More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0262 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0262  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 		 480 aa  978    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000120782  normal  0.152415 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0261  peptidase M16 domain-containing protein  77.75 
 
 		 481 aa  753    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3492  peptidase M16 domain-containing protein  72.48 
 
 		 477 aa  719    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4129  peptidase M16 domain-containing protein  72.97 
 
 		 492 aa  708    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0208  peptidase M16 domain-containing protein  72.97 
 
 		 487 aa  707    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4255  peptidase M16 domain-containing protein  72.97 
 
 		 492 aa  708    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3485  peptidase M16-like protein  64.01 
 
 		 502 aa  636    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.320343  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3443  peptidase M16-like protein  70.23 
 
 		 473 aa  650    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  73.75 
 
 		 482 aa  734    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0210  peptidase M16 domain protein  72.97 
 
 		 497 aa  726    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.481547 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3947  peptidase M16 domain-containing protein  71.52 
 
 		 481 aa  715    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3741  peptidase M16 domain-containing protein  74.46 
 
 		 486 aa  721    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3814  peptidase M16 domain-containing protein  74.03 
 
 		 487 aa  721    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  65.91 
 
 		 483 aa  652    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3939  DNA-directed RNA polymerase  74.25 
 
 		 487 aa  725    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2704  peptidase M16 domain protein  50.23 
 
 		 458 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5792  peptidase M16 domain protein  49.67 
 
 		 458 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.047663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  32.56 
 
 		 439 aa  249  9e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  32.56 
 
 		 439 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  31.86 
 
 		 439 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  32.88 
 
 		 439 aa  242  9e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  28.3 
 
 		 767 aa  203  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0110  peptidase M16 domain protein  29.08 
 
 		 520 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.282099  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0103  peptidase M16-like  29.08 
 
 		 519 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.968685  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0121  peptidase M16 domain protein  28.61 
 
 		 520 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  27.46 
 
 		 495 aa  189  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  29.67 
 
 		 943 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  27 
 
 		 495 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  26.65 
 
 		 471 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4371  peptidase M16-like  29.08 
 
 		 512 aa  182  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.325226 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  25.17 
 
 		 479 aa  182  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  28.91 
 
 		 434 aa  180  5.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0658  peptidase M16 domain protein  27.7 
 
 		 490 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0678  peptidase M16 domain protein  27.7 
 
 		 490 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  27.11 
 
 		 474 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0928  M16 family peptidase  24.68 
 
 		 478 aa  170  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  29.47 
 
 		 495 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  26.08 
 
 		 476 aa  168  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2345  peptidase M16 domain protein  26.17 
 
 		 490 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.854323 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  26.71 
 
 		 449 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  28.05 
 
 		 929 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2774  peptidase M16-like  27.29 
 
 		 494 aa  164  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171699  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  28.41 
 
 		 949 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0738  peptidase M16 domain-containing protein  27.29 
 
 		 506 aa  163  6e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  24.95 
 
 		 479 aa  163  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  26.51 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  26.67 
 
 		 441 aa  161  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  26.96 
 
 		 947 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  27.55 
 
 		 436 aa  159  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2752  peptidase M16 domain protein  26.37 
 
 		 494 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  25.75 
 
 		 437 aa  156  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  27.48 
 
 		 497 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0621  peptidase M16-like  24.84 
 
 		 725 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  25.6 
 
 		 954 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  24.94 
 
 		 457 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  27.71 
 
 		 496 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1926  peptidase M16 domain-containing protein  27.08 
 
 		 445 aa  152  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  25.81 
 
 		 444 aa  152  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  27.21 
 
 		 496 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  25.58 
 
 		 952 aa  151  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  26.99 
 
 		 954 aa  151  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  27.25 
 
 		 494 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  28.64 
 
 		 429 aa  150  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  27.14 
 
 		 495 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  25.42 
 
 		 945 aa  150  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  28.5 
 
 		 945 aa  150  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  27.76 
 
 		 896 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  25.78 
 
 		 921 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  27.29 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  26.9 
 
 		 495 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1483  peptidase M16-like  25.7 
 
 		 515 aa  146  6e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0660842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  27.65 
 
 		 486 aa  147  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2657  peptidase M16 domain-containing protein  25.41 
 
 		 481 aa  147  6e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235444 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02700  putative metallopeptidase, M16 family protein  25.94 
 
 		 687 aa  147  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  27.53 
 
 		 465 aa  146  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  25 
 
 		 454 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1096  putative zinc protease  25.24 
 
 		 435 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0917813  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  24.18 
 
 		 435 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1631  peptidase M16 domain protein  26.16 
 
 		 445 aa  143  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.368966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2759  peptidase M16 domain-containing protein  25 
 
 		 435 aa  143  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0931  insulinase-like peptidase  25 
 
 		 528 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0647883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0932  peptidase M16 domain-containing protein  24.08 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513926  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  25.95 
 
 		 456 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  25.23 
 
 		 958 aa  141  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  25.81 
 
 		 969 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1783  peptidase M16 domain-containing protein  24.2 
 
 		 504 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  26.84 
 
 		 438 aa  140  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  26.96 
 
 		 496 aa  140  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  26.81 
 
 		 494 aa  140  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  25.35 
 
 		 945 aa  138  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  25.65 
 
 		 950 aa  138  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  26.04 
 
 		 952 aa  138  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  24.78 
 
 		 947 aa  138  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  24.53 
 
 		 437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  25.36 
 
 		 435 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  26.73 
 
 		 496 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  24.52 
 
 		 477 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  25.45 
 
 		 956 aa  136  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  23.64 
 
 		 453 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  29.55 
 
 		 464 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>