More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3580 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_4129  peptidase M16 domain-containing protein  70.64 
 
 		 492 aa  671    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3492  peptidase M16 domain-containing protein  72.53 
 
 		 477 aa  693    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0208  peptidase M16 domain-containing protein  70.64 
 
 		 487 aa  671    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 		 482 aa  987    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0262  peptidase M16 domain-containing protein  73.75 
 
 		 480 aa  713    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000120782  normal  0.152415 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3485  peptidase M16-like protein  66.18 
 
 		 502 aa  649    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.320343  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0261  peptidase M16 domain-containing protein  72.06 
 
 		 481 aa  699    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0210  peptidase M16 domain protein  70.21 
 
 		 497 aa  684    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.481547 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4255  peptidase M16 domain-containing protein  70.64 
 
 		 492 aa  671    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3741  peptidase M16 domain-containing protein  71.22 
 
 		 486 aa  685    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3814  peptidase M16 domain-containing protein  71 
 
 		 487 aa  687    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  66.88 
 
 		 483 aa  648    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3947  peptidase M16 domain-containing protein  70 
 
 		 481 aa  703    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3939  DNA-directed RNA polymerase  71.22 
 
 		 487 aa  690    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3443  peptidase M16-like protein  66.74 
 
 		 473 aa  617  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5792  peptidase M16 domain protein  52.16 
 
 		 458 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.047663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2704  peptidase M16 domain protein  49.67 
 
 		 458 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  31.34 
 
 		 439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  31.34 
 
 		 439 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  31.26 
 
 		 439 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  30.41 
 
 		 439 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  29.15 
 
 		 767 aa  211  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  27.11 
 
 		 495 aa  196  9e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  26.65 
 
 		 495 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  27.04 
 
 		 474 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  29.69 
 
 		 943 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  25.4 
 
 		 479 aa  187  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  27.21 
 
 		 457 aa  183  8.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0678  peptidase M16 domain protein  27.76 
 
 		 490 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0658  peptidase M16 domain protein  27.76 
 
 		 490 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0110  peptidase M16 domain protein  27.75 
 
 		 520 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.282099  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  29.27 
 
 		 929 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4371  peptidase M16-like  27.55 
 
 		 512 aa  176  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.325226 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  29.27 
 
 		 949 aa  176  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2345  peptidase M16 domain protein  27.2 
 
 		 490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.854323 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  28.81 
 
 		 947 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0121  peptidase M16 domain protein  27.79 
 
 		 520 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0928  M16 family peptidase  25.21 
 
 		 478 aa  173  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  27.31 
 
 		 434 aa  173  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0103  peptidase M16-like  27.79 
 
 		 519 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.968685  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  27.19 
 
 		 449 aa  173  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  25.27 
 
 		 479 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  26.86 
 
 		 921 aa  172  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0738  peptidase M16 domain-containing protein  27.79 
 
 		 506 aa  172  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  24.35 
 
 		 476 aa  172  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  28.29 
 
 		 495 aa  169  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  27.49 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  25.45 
 
 		 471 aa  166  8e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2752  peptidase M16 domain protein  26.39 
 
 		 494 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  25.41 
 
 		 437 aa  162  9e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  28.74 
 
 		 896 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  28.67 
 
 		 496 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  26.03 
 
 		 446 aa  162  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  28.38 
 
 		 465 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0621  peptidase M16-like  26.81 
 
 		 725 aa  160  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  26.87 
 
 		 956 aa  158  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  25.05 
 
 		 945 aa  156  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  25.52 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2774  peptidase M16-like  25.34 
 
 		 494 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171699  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  27.64 
 
 		 494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2657  peptidase M16 domain-containing protein  24.88 
 
 		 481 aa  154  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  27.16 
 
 		 497 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  25.06 
 
 		 954 aa  154  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  27.54 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  27.59 
 
 		 496 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  27.35 
 
 		 486 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  27.42 
 
 		 952 aa  152  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  26.9 
 
 		 462 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  27.41 
 
 		 967 aa  151  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  27.4 
 
 		 954 aa  151  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  26.7 
 
 		 435 aa  150  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  27.17 
 
 		 945 aa  150  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  26.03 
 
 		 437 aa  150  6e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1926  peptidase M16 domain-containing protein  26.56 
 
 		 445 aa  150  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  27.36 
 
 		 496 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  27.34 
 
 		 952 aa  149  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  25.78 
 
 		 496 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  25.7 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  26.49 
 
 		 434 aa  149  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  26.47 
 
 		 444 aa  149  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0932  peptidase M16 domain-containing protein  25.11 
 
 		 455 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513926  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1483  peptidase M16-like  25.41 
 
 		 515 aa  147  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0660842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  26.62 
 
 		 456 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  26.25 
 
 		 434 aa  146  6e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  27.25 
 
 		 464 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  26.14 
 
 		 438 aa  146  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1096  putative zinc protease  25.59 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0917813  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1631  peptidase M16 domain protein  27.02 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.368966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  25.45 
 
 		 947 aa  146  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  26.49 
 
 		 460 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  25.5 
 
 		 464 aa  144  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2759  peptidase M16 domain-containing protein  25.35 
 
 		 435 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  25.12 
 
 		 437 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  28.27 
 
 		 944 aa  144  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  28.12 
 
 		 495 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  26.99 
 
 		 495 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  26.5 
 
 		 945 aa  143  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2314  peptidase M16 domain protein  24.41 
 
 		 432 aa  143  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.298919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  25.93 
 
 		 960 aa  143  8e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  25.9 
 
 		 454 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>