More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0349 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0349  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 		 464 aa  944    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4989  peptidase M16 domain-containing protein  38.8 
 
 		 456 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5116  peptidase M16 domain protein  37.88 
 
 		 456 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5166  peptidase M16 domain-containing protein  39.54 
 
 		 457 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  34.25 
 
 		 495 aa  236  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  35.73 
 
 		 494 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  35.91 
 
 		 486 aa  232  9e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  35.52 
 
 		 494 aa  230  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  35.48 
 
 		 495 aa  229  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  35.24 
 
 		 495 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  35 
 
 		 496 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  32.88 
 
 		 497 aa  223  6e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  33.57 
 
 		 496 aa  223  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  34.61 
 
 		 496 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  34.13 
 
 		 496 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  30.92 
 
 		 446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  32.01 
 
 		 441 aa  193  5e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  30.07 
 
 		 436 aa  189  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  32.29 
 
 		 435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  31.41 
 
 		 438 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2657  peptidase M16 domain-containing protein  32.12 
 
 		 481 aa  176  9e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235444 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0218  non-proteolytic protein, peptidase family M16  28.95 
 
 		 443 aa  175  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2106  M16 family peptidase  28.85 
 
 		 443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  29.06 
 
 		 434 aa  170  6e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  28.57 
 
 		 434 aa  166  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  29.95 
 
 		 434 aa  163  7e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0172  peptidase M16 domain protein  27.45 
 
 		 441 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1483  peptidase M16-like  28.89 
 
 		 515 aa  161  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0660842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  30.4 
 
 		 429 aa  159  8e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0931  insulinase-like peptidase  28.06 
 
 		 528 aa  157  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0647883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  28.09 
 
 		 437 aa  156  7e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2307  peptidase M16 domain-containing protein  30.95 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  30.21 
 
 		 453 aa  150  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1670  peptidase M16-like  28.57 
 
 		 471 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  29.48 
 
 		 450 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  26.67 
 
 		 451 aa  143  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0243  peptidase M16 domain protein  29.48 
 
 		 450 aa  143  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1783  peptidase M16 domain-containing protein  28.01 
 
 		 504 aa  142  9e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  25.95 
 
 		 454 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0388  putative Zinc protease-like signal peptide protein  29.48 
 
 		 447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  28.54 
 
 		 457 aa  141  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4372  peptidase M16 domain protein  28.23 
 
 		 448 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3618  peptidase M16 domain protein  30.08 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3518  peptidase M16 domain-containing protein  28.07 
 
 		 460 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4763  peptidase M16 domain-containing protein  30.47 
 
 		 448 aa  132  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0283  peptidase M16-like protein  27.86 
 
 		 454 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0571104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  27.44 
 
 		 437 aa  131  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1280  peptidase M16-like  28.13 
 
 		 461 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2841  peptidase M16 domain protein  28.11 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279982  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2759  peptidase M16 domain-containing protein  27.96 
 
 		 435 aa  126  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  27.73 
 
 		 435 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0893  peptidase M16 domain-containing protein  29.55 
 
 		 451 aa  126  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0504062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1096  putative zinc protease  27.96 
 
 		 435 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0917813  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  23.57 
 
 		 444 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3871  peptidase M16 domain-containing protein  28.03 
 
 		 453 aa  120  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  26.2 
 
 		 464 aa  120  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  26.79 
 
 		 444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  27.67 
 
 		 437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1926  peptidase M16 domain-containing protein  23.87 
 
 		 445 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  26.49 
 
 		 476 aa  114  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1631  peptidase M16 domain protein  23.2 
 
 		 445 aa  113  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.368966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  26.29 
 
 		 477 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5951  peptidase M16 domain protein  25.68 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3939  DNA-directed RNA polymerase  26.49 
 
 		 487 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3741  peptidase M16 domain-containing protein  26.25 
 
 		 486 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0336  peptidase M16, C-terminal  25.36 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.469062  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4255  peptidase M16 domain-containing protein  25.85 
 
 		 492 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  25.06 
 
 		 462 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0210  peptidase M16 domain protein  25.85 
 
 		 497 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.481547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  25.06 
 
 		 460 aa  107  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  27.58 
 
 		 447 aa  107  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3814  peptidase M16 domain-containing protein  26.25 
 
 		 487 aa  106  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  24.19 
 
 		 462 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4129  peptidase M16 domain-containing protein  25.61 
 
 		 492 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0208  peptidase M16 domain-containing protein  25.36 
 
 		 487 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2284  peptidase M16 domain protein  24.42 
 
 		 427 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.538642 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  26.35 
 
 		 449 aa  104  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  27.73 
 
 		 479 aa  103  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  25.91 
 
 		 439 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0262  peptidase M16 domain-containing protein  24.94 
 
 		 480 aa  103  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000120782  normal  0.152415 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  25.42 
 
 		 439 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  25.42 
 
 		 439 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1597  peptidase M16 domain-containing protein  23.79 
 
 		 466 aa  103  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832035  normal  0.315453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0028  peptidase M16 domain protein  26.2 
 
 		 423 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  25.06 
 
 		 482 aa  101  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3947  peptidase M16 domain-containing protein  25 
 
 		 481 aa  101  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3492  peptidase M16 domain-containing protein  25.53 
 
 		 477 aa  101  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  25.18 
 
 		 954 aa  100  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  25.8 
 
 		 921 aa  100  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2329  peptidase M16 domain-containing protein  24.42 
 
 		 427 aa  100  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.504761  normal  0.793459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2606  peptidase M16 domain protein  24.42 
 
 		 427 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  24.09 
 
 		 495 aa  99.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  24.07 
 
 		 943 aa  99.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0261  peptidase M16 domain-containing protein  25.71 
 
 		 481 aa  99.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  26.27 
 
 		 767 aa  99  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0928  M16 family peptidase  25.3 
 
 		 478 aa  97.8  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0913  M16 family peptidase  21.29 
 
 		 448 aa  98.2  3e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.226021  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  23.15 
 
 		 479 aa  97.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  25.48 
 
 		 945 aa  96.3  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  23.36 
 
 		 483 aa  95.9  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>