More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4177 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  72.95 
 
 		 496 aa  659    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  63.73 
 
 		 497 aa  648    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  66.26 
 
 		 496 aa  658    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  73.39 
 
 		 496 aa  661    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  71.66 
 
 		 495 aa  709    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 		 486 aa  976    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  69.78 
 
 		 494 aa  642    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  71.19 
 
 		 494 aa  693    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  73.17 
 
 		 496 aa  674    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  69.82 
 
 		 495 aa  691    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  70.43 
 
 		 495 aa  688    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  42.12 
 
 		 434 aa  349  6e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  43.77 
 
 		 438 aa  344  2e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  42.82 
 
 		 446 aa  332  6e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  42.23 
 
 		 441 aa  326  7e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  40.68 
 
 		 436 aa  319  9e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0218  non-proteolytic protein, peptidase family M16  40.68 
 
 		 443 aa  318  1e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2106  M16 family peptidase  40.68 
 
 		 443 aa  318  1e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  38.94 
 
 		 434 aa  317  3e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  38.94 
 
 		 434 aa  315  8e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  41.77 
 
 		 429 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  40.73 
 
 		 437 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0172  peptidase M16 domain protein  38.39 
 
 		 441 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  39.52 
 
 		 435 aa  306  6e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0931  insulinase-like peptidase  38.93 
 
 		 528 aa  302  9e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0647883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2657  peptidase M16 domain-containing protein  41.81 
 
 		 481 aa  295  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235444 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1483  peptidase M16-like  37.81 
 
 		 515 aa  294  3e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0660842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1783  peptidase M16 domain-containing protein  38.35 
 
 		 504 aa  291  2e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  40.19 
 
 		 450 aa  283  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3618  peptidase M16 domain protein  40.61 
 
 		 467 aa  280  4e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0243  peptidase M16 domain protein  39.33 
 
 		 450 aa  277  4e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0283  peptidase M16-like protein  38.94 
 
 		 454 aa  276  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0571104  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0388  putative Zinc protease-like signal peptide protein  39.05 
 
 		 447 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1280  peptidase M16-like  37.15 
 
 		 461 aa  259  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1670  peptidase M16-like  36.95 
 
 		 471 aa  258  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0893  peptidase M16 domain-containing protein  37.06 
 
 		 451 aa  258  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0504062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4372  peptidase M16 domain protein  37.44 
 
 		 448 aa  256  7e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  37.97 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2841  peptidase M16 domain protein  36.72 
 
 		 460 aa  251  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279982  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4989  peptidase M16 domain-containing protein  36.1 
 
 		 456 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3518  peptidase M16 domain-containing protein  37.18 
 
 		 460 aa  249  6e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0336  peptidase M16, C-terminal  36.06 
 
 		 453 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.469062  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4763  peptidase M16 domain-containing protein  36.43 
 
 		 448 aa  248  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5116  peptidase M16 domain protein  36.34 
 
 		 456 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2307  peptidase M16 domain-containing protein  34.77 
 
 		 451 aa  242  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3871  peptidase M16 domain-containing protein  36.64 
 
 		 453 aa  239  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  34.23 
 
 		 451 aa  233  8.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0349  peptidase M16 domain-containing protein  35.55 
 
 		 464 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5166  peptidase M16 domain-containing protein  34.78 
 
 		 457 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  31.88 
 
 		 454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1631  peptidase M16 domain protein  32.63 
 
 		 445 aa  217  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.368966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1926  peptidase M16 domain-containing protein  31.9 
 
 		 445 aa  212  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  32.47 
 
 		 444 aa  206  6e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  33.25 
 
 		 435 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  32.02 
 
 		 457 aa  205  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  33.09 
 
 		 456 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  31.39 
 
 		 460 aa  197  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2759  peptidase M16 domain-containing protein  32.85 
 
 		 435 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1096  putative zinc protease  32.85 
 
 		 435 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0917813  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  32.03 
 
 		 462 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  31.57 
 
 		 462 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  31.48 
 
 		 457 aa  194  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  30.43 
 
 		 464 aa  193  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  32.93 
 
 		 437 aa  192  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  31.41 
 
 		 465 aa  189  8e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  30.99 
 
 		 464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  31.26 
 
 		 767 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  29.72 
 
 		 444 aa  184  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  30.36 
 
 		 477 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  31.48 
 
 		 439 aa  183  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  30.83 
 
 		 439 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  30.58 
 
 		 439 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  32.03 
 
 		 447 aa  178  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  29.5 
 
 		 896 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  29.4 
 
 		 437 aa  171  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  29.54 
 
 		 439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1802  peptidase M16 domain-containing protein  29.3 
 
 		 431 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  29.13 
 
 		 476 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  28.64 
 
 		 945 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3492  peptidase M16 domain-containing protein  28.73 
 
 		 477 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  31.87 
 
 		 954 aa  163  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3443  peptidase M16-like protein  29.41 
 
 		 473 aa  161  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  31.36 
 
 		 471 aa  161  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2216  peptidase M16 domain-containing protein  30.16 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.384434  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0210  peptidase M16 domain protein  27.41 
 
 		 497 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.481547 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4255  peptidase M16 domain-containing protein  27.89 
 
 		 492 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  30.67 
 
 		 918 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4129  peptidase M16 domain-containing protein  27.41 
 
 		 492 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3939  DNA-directed RNA polymerase  28.35 
 
 		 487 aa  160  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0208  peptidase M16 domain-containing protein  27.41 
 
 		 487 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0928  M16 family peptidase  30.67 
 
 		 478 aa  159  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3814  peptidase M16 domain-containing protein  28.79 
 
 		 487 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  28.26 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3741  peptidase M16 domain-containing protein  27.27 
 
 		 486 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2606  peptidase M16 domain protein  29.16 
 
 		 427 aa  156  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0395  peptidase M16 domain protein  29.19 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412071  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2284  peptidase M16 domain protein  29.77 
 
 		 427 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.538642 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2864  peptidase M16 domain protein  27.59 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0431623 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2329  peptidase M16 domain-containing protein  28.9 
 
 		 427 aa  154  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.504761  normal  0.793459 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  26.11 
 
 		 483 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>