More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2273 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3546  peptidase M16 domain-containing protein  81.37 
 
 
436 aa  652    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.984037  normal  0.12163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2273  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
438 aa  885    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.359911  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  49.76 
 
 
876 aa  416  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  30.23 
 
 
896 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  29.93 
 
 
444 aa  190  5e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  30.12 
 
 
937 aa  189  5.999999999999999e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  31.07 
 
 
439 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  30.83 
 
 
439 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  30.58 
 
 
439 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  27.32 
 
 
945 aa  176  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  27.56 
 
 
767 aa  173  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0178  peptidase M16 domain protein  27.18 
 
 
421 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  30.17 
 
 
464 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  28.12 
 
 
451 aa  170  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  32.24 
 
 
465 aa  170  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  30.83 
 
 
460 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2329  peptidase M16 domain-containing protein  33.33 
 
 
427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.504761  normal  0.793459 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  31.13 
 
 
464 aa  166  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  28.57 
 
 
454 aa  166  8e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2284  peptidase M16 domain protein  33.08 
 
 
427 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.538642 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1347  peptidase M16 domain protein  34.22 
 
 
426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2606  peptidase M16 domain protein  33.08 
 
 
427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  29.81 
 
 
479 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  29.57 
 
 
439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2216  peptidase M16 domain-containing protein  32.61 
 
 
433 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.384434  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  30.96 
 
 
447 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  31.6 
 
 
456 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0678  peptidase M16 domain protein  27.59 
 
 
490 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  31.05 
 
 
462 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  29.4 
 
 
462 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4631  peptidase M16 domain-containing protein  29.26 
 
 
457 aa  160  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2345  peptidase M16 domain protein  27.76 
 
 
490 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.854323 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0658  peptidase M16 domain protein  27.36 
 
 
490 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0928  M16 family peptidase  29.95 
 
 
478 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0395  peptidase M16 domain protein  31.16 
 
 
437 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412071  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  28.5 
 
 
457 aa  159  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  29.19 
 
 
474 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4179  peptidase M16 domain-containing protein  31.86 
 
 
430 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0365  processing peptidase  27.34 
 
 
424 aa  157  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4236  processing peptidase  26.98 
 
 
421 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385925 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4197  peptidase M16 domain protein  26.98 
 
 
421 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1802  peptidase M16 domain-containing protein  31.5 
 
 
431 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  28.51 
 
 
477 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4310  peptidase M16-like  28.39 
 
 
427 aa  153  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914199  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  30.19 
 
 
457 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  25.9 
 
 
929 aa  152  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  27.29 
 
 
495 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  27.54 
 
 
495 aa  151  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  29.51 
 
 
437 aa  150  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2657  peptidase M16 domain-containing protein  31.87 
 
 
481 aa  150  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  29.68 
 
 
497 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2056  peptidase M16 domain protein  29.64 
 
 
413 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  28.05 
 
 
435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2774  peptidase M16-like  27.87 
 
 
494 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171699  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3485  peptidase M16-like protein  26.76 
 
 
502 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.320343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0028  peptidase M16 domain protein  28.68 
 
 
423 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  29.14 
 
 
496 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  27.05 
 
 
479 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4371  peptidase M16-like  27.27 
 
 
512 aa  146  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.325226 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0966  peptidase M16-like  27.14 
 
 
413 aa  146  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02700  putative metallopeptidase, M16 family protein  27.49 
 
 
687 aa  146  8.000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  30.4 
 
 
495 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  26.46 
 
 
969 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0621  peptidase M16-like  26.35 
 
 
725 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  27.64 
 
 
943 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0431  peptidase M16-like  29.34 
 
 
451 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  29.73 
 
 
437 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  27.94 
 
 
449 aa  144  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  26.33 
 
 
952 aa  143  7e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  26.95 
 
 
436 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1226  processing protease  29.16 
 
 
421 aa  140  4.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.203575 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0283  peptidase M16-like protein  29.31 
 
 
454 aa  140  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0571104  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  28.49 
 
 
486 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  29.07 
 
 
495 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  25.61 
 
 
434 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  24.94 
 
 
483 aa  138  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1839  processing peptidase  29.54 
 
 
432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  25.61 
 
 
434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1059  peptidase M16-like  28.23 
 
 
421 aa  137  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0076042  hitchhiker  0.00221195 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1706  peptidase M16 domain protein  24.7 
 
 
411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.425033  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  26.76 
 
 
450 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  27.67 
 
 
434 aa  137  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1163  processing peptidase  28.4 
 
 
413 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0385172  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0419  peptidase M16-like protein  25.3 
 
 
419 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  25.06 
 
 
947 aa  137  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0738  peptidase M16 domain-containing protein  26.68 
 
 
506 aa  136  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  24.7 
 
 
482 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  28.08 
 
 
429 aa  136  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  28.76 
 
 
494 aa  136  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3939  DNA-directed RNA polymerase  25.79 
 
 
487 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  28.49 
 
 
495 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  28.1 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0243  peptidase M16 domain protein  27.38 
 
 
450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  28.01 
 
 
441 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3443  peptidase M16-like protein  24.22 
 
 
473 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3947  peptidase M16 domain-containing protein  24.22 
 
 
481 aa  133  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3741  peptidase M16 domain-containing protein  25.3 
 
 
486 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2133  peptidase M16 domain protein  28.11 
 
 
436 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.765752 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  25.41 
 
 
954 aa  133  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5111  peptidase M16 domain-containing protein  29.32 
 
 
438 aa  132  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591794  normal  0.0978001 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>