More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0405 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0405  peptidase M16-like  100 
 
 
427 aa  854    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0851  peptidase M16 domain protein  50.23 
 
 
432 aa  431  1e-119  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000460101  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0631  processing protease  47.52 
 
 
407 aa  353  2.9999999999999997e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.721383  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1529  processing protease  46.31 
 
 
409 aa  350  2e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.658883  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1476  putative peptidase  42.54 
 
 
406 aa  332  8e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.285438  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0488  peptidase, putative  42.57 
 
 
406 aa  331  1e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1618  two-component response regulator family protein  44.23 
 
 
409 aa  330  3e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0513  peptidase, putative  42.33 
 
 
406 aa  325  1e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0687  peptidase, M16 family  42.32 
 
 
406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1028  processing protease  41.48 
 
 
410 aa  312  6.999999999999999e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.401858  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  27.51 
 
 
464 aa  155  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  27.35 
 
 
460 aa  153  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  27.35 
 
 
465 aa  153  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  26.98 
 
 
477 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  29.25 
 
 
444 aa  150  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  26.68 
 
 
462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  26.44 
 
 
462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2284  peptidase M16 domain protein  27.3 
 
 
427 aa  146  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.538642 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  27.84 
 
 
456 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2606  peptidase M16 domain protein  27.03 
 
 
427 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1802  peptidase M16 domain-containing protein  28.01 
 
 
431 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  28.53 
 
 
457 aa  139  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2329  peptidase M16 domain-containing protein  26.76 
 
 
427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.504761  normal  0.793459 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  27 
 
 
447 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  24.13 
 
 
457 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2864  peptidase M16 domain protein  23.38 
 
 
435 aa  131  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0431623 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  25.89 
 
 
437 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  26.55 
 
 
496 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  25.8 
 
 
435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  24.54 
 
 
438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  25.39 
 
 
494 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  26.07 
 
 
495 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  24.73 
 
 
437 aa  127  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  25.81 
 
 
495 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1010  peptidase M16 domain-containing protein  23.81 
 
 
426 aa  127  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.346738  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  25.77 
 
 
495 aa  126  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1926  peptidase M16 domain-containing protein  25.86 
 
 
445 aa  125  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1631  peptidase M16 domain protein  24.6 
 
 
445 aa  123  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.368966  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  26.88 
 
 
497 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1783  peptidase M16 domain-containing protein  25.5 
 
 
504 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  26.65 
 
 
464 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  27.35 
 
 
494 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2216  peptidase M16 domain-containing protein  26.65 
 
 
433 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.384434  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0172  peptidase M16 domain protein  21.92 
 
 
441 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1058  M16 family peptidase  24.62 
 
 
451 aa  119  7e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0200  peptidase M16 domain protein  22.73 
 
 
412 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0395  peptidase M16 domain protein  25.14 
 
 
437 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412071  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  25.82 
 
 
449 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  27.22 
 
 
434 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  29.12 
 
 
479 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  26.09 
 
 
451 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  22.02 
 
 
444 aa  117  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  25.51 
 
 
479 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2759  peptidase M16 domain-containing protein  24.65 
 
 
435 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482454  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  23.91 
 
 
441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0762  M16 family peptidase putative  25.82 
 
 
439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.655264  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  23.25 
 
 
434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  26.63 
 
 
496 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  26.65 
 
 
434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1096  putative zinc protease  24.65 
 
 
435 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0917813  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0336  peptidase M16, C-terminal  25.63 
 
 
453 aa  114  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.469062  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  25.77 
 
 
436 aa  113  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  24.23 
 
 
486 aa  113  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  26.33 
 
 
496 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3618  peptidase M16 domain protein  23.71 
 
 
467 aa  113  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0283  peptidase M16-like protein  24.07 
 
 
454 aa  112  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0571104  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  26.33 
 
 
496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  25.13 
 
 
429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2307  peptidase M16 domain-containing protein  22.45 
 
 
451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  23.66 
 
 
435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  26.8 
 
 
471 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  27.75 
 
 
439 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  28.1 
 
 
474 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  23.78 
 
 
446 aa  110  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4179  peptidase M16 domain-containing protein  25.21 
 
 
430 aa  110  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2657  peptidase M16 domain-containing protein  22.62 
 
 
481 aa  109  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7811  putative Zn-dependent protease  26.32 
 
 
439 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101927  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0218  non-proteolytic protein, peptidase family M16  24.93 
 
 
443 aa  108  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  24.27 
 
 
454 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1947  peptidase M16 domain-containing protein  26.17 
 
 
422 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141516  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0850  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  24.23 
 
 
451 aa  107  4e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.669926  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  24.14 
 
 
437 aa  107  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0913  M16 family peptidase  23.99 
 
 
448 aa  107  4e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.226021  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2106  M16 family peptidase  24.67 
 
 
443 aa  107  6e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3667  peptidase M16 domain protein  24.86 
 
 
424 aa  106  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  24.04 
 
 
453 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1483  peptidase M16-like  24.19 
 
 
515 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0660842  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1419  peptidase M16-like protein  24.01 
 
 
420 aa  104  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0503674  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  26.57 
 
 
954 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  25.51 
 
 
439 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0928  M16 family peptidase  26.65 
 
 
478 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  25.51 
 
 
439 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0931  insulinase-like peptidase  23.58 
 
 
528 aa  100  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0647883  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0893  peptidase M16 domain-containing protein  25 
 
 
451 aa  100  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0504062  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  23.42 
 
 
450 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4236  processing peptidase  25.64 
 
 
421 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385925 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  25.27 
 
 
495 aa  100  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4197  peptidase M16 domain protein  25.64 
 
 
421 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1670  peptidase M16-like  24.12 
 
 
471 aa  99  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  25.51 
 
 
439 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>