More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4372 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4372  peptidase M16 domain protein  100 
 
 		 448 aa  898    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1670  peptidase M16-like  65.27 
 
 		 471 aa  592  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0893  peptidase M16 domain-containing protein  61.83 
 
 		 451 aa  561  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0504062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1280  peptidase M16-like  63.27 
 
 		 461 aa  555  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  59.6 
 
 		 453 aa  544  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3871  peptidase M16 domain-containing protein  66.43 
 
 		 453 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2841  peptidase M16 domain protein  59.87 
 
 		 460 aa  530  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3518  peptidase M16 domain-containing protein  58.98 
 
 		 460 aa  526  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4763  peptidase M16 domain-containing protein  61.38 
 
 		 448 aa  520  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  53.22 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0243  peptidase M16 domain protein  52.98 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0388  putative Zinc protease-like signal peptide protein  52.86 
 
 		 447 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0336  peptidase M16, C-terminal  49.65 
 
 		 453 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.469062  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0283  peptidase M16-like protein  47.14 
 
 		 454 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0571104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1631  peptidase M16 domain protein  44.35 
 
 		 445 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.368966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1926  peptidase M16 domain-containing protein  44.27 
 
 		 445 aa  361  2e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  47.52 
 
 		 429 aa  359  7e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  44.37 
 
 		 446 aa  355  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  45.09 
 
 		 435 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3618  peptidase M16 domain protein  49.16 
 
 		 467 aa  342  5e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  41.52 
 
 		 436 aa  332  1e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  42.59 
 
 		 441 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  39.2 
 
 		 434 aa  309  6.999999999999999e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  41.57 
 
 		 438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0172  peptidase M16 domain protein  37.64 
 
 		 441 aa  274  3e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  36.55 
 
 		 494 aa  272  9e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  38.52 
 
 		 497 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  36.65 
 
 		 437 aa  270  5e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  37.79 
 
 		 496 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  36.49 
 
 		 495 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  36.49 
 
 		 495 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  38.44 
 
 		 486 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  37.35 
 
 		 496 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  33.03 
 
 		 434 aa  259  6e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  37.35 
 
 		 496 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  32.81 
 
 		 434 aa  257  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  36.88 
 
 		 495 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  37.12 
 
 		 496 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  36.34 
 
 		 494 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2106  M16 family peptidase  34.31 
 
 		 443 aa  255  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0218  non-proteolytic protein, peptidase family M16  34.31 
 
 		 443 aa  253  4.0000000000000004e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2657  peptidase M16 domain-containing protein  36.05 
 
 		 481 aa  246  8e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235444 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1483  peptidase M16-like  33.8 
 
 		 515 aa  231  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0660842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0931  insulinase-like peptidase  33.64 
 
 		 528 aa  219  1e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0647883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2307  peptidase M16 domain-containing protein  35.08 
 
 		 451 aa  211  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  33.56 
 
 		 454 aa  208  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  32.85 
 
 		 451 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1783  peptidase M16 domain-containing protein  30.47 
 
 		 504 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  33.11 
 
 		 457 aa  193  6e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  31.99 
 
 		 465 aa  187  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  30.75 
 
 		 449 aa  186  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  31.84 
 
 		 437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  31.43 
 
 		 464 aa  182  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  31.07 
 
 		 479 aa  182  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  31.97 
 
 		 457 aa  180  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  32.63 
 
 		 447 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  29.62 
 
 		 462 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  33.02 
 
 		 435 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  29.38 
 
 		 462 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  28.89 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2329  peptidase M16 domain-containing protein  32.29 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.504761  normal  0.793459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2606  peptidase M16 domain protein  32.54 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  31.22 
 
 		 464 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  29.65 
 
 		 460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  30.97 
 
 		 456 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1802  peptidase M16 domain-containing protein  33.02 
 
 		 431 aa  167  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  29.48 
 
 		 477 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  31.61 
 
 		 437 aa  166  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2284  peptidase M16 domain protein  31.82 
 
 		 427 aa  166  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.538642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4989  peptidase M16 domain-containing protein  29.69 
 
 		 456 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  32.71 
 
 		 439 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  32.79 
 
 		 439 aa  163  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  32.79 
 
 		 439 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0395  peptidase M16 domain protein  30.46 
 
 		 437 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412071  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  32.79 
 
 		 439 aa  160  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2752  peptidase M16 domain protein  30.5 
 
 		 494 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4179  peptidase M16 domain-containing protein  31.1 
 
 		 430 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0738  peptidase M16 domain-containing protein  30.07 
 
 		 506 aa  159  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  28.74 
 
 		 479 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2864  peptidase M16 domain protein  31.79 
 
 		 435 aa  157  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0431623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  29.86 
 
 		 474 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2774  peptidase M16-like  27.5 
 
 		 494 aa  156  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171699  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1010  peptidase M16 domain-containing protein  30.65 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.346738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2216  peptidase M16 domain-containing protein  29.4 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.384434  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  27.75 
 
 		 471 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0431  peptidase M16-like  29.4 
 
 		 451 aa  152  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  30.02 
 
 		 444 aa  151  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5116  peptidase M16 domain protein  28.03 
 
 		 456 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5166  peptidase M16 domain-containing protein  29.29 
 
 		 457 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  29.33 
 
 		 896 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0621  peptidase M16-like  28.64 
 
 		 725 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1096  putative zinc protease  31.22 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0917813  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2759  peptidase M16 domain-containing protein  30.99 
 
 		 435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  27.82 
 
 		 495 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4371  peptidase M16-like  29.24 
 
 		 512 aa  147  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.325226 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  29.76 
 
 		 954 aa  146  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  27.82 
 
 		 495 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  28.21 
 
 		 476 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2345  peptidase M16 domain protein  28.61 
 
 		 490 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.854323 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0678  peptidase M16 domain protein  27.9 
 
 		 490 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>