More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0378 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  100 
 
 		 435 aa  875    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  54.55 
 
 		 446 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  53.98 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  49.07 
 
 		 436 aa  428  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3618  peptidase M16 domain protein  54 
 
 		 467 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  49.16 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0388  putative Zinc protease-like signal peptide protein  49.16 
 
 		 447 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0243  peptidase M16 domain protein  48.44 
 
 		 450 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  47.61 
 
 		 438 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  46.03 
 
 		 434 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  47.6 
 
 		 441 aa  371  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0283  peptidase M16-like protein  47.02 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0571104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0336  peptidase M16, C-terminal  48.8 
 
 		 453 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.469062  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1280  peptidase M16-like  42.99 
 
 		 461 aa  359  6e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1670  peptidase M16-like  42.38 
 
 		 471 aa  348  1e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4372  peptidase M16 domain protein  44.16 
 
 		 448 aa  343  4e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0893  peptidase M16 domain-containing protein  43.16 
 
 		 451 aa  332  9e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0504062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  42.03 
 
 		 494 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  40.24 
 
 		 495 aa  326  5e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3518  peptidase M16 domain-containing protein  44.1 
 
 		 460 aa  326  6e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4763  peptidase M16 domain-containing protein  42.32 
 
 		 448 aa  323  3e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  39.76 
 
 		 495 aa  322  8e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2841  peptidase M16 domain protein  44.37 
 
 		 460 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279982  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  39.68 
 
 		 437 aa  320  3e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  40.48 
 
 		 497 aa  319  6e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  40.54 
 
 		 434 aa  317  2e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  40.72 
 
 		 496 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3871  peptidase M16 domain-containing protein  44.15 
 
 		 453 aa  318  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0172  peptidase M16 domain protein  40.55 
 
 		 441 aa  317  4e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  40.29 
 
 		 434 aa  316  5e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  41.88 
 
 		 453 aa  316  5e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  40 
 
 		 496 aa  315  9e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  40 
 
 		 494 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2657  peptidase M16 domain-containing protein  42.65 
 
 		 481 aa  312  6.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235444 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1926  peptidase M16 domain-containing protein  39.08 
 
 		 445 aa  312  9e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  40.24 
 
 		 496 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  39.76 
 
 		 496 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  39.52 
 
 		 486 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  38.07 
 
 		 495 aa  300  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1631  peptidase M16 domain protein  39.05 
 
 		 445 aa  298  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.368966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0218  non-proteolytic protein, peptidase family M16  37.38 
 
 		 443 aa  277  3e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2106  M16 family peptidase  37.38 
 
 		 443 aa  276  5e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2307  peptidase M16 domain-containing protein  38.59 
 
 		 451 aa  265  1e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  33.8 
 
 		 464 aa  232  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1483  peptidase M16-like  32.39 
 
 		 515 aa  229  7e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0660842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0931  insulinase-like peptidase  31.97 
 
 		 528 aa  227  3e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0647883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  34.88 
 
 		 447 aa  224  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  33.03 
 
 		 457 aa  222  9e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  33.18 
 
 		 449 aa  219  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  30.14 
 
 		 451 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  33.49 
 
 		 435 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1783  peptidase M16 domain-containing protein  31.01 
 
 		 504 aa  209  6e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  29.4 
 
 		 454 aa  208  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  34.11 
 
 		 437 aa  206  7e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  31.29 
 
 		 477 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  32.4 
 
 		 437 aa  199  7.999999999999999e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1096  putative zinc protease  33.33 
 
 		 435 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0917813  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2759  peptidase M16 domain-containing protein  33.33 
 
 		 435 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  28.51 
 
 		 444 aa  198  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  32.12 
 
 		 457 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2606  peptidase M16 domain protein  33.01 
 
 		 427 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2284  peptidase M16 domain protein  33.01 
 
 		 427 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.538642 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  30.65 
 
 		 465 aa  197  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2329  peptidase M16 domain-containing protein  33.01 
 
 		 427 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.504761  normal  0.793459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  31.57 
 
 		 462 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1802  peptidase M16 domain-containing protein  32.51 
 
 		 431 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5166  peptidase M16 domain-containing protein  31.62 
 
 		 457 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  30.94 
 
 		 462 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  31.31 
 
 		 456 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4989  peptidase M16 domain-containing protein  29.27 
 
 		 456 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  31.39 
 
 		 464 aa  188  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  32.27 
 
 		 439 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  32.52 
 
 		 439 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  32.52 
 
 		 439 aa  187  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  32.71 
 
 		 444 aa  186  7e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  28.6 
 
 		 460 aa  186  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5116  peptidase M16 domain protein  29.27 
 
 		 456 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0395  peptidase M16 domain protein  32.27 
 
 		 437 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4179  peptidase M16 domain-containing protein  33.17 
 
 		 430 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  30.95 
 
 		 479 aa  180  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  32.2 
 
 		 439 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2216  peptidase M16 domain-containing protein  31.3 
 
 		 433 aa  177  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.384434  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0349  peptidase M16 domain-containing protein  31.72 
 
 		 464 aa  176  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0431  peptidase M16-like  30.3 
 
 		 451 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2864  peptidase M16 domain protein  31.84 
 
 		 435 aa  169  8e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0431623 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  29.68 
 
 		 495 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  29.4 
 
 		 896 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  28.67 
 
 		 767 aa  163  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  29.44 
 
 		 495 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  30.81 
 
 		 476 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  27.55 
 
 		 479 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1010  peptidase M16 domain-containing protein  30.31 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.346738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  28.86 
 
 		 943 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  28.47 
 
 		 474 aa  153  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  27.36 
 
 		 483 aa  153  7e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  28.71 
 
 		 954 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  26.7 
 
 		 482 aa  150  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  29.73 
 
 		 471 aa  149  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2273  peptidase M16 domain-containing protein  28.05 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.359911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2752  peptidase M16 domain protein  26.68 
 
 		 494 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>