More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2986 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  100 
 
 
438 aa  880    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0172  peptidase M16 domain protein  51.26 
 
 
441 aa  430  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  49.07 
 
 
434 aa  426  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  51.21 
 
 
441 aa  424  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  48.03 
 
 
446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  47.65 
 
 
435 aa  393  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0218  non-proteolytic protein, peptidase family M16  41.28 
 
 
443 aa  354  2e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  41.38 
 
 
434 aa  354  2e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  41.13 
 
 
434 aa  354  2e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2106  M16 family peptidase  41.06 
 
 
443 aa  352  1e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  42.82 
 
 
437 aa  351  1e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  44.23 
 
 
429 aa  348  8e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  42.93 
 
 
495 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  42.65 
 
 
495 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  42.69 
 
 
495 aa  345  7e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  43.41 
 
 
486 aa  345  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  42.17 
 
 
496 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  41.69 
 
 
494 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  41.69 
 
 
496 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  41.93 
 
 
496 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  41.45 
 
 
497 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  42.34 
 
 
494 aa  333  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2657  peptidase M16 domain-containing protein  44.77 
 
 
481 aa  333  4e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235444 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0243  peptidase M16 domain protein  42.69 
 
 
450 aa  333  5e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1670  peptidase M16-like  42.63 
 
 
471 aa  332  6e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  41.03 
 
 
496 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  42.45 
 
 
450 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1280  peptidase M16-like  42.17 
 
 
461 aa  329  7e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  40.92 
 
 
436 aa  324  2e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3618  peptidase M16 domain protein  43.58 
 
 
467 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0388  putative Zinc protease-like signal peptide protein  40.77 
 
 
447 aa  317  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886206  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0283  peptidase M16-like protein  42.07 
 
 
454 aa  316  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0571104  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0893  peptidase M16 domain-containing protein  41.67 
 
 
451 aa  313  4.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0504062  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3518  peptidase M16 domain-containing protein  41.23 
 
 
460 aa  301  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2841  peptidase M16 domain protein  40.76 
 
 
460 aa  297  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279982  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  38.27 
 
 
453 aa  296  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0336  peptidase M16, C-terminal  39.76 
 
 
453 aa  296  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.469062  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2307  peptidase M16 domain-containing protein  40.49 
 
 
451 aa  293  3e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4372  peptidase M16 domain protein  41.33 
 
 
448 aa  293  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4763  peptidase M16 domain-containing protein  38.75 
 
 
448 aa  285  9e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1926  peptidase M16 domain-containing protein  35.79 
 
 
445 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3871  peptidase M16 domain-containing protein  39.86 
 
 
453 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0931  insulinase-like peptidase  36.36 
 
 
528 aa  276  7e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0647883  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1483  peptidase M16-like  36.12 
 
 
515 aa  273  6e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0660842  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1631  peptidase M16 domain protein  35.36 
 
 
445 aa  266  5.999999999999999e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.368966  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1783  peptidase M16 domain-containing protein  33.49 
 
 
504 aa  260  3e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  34.87 
 
 
447 aa  223  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  33.33 
 
 
464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  32.57 
 
 
477 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  31.94 
 
 
457 aa  207  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1096  putative zinc protease  33.89 
 
 
435 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0917813  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2759  peptidase M16 domain-containing protein  33.89 
 
 
435 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482454  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4989  peptidase M16 domain-containing protein  33.25 
 
 
456 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  28.27 
 
 
451 aa  202  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  32.09 
 
 
457 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  33.64 
 
 
437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  31.4 
 
 
456 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  33.57 
 
 
439 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  33.18 
 
 
435 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  29.76 
 
 
454 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5116  peptidase M16 domain protein  32.35 
 
 
456 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5166  peptidase M16 domain-containing protein  32.94 
 
 
457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2606  peptidase M16 domain protein  33.17 
 
 
427 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2284  peptidase M16 domain protein  33.57 
 
 
427 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.538642 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  30.62 
 
 
462 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2329  peptidase M16 domain-containing protein  32.94 
 
 
427 aa  195  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.504761  normal  0.793459 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  33.1 
 
 
439 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  30.09 
 
 
449 aa  192  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  33.1 
 
 
439 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  29.88 
 
 
460 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  30.81 
 
 
464 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  29.23 
 
 
465 aa  190  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  29.76 
 
 
462 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  30.42 
 
 
479 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4179  peptidase M16 domain-containing protein  32.22 
 
 
430 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  27.33 
 
 
444 aa  179  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  31.78 
 
 
444 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  31.05 
 
 
437 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0395  peptidase M16 domain protein  31.54 
 
 
437 aa  176  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412071  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  31.8 
 
 
439 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2216  peptidase M16 domain-containing protein  30.71 
 
 
433 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.384434  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1802  peptidase M16 domain-containing protein  31.34 
 
 
431 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3492  peptidase M16 domain-containing protein  29.16 
 
 
477 aa  171  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  28.02 
 
 
896 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  28.79 
 
 
476 aa  170  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  30.64 
 
 
471 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4255  peptidase M16 domain-containing protein  28.57 
 
 
492 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0349  peptidase M16 domain-containing protein  31.05 
 
 
464 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  27.83 
 
 
945 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0208  peptidase M16 domain-containing protein  28.33 
 
 
487 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4129  peptidase M16 domain-containing protein  28.33 
 
 
492 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3741  peptidase M16 domain-containing protein  28.43 
 
 
486 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0210  peptidase M16 domain protein  28.33 
 
 
497 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.481547 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  28.3 
 
 
495 aa  162  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3814  peptidase M16 domain-containing protein  28.19 
 
 
487 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3939  DNA-directed RNA polymerase  28.19 
 
 
487 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2864  peptidase M16 domain protein  27.32 
 
 
435 aa  162  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0431623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  27.58 
 
 
495 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  29.14 
 
 
479 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  28.33 
 
 
483 aa  156  7e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>