More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4986 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  99.4 
 
 		 496 aa  996    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  90.96 
 
 		 494 aa  909    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 		 496 aa  999    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  71.29 
 
 		 497 aa  721    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  72.29 
 
 		 496 aa  725    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  69.68 
 
 		 495 aa  678    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  75.2 
 
 		 495 aa  769    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  69.98 
 
 		 494 aa  641    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  96.98 
 
 		 496 aa  926    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  70.71 
 
 		 486 aa  682    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  70.48 
 
 		 495 aa  685    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  42.82 
 
 		 434 aa  359  6e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  42.51 
 
 		 438 aa  345  1e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2106  M16 family peptidase  42.65 
 
 		 443 aa  343  4e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0218  non-proteolytic protein, peptidase family M16  42.65 
 
 		 443 aa  343  5e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  43.28 
 
 		 446 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  43.87 
 
 		 429 aa  334  3e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  41.91 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  39.9 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  39.9 
 
 		 434 aa  323  5e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  42.21 
 
 		 436 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  40 
 
 		 435 aa  315  9e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  41.61 
 
 		 437 aa  315  9.999999999999999e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0172  peptidase M16 domain protein  38.88 
 
 		 441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2657  peptidase M16 domain-containing protein  41.08 
 
 		 481 aa  288  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235444 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1280  peptidase M16-like  38.66 
 
 		 461 aa  281  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3618  peptidase M16 domain protein  40.69 
 
 		 467 aa  279  8e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0931  insulinase-like peptidase  35.64 
 
 		 528 aa  278  2e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0647883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1783  peptidase M16 domain-containing protein  34.5 
 
 		 504 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1483  peptidase M16-like  35.51 
 
 		 515 aa  272  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0660842  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0388  putative Zinc protease-like signal peptide protein  39.01 
 
 		 447 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0893  peptidase M16 domain-containing protein  37.47 
 
 		 451 aa  266  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0504062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0243  peptidase M16 domain protein  38.61 
 
 		 450 aa  266  7e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0283  peptidase M16-like protein  38.85 
 
 		 454 aa  265  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0571104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  38.13 
 
 		 450 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1670  peptidase M16-like  35.48 
 
 		 471 aa  261  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4372  peptidase M16 domain protein  37.35 
 
 		 448 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2307  peptidase M16 domain-containing protein  36.32 
 
 		 451 aa  254  3e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4989  peptidase M16 domain-containing protein  36.52 
 
 		 456 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2841  peptidase M16 domain protein  36.64 
 
 		 460 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279982  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  35.73 
 
 		 453 aa  250  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3518  peptidase M16 domain-containing protein  36.73 
 
 		 460 aa  247  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5166  peptidase M16 domain-containing protein  36.53 
 
 		 457 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5116  peptidase M16 domain protein  36.99 
 
 		 456 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0336  peptidase M16, C-terminal  36.84 
 
 		 453 aa  240  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.469062  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3871  peptidase M16 domain-containing protein  36.24 
 
 		 453 aa  239  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4763  peptidase M16 domain-containing protein  34.43 
 
 		 448 aa  235  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1926  peptidase M16 domain-containing protein  33.73 
 
 		 445 aa  232  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1631  peptidase M16 domain protein  32.07 
 
 		 445 aa  223  9e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.368966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0349  peptidase M16 domain-containing protein  34.77 
 
 		 464 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  33.89 
 
 		 451 aa  213  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  32.78 
 
 		 444 aa  206  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2759  peptidase M16 domain-containing protein  33.73 
 
 		 435 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1096  putative zinc protease  33.73 
 
 		 435 aa  200  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0917813  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  31.16 
 
 		 457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  30.99 
 
 		 454 aa  197  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  29.21 
 
 		 444 aa  186  6e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  31.28 
 
 		 464 aa  186  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  31.89 
 
 		 465 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  32.12 
 
 		 456 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  31.98 
 
 		 435 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  30.79 
 
 		 457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  29.53 
 
 		 439 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  30.53 
 
 		 437 aa  177  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  28.95 
 
 		 439 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  31.5 
 
 		 464 aa  176  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  28.71 
 
 		 439 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  30.09 
 
 		 462 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  31.51 
 
 		 449 aa  174  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  30.32 
 
 		 447 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  29.47 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  29.57 
 
 		 462 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  27.91 
 
 		 896 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3443  peptidase M16-like protein  30.22 
 
 		 473 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  29.1 
 
 		 767 aa  168  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  29.25 
 
 		 477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  30.49 
 
 		 943 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3492  peptidase M16 domain-containing protein  29.36 
 
 		 477 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4255  peptidase M16 domain-containing protein  29.88 
 
 		 492 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  29.33 
 
 		 482 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3741  peptidase M16 domain-containing protein  29.43 
 
 		 486 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3814  peptidase M16 domain-containing protein  30 
 
 		 487 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3939  DNA-directed RNA polymerase  29.43 
 
 		 487 aa  161  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  27.67 
 
 		 439 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  29.36 
 
 		 437 aa  159  7e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4129  peptidase M16 domain-containing protein  29.63 
 
 		 492 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0208  peptidase M16 domain-containing protein  29.63 
 
 		 487 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0210  peptidase M16 domain protein  29.12 
 
 		 497 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.481547 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  28.97 
 
 		 954 aa  157  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  30.73 
 
 		 918 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2284  peptidase M16 domain protein  28.71 
 
 		 427 aa  156  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.538642 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1010  peptidase M16 domain-containing protein  27.88 
 
 		 426 aa  154  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.346738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2216  peptidase M16 domain-containing protein  29.95 
 
 		 433 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.384434  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1802  peptidase M16 domain-containing protein  28.26 
 
 		 431 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3485  peptidase M16-like protein  27.79 
 
 		 502 aa  151  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.320343  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  26.04 
 
 		 483 aa  149  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0121  peptidase M16 domain protein  29.85 
 
 		 520 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2606  peptidase M16 domain protein  27.36 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2329  peptidase M16 domain-containing protein  27.36 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.504761  normal  0.793459 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  27.16 
 
 		 476 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>