More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2546 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  73.24 
 
 
460 aa  641    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  100 
 
 
464 aa  942    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  70.28 
 
 
462 aa  653    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  70.55 
 
 
462 aa  663    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  86.56 
 
 
465 aa  788    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  66 
 
 
477 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  70.33 
 
 
456 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  51.49 
 
 
457 aa  421  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1010  peptidase M16 domain-containing protein  50.36 
 
 
426 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.346738  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2864  peptidase M16 domain protein  47.2 
 
 
435 aa  382  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0431623 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  43.02 
 
 
464 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  45.84 
 
 
454 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  45.5 
 
 
451 aa  372  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1802  peptidase M16 domain-containing protein  46.91 
 
 
431 aa  351  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2284  peptidase M16 domain protein  45.16 
 
 
427 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.538642 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2216  peptidase M16 domain-containing protein  46.19 
 
 
433 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.384434  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2329  peptidase M16 domain-containing protein  44.17 
 
 
427 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.504761  normal  0.793459 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0395  peptidase M16 domain protein  45.56 
 
 
437 aa  339  7e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412071  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2606  peptidase M16 domain protein  44.17 
 
 
427 aa  338  8e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4179  peptidase M16 domain-containing protein  44.76 
 
 
430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  42.37 
 
 
447 aa  323  5e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  40 
 
 
457 aa  322  7e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  42.55 
 
 
437 aa  317  4e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  41.01 
 
 
437 aa  309  5.9999999999999995e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  41.28 
 
 
435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  39.91 
 
 
444 aa  300  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1096  putative zinc protease  40.33 
 
 
435 aa  279  7e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0917813  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2759  peptidase M16 domain-containing protein  40.1 
 
 
435 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482454  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0200  peptidase M16 domain protein  38.92 
 
 
412 aa  268  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0431  peptidase M16-like  37.07 
 
 
451 aa  258  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7811  putative Zn-dependent protease  32.93 
 
 
439 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101927  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  33.41 
 
 
441 aa  218  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0850  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  28.05 
 
 
451 aa  212  1e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.669926  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1058  M16 family peptidase  27.7 
 
 
451 aa  207  3e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  31.26 
 
 
453 aa  206  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  32.04 
 
 
446 aa  205  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  31.9 
 
 
434 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  32.53 
 
 
429 aa  199  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  32.73 
 
 
496 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1280  peptidase M16-like  30.92 
 
 
461 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  31.42 
 
 
497 aa  193  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0913  M16 family peptidase  29.44 
 
 
448 aa  193  7e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.226021  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  31.06 
 
 
435 aa  192  8e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  30.05 
 
 
436 aa  192  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  30.77 
 
 
438 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3518  peptidase M16 domain-containing protein  31.36 
 
 
460 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2841  peptidase M16 domain protein  30.98 
 
 
460 aa  190  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279982  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4763  peptidase M16 domain-containing protein  29.82 
 
 
448 aa  190  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  31.14 
 
 
495 aa  190  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  30.77 
 
 
486 aa  186  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  29.98 
 
 
495 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  31.31 
 
 
494 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0893  peptidase M16 domain-containing protein  29.44 
 
 
451 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0504062  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  28.77 
 
 
434 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  28.77 
 
 
434 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0762  M16 family peptidase putative  26.81 
 
 
439 aa  181  2.9999999999999997e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.655264  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1670  peptidase M16-like  29.75 
 
 
471 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  27.79 
 
 
444 aa  179  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  31.8 
 
 
496 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  31.66 
 
 
496 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3618  peptidase M16 domain protein  32.4 
 
 
467 aa  179  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  29.77 
 
 
495 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  30.77 
 
 
494 aa  177  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  28.57 
 
 
450 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  31.11 
 
 
496 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4372  peptidase M16 domain protein  31.13 
 
 
448 aa  173  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1926  peptidase M16 domain-containing protein  27.42 
 
 
445 aa  172  7.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2273  peptidase M16 domain-containing protein  31.06 
 
 
438 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.359911  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3871  peptidase M16 domain-containing protein  30.63 
 
 
453 aa  171  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0243  peptidase M16 domain protein  28.9 
 
 
450 aa  169  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1631  peptidase M16 domain protein  26.84 
 
 
445 aa  169  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.368966  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0172  peptidase M16 domain protein  28.2 
 
 
441 aa  164  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2657  peptidase M16 domain-containing protein  28.5 
 
 
481 aa  163  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235444 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3741  peptidase M16 domain-containing protein  29.25 
 
 
486 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3939  DNA-directed RNA polymerase  28.77 
 
 
487 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  27.84 
 
 
437 aa  161  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0218  non-proteolytic protein, peptidase family M16  26.21 
 
 
443 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0210  peptidase M16 domain protein  28.2 
 
 
497 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.481547 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2106  M16 family peptidase  26.21 
 
 
443 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3492  peptidase M16 domain-containing protein  29.01 
 
 
477 aa  160  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0208  peptidase M16 domain-containing protein  28.64 
 
 
487 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3814  peptidase M16 domain-containing protein  29.01 
 
 
487 aa  159  8e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4255  peptidase M16 domain-containing protein  28.41 
 
 
492 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4129  peptidase M16 domain-containing protein  28.41 
 
 
492 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0283  peptidase M16-like protein  27.71 
 
 
454 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0571104  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  29.77 
 
 
439 aa  157  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0405  peptidase M16-like  27.51 
 
 
427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0388  putative Zinc protease-like signal peptide protein  27.68 
 
 
447 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886206  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  28.81 
 
 
479 aa  152  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  28.26 
 
 
439 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1783  peptidase M16 domain-containing protein  27.87 
 
 
504 aa  152  8.999999999999999e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3485  peptidase M16-like protein  27.33 
 
 
502 aa  152  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.320343  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  29.17 
 
 
954 aa  150  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0621  peptidase M16-like  26.93 
 
 
725 aa  149  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  27.34 
 
 
439 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0931  insulinase-like peptidase  27.99 
 
 
528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0647883  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  27.09 
 
 
439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  26.82 
 
 
482 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0336  peptidase M16, C-terminal  27.38 
 
 
453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.469062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  27.29 
 
 
476 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>