189  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  24.83 
 
 
949 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  25.76 
 
 
494 aa  117  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  25.06 
 
 
974 aa  117  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0621  peptidase M16-like  22.52 
 
 
725 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  24.88 
 
 
950 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  24.49 
 
 
962 aa  116  8.999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1347  peptidase M16 domain protein  27 
 
 
426 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>