More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4857 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  100 
 
 		 477 aa  969    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  83.75 
 
 		 462 aa  759    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  70.57 
 
 		 456 aa  641    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  69.48 
 
 		 460 aa  639    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  84.28 
 
 		 462 aa  765    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  68.72 
 
 		 465 aa  625  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  66.82 
 
 		 464 aa  608  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2864  peptidase M16 domain protein  46.72 
 
 		 435 aa  392  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0431623 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  45.1 
 
 		 464 aa  386  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  46.51 
 
 		 457 aa  386  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1010  peptidase M16 domain-containing protein  45.15 
 
 		 426 aa  376  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.346738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  44.71 
 
 		 451 aa  361  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  42.79 
 
 		 454 aa  353  5e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1802  peptidase M16 domain-containing protein  44.2 
 
 		 431 aa  348  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2606  peptidase M16 domain protein  44.25 
 
 		 427 aa  345  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2284  peptidase M16 domain protein  44.5 
 
 		 427 aa  345  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.538642 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2329  peptidase M16 domain-containing protein  44.25 
 
 		 427 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.504761  normal  0.793459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2216  peptidase M16 domain-containing protein  43.9 
 
 		 433 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.384434  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0395  peptidase M16 domain protein  42.89 
 
 		 437 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4179  peptidase M16 domain-containing protein  42.21 
 
 		 430 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  39.47 
 
 		 447 aa  307  3e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  40.62 
 
 		 437 aa  306  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  37.27 
 
 		 457 aa  294  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  37.67 
 
 		 437 aa  289  8e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  39.49 
 
 		 435 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1096  putative zinc protease  39.76 
 
 		 435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0917813  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2759  peptidase M16 domain-containing protein  39.52 
 
 		 435 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0200  peptidase M16 domain protein  37.44 
 
 		 412 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  36.81 
 
 		 444 aa  266  7e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0431  peptidase M16-like  36.28 
 
 		 451 aa  252  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7811  putative Zn-dependent protease  33.33 
 
 		 439 aa  219  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101927  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  32.28 
 
 		 441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  32.78 
 
 		 438 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  28.57 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  31.91 
 
 		 434 aa  203  5e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  31.89 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  31.29 
 
 		 435 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1058  M16 family peptidase  27.75 
 
 		 451 aa  196  1e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4763  peptidase M16 domain-containing protein  30.43 
 
 		 448 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3518  peptidase M16 domain-containing protein  31.93 
 
 		 460 aa  193  7e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0172  peptidase M16 domain protein  30.28 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0850  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  27.91 
 
 		 451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.669926  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  30.39 
 
 		 446 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1670  peptidase M16-like  30.72 
 
 		 471 aa  188  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  30.66 
 
 		 429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2841  peptidase M16 domain protein  31.7 
 
 		 460 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279982  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0913  M16 family peptidase  28.43 
 
 		 448 aa  185  2.0000000000000003e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.226021  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  30.66 
 
 		 495 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  30.36 
 
 		 486 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1280  peptidase M16-like  29.8 
 
 		 461 aa  183  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0762  M16 family peptidase putative  26.45 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.655264  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  30.8 
 
 		 494 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3871  peptidase M16 domain-containing protein  31.74 
 
 		 453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  29.49 
 
 		 495 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  30.59 
 
 		 494 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  28.11 
 
 		 434 aa  174  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  29.16 
 
 		 497 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  27.88 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0893  peptidase M16 domain-containing protein  29.69 
 
 		 451 aa  172  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0504062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  29 
 
 		 496 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  28.78 
 
 		 436 aa  171  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4371  peptidase M16-like  27.53 
 
 		 512 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.325226 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  29.25 
 
 		 496 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  28.64 
 
 		 479 aa  167  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  27.42 
 
 		 437 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  27.91 
 
 		 495 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0738  peptidase M16 domain-containing protein  27.71 
 
 		 506 aa  165  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  29.49 
 
 		 496 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  29.03 
 
 		 496 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3618  peptidase M16 domain protein  31.24 
 
 		 467 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2345  peptidase M16 domain protein  26.67 
 
 		 490 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.854323 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2657  peptidase M16 domain-containing protein  28.81 
 
 		 481 aa  163  8.000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235444 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0218  non-proteolytic protein, peptidase family M16  27.75 
 
 		 443 aa  162  9e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2106  M16 family peptidase  27.75 
 
 		 443 aa  162  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1926  peptidase M16 domain-containing protein  26.84 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  28.34 
 
 		 450 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1631  peptidase M16 domain protein  27.23 
 
 		 445 aa  160  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.368966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2307  peptidase M16 domain-containing protein  28.05 
 
 		 451 aa  159  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  28.33 
 
 		 952 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0621  peptidase M16-like  27.02 
 
 		 725 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  27.88 
 
 		 495 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  27.27 
 
 		 495 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2273  peptidase M16 domain-containing protein  28.51 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.359911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0243  peptidase M16 domain protein  28.1 
 
 		 450 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  27.81 
 
 		 476 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4372  peptidase M16 domain protein  28.71 
 
 		 448 aa  154  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1783  peptidase M16 domain-containing protein  28 
 
 		 504 aa  153  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  29.48 
 
 		 471 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0931  insulinase-like peptidase  27.51 
 
 		 528 aa  152  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0647883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0405  peptidase M16-like  26.98 
 
 		 427 aa  150  4e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2752  peptidase M16 domain protein  26.05 
 
 		 494 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0658  peptidase M16 domain protein  26.15 
 
 		 490 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  28.57 
 
 		 439 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  29.25 
 
 		 439 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3667  peptidase M16 domain protein  26.96 
 
 		 424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0678  peptidase M16 domain protein  25.92 
 
 		 490 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3741  peptidase M16 domain-containing protein  26.82 
 
 		 486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3939  DNA-directed RNA polymerase  26.55 
 
 		 487 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4255  peptidase M16 domain-containing protein  26.81 
 
 		 492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  25.95 
 
 		 449 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.869446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>