More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1096 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1096  putative zinc protease  100 
 
 
435 aa  867    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0917813  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  88.28 
 
 
435 aa  771    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2759  peptidase M16 domain-containing protein  99.54 
 
 
435 aa  864    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482454  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  63.74 
 
 
457 aa  554  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  64 
 
 
437 aa  537  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  56 
 
 
444 aa  463  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  55.76 
 
 
437 aa  456  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  45.84 
 
 
464 aa  360  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  45.87 
 
 
454 aa  356  3.9999999999999996e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  45.15 
 
 
451 aa  346  4e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  42 
 
 
457 aa  316  5e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1010  peptidase M16 domain-containing protein  42.34 
 
 
426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.346738  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  41.36 
 
 
447 aa  301  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2864  peptidase M16 domain protein  40.29 
 
 
435 aa  301  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0431623 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  40.64 
 
 
465 aa  301  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  41.02 
 
 
460 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  39.81 
 
 
477 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  41.43 
 
 
456 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2284  peptidase M16 domain protein  41.83 
 
 
427 aa  293  5e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.538642 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  40.34 
 
 
464 aa  292  9e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  40.71 
 
 
462 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2606  peptidase M16 domain protein  41.34 
 
 
427 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  40.24 
 
 
462 aa  289  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2329  peptidase M16 domain-containing protein  41.09 
 
 
427 aa  288  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.504761  normal  0.793459 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1802  peptidase M16 domain-containing protein  41.91 
 
 
431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2216  peptidase M16 domain-containing protein  43.17 
 
 
433 aa  280  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.384434  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0395  peptidase M16 domain protein  42.41 
 
 
437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4179  peptidase M16 domain-containing protein  41.88 
 
 
430 aa  264  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7811  putative Zn-dependent protease  34.78 
 
 
439 aa  233  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101927  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0431  peptidase M16-like  37 
 
 
451 aa  226  7e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0200  peptidase M16 domain protein  35.05 
 
 
412 aa  222  8e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  34.22 
 
 
429 aa  219  7e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  33.41 
 
 
441 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  31.71 
 
 
434 aa  212  9e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  33.89 
 
 
495 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0762  M16 family peptidase putative  28.81 
 
 
439 aa  210  3e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.655264  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  33.89 
 
 
438 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  33.41 
 
 
495 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  33.02 
 
 
435 aa  207  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1058  M16 family peptidase  28.6 
 
 
451 aa  206  6e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  32.43 
 
 
434 aa  204  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  32.43 
 
 
434 aa  203  4e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  30.66 
 
 
444 aa  202  7e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  32.53 
 
 
494 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  33.73 
 
 
496 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  32.53 
 
 
486 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0893  peptidase M16 domain-containing protein  32.87 
 
 
451 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0504062  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  31.88 
 
 
496 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  30.84 
 
 
446 aa  194  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  30.68 
 
 
450 aa  194  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  32.29 
 
 
496 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  31.9 
 
 
497 aa  193  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  32.94 
 
 
494 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3618  peptidase M16 domain protein  33.58 
 
 
467 aa  190  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0388  putative Zinc protease-like signal peptide protein  31.59 
 
 
447 aa  189  8e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886206  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0850  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  26.38 
 
 
451 aa  189  1e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.669926  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  30.95 
 
 
496 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0243  peptidase M16 domain protein  29.98 
 
 
450 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1483  peptidase M16-like  29.27 
 
 
515 aa  186  5e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0660842  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0931  insulinase-like peptidase  29.65 
 
 
528 aa  186  7e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0647883  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2841  peptidase M16 domain protein  31.91 
 
 
460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3518  peptidase M16 domain-containing protein  31.69 
 
 
460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  32.86 
 
 
453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1280  peptidase M16-like  31.52 
 
 
461 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  30 
 
 
495 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  29.86 
 
 
436 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  30.07 
 
 
437 aa  180  4e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1926  peptidase M16 domain-containing protein  28.9 
 
 
445 aa  178  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1670  peptidase M16-like  31.41 
 
 
471 aa  177  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0283  peptidase M16-like protein  30.71 
 
 
454 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0571104  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4763  peptidase M16 domain-containing protein  31.19 
 
 
448 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1783  peptidase M16 domain-containing protein  28.17 
 
 
504 aa  171  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1631  peptidase M16 domain protein  29.26 
 
 
445 aa  171  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.368966  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  29.43 
 
 
449 aa  171  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3492  peptidase M16 domain-containing protein  28.29 
 
 
477 aa  170  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3814  peptidase M16 domain-containing protein  28.54 
 
 
487 aa  170  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0913  M16 family peptidase  28.33 
 
 
448 aa  169  7e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.226021  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3939  DNA-directed RNA polymerase  28.54 
 
 
487 aa  169  9e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3741  peptidase M16 domain-containing protein  28.29 
 
 
486 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  28.18 
 
 
479 aa  168  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0210  peptidase M16 domain protein  28.54 
 
 
497 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.481547 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4129  peptidase M16 domain-containing protein  28.64 
 
 
492 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0208  peptidase M16 domain-containing protein  28.64 
 
 
487 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0336  peptidase M16, C-terminal  30.81 
 
 
453 aa  166  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.469062  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4255  peptidase M16 domain-containing protein  28.4 
 
 
492 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3947  peptidase M16 domain-containing protein  26.73 
 
 
481 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3485  peptidase M16-like protein  27.75 
 
 
502 aa  163  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.320343  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0218  non-proteolytic protein, peptidase family M16  27.21 
 
 
443 aa  163  7e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2106  M16 family peptidase  27.21 
 
 
443 aa  162  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  25.35 
 
 
483 aa  162  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3443  peptidase M16-like protein  28.14 
 
 
473 aa  161  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  26.33 
 
 
482 aa  160  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  29.1 
 
 
943 aa  159  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3871  peptidase M16 domain-containing protein  30.31 
 
 
453 aa  159  7e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  28.3 
 
 
495 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0172  peptidase M16 domain protein  31 
 
 
441 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  29.16 
 
 
439 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  27.83 
 
 
495 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  28.37 
 
 
471 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  28.95 
 
 
476 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>