More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1980 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  100 
 
 
479 aa  967    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  44.57 
 
 
474 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  44.4 
 
 
495 aa  392  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  42.08 
 
 
495 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  41.21 
 
 
479 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  45.08 
 
 
471 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  42.42 
 
 
476 aa  363  4e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0928  M16 family peptidase  43.02 
 
 
478 aa  355  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4371  peptidase M16-like  36.73 
 
 
512 aa  299  9e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.325226 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0738  peptidase M16 domain-containing protein  33.76 
 
 
506 aa  278  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2345  peptidase M16 domain protein  31.74 
 
 
490 aa  272  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.854323 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2774  peptidase M16-like  33.56 
 
 
494 aa  270  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171699  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0621  peptidase M16-like  31.62 
 
 
725 aa  266  5e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2752  peptidase M16 domain protein  31.47 
 
 
494 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1597  peptidase M16 domain-containing protein  34.38 
 
 
466 aa  259  7e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832035  normal  0.315453 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0678  peptidase M16 domain protein  30.71 
 
 
490 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0658  peptidase M16 domain protein  30.5 
 
 
490 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0375  processing protease  33.33 
 
 
471 aa  229  6e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  33.25 
 
 
447 aa  210  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  32.6 
 
 
457 aa  207  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  32.37 
 
 
429 aa  203  6e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  32.62 
 
 
441 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  30.57 
 
 
449 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  29.09 
 
 
767 aa  193  6e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  28.61 
 
 
434 aa  192  9e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0283  peptidase M16-like protein  30.17 
 
 
454 aa  192  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0571104  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1631  peptidase M16 domain protein  28.34 
 
 
445 aa  192  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.368966  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1926  peptidase M16 domain-containing protein  27.33 
 
 
445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2216  peptidase M16 domain-containing protein  32.78 
 
 
433 aa  187  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.384434  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0395  peptidase M16 domain protein  33.01 
 
 
437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412071  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1670  peptidase M16-like  29.75 
 
 
471 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  30.42 
 
 
438 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  28.81 
 
 
446 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  29.62 
 
 
896 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  30.95 
 
 
435 aa  180  4.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  27.9 
 
 
450 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  29.7 
 
 
464 aa  178  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0336  peptidase M16, C-terminal  29.59 
 
 
453 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.469062  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0243  peptidase M16 domain protein  27.66 
 
 
450 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4179  peptidase M16 domain-containing protein  32.54 
 
 
430 aa  177  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  27.74 
 
 
451 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  26.25 
 
 
483 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  30.5 
 
 
437 aa  173  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  25.27 
 
 
482 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  31.39 
 
 
457 aa  172  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  28.54 
 
 
954 aa  171  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  27.59 
 
 
945 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2606  peptidase M16 domain protein  28.1 
 
 
427 aa  170  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  26.19 
 
 
943 aa  170  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0172  peptidase M16 domain protein  28.91 
 
 
441 aa  170  5e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  28.71 
 
 
454 aa  170  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4372  peptidase M16 domain protein  30.86 
 
 
448 aa  170  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2329  peptidase M16 domain-containing protein  28.1 
 
 
427 aa  169  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.504761  normal  0.793459 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0103  peptidase M16-like  33.04 
 
 
519 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.968685  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  28.5 
 
 
439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  28.64 
 
 
444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3618  peptidase M16 domain protein  30.34 
 
 
467 aa  167  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3485  peptidase M16-like protein  25.8 
 
 
502 aa  167  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.320343  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0388  putative Zinc protease-like signal peptide protein  27.7 
 
 
447 aa  167  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886206  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0121  peptidase M16 domain protein  32.66 
 
 
520 aa  167  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  29.8 
 
 
460 aa  167  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3518  peptidase M16 domain-containing protein  28.51 
 
 
460 aa  167  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  28.64 
 
 
477 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2284  peptidase M16 domain protein  27.99 
 
 
427 aa  167  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.538642 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  28.1 
 
 
453 aa  166  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0110  peptidase M16 domain protein  32.44 
 
 
520 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.282099  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  28.67 
 
 
435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  29.78 
 
 
439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  28.37 
 
 
462 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  28.95 
 
 
456 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  28.3 
 
 
439 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2841  peptidase M16 domain protein  28.51 
 
 
460 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279982  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  28.3 
 
 
439 aa  163  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1010  peptidase M16 domain-containing protein  30.31 
 
 
426 aa  161  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.346738  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3492  peptidase M16 domain-containing protein  24.43 
 
 
477 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0893  peptidase M16 domain-containing protein  28.51 
 
 
451 aa  159  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0504062  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  26.82 
 
 
921 aa  159  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  26.16 
 
 
937 aa  158  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  25.54 
 
 
437 aa  158  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  28.16 
 
 
462 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  26.9 
 
 
956 aa  159  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  26.59 
 
 
962 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3947  peptidase M16 domain-containing protein  24.84 
 
 
481 aa  158  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  28.78 
 
 
494 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  27.21 
 
 
436 aa  157  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1280  peptidase M16-like  27.76 
 
 
461 aa  157  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3443  peptidase M16-like protein  26.98 
 
 
473 aa  157  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  27.95 
 
 
437 aa  157  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1802  peptidase M16 domain-containing protein  29.68 
 
 
431 aa  156  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2864  peptidase M16 domain protein  28.4 
 
 
435 aa  156  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0431623 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1096  putative zinc protease  28.06 
 
 
435 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0917813  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  28.01 
 
 
444 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0200  peptidase M16 domain protein  29.71 
 
 
412 aa  155  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0262  peptidase M16 domain-containing protein  24.95 
 
 
480 aa  155  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000120782  normal  0.152415 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  26.42 
 
 
960 aa  155  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2759  peptidase M16 domain-containing protein  27.82 
 
 
435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482454  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3741  peptidase M16 domain-containing protein  24.36 
 
 
486 aa  154  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3814  peptidase M16 domain-containing protein  24.36 
 
 
487 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3939  DNA-directed RNA polymerase  24.15 
 
 
487 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0218  non-proteolytic protein, peptidase family M16  26.64 
 
 
443 aa  153  7e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>