More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5116 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5116  peptidase M16 domain protein  100 
 
 		 456 aa  909    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4989  peptidase M16 domain-containing protein  96.93 
 
 		 456 aa  885    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5166  peptidase M16 domain-containing protein  68.37 
 
 		 457 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0349  peptidase M16 domain-containing protein  37.88 
 
 		 464 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  36.9 
 
 		 496 aa  266  7e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  36.9 
 
 		 497 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  38.33 
 
 		 494 aa  263  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  36.6 
 
 		 495 aa  262  8e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  37.71 
 
 		 494 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  36.99 
 
 		 496 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  37.05 
 
 		 486 aa  256  7e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  36.1 
 
 		 496 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  36.04 
 
 		 496 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  35.41 
 
 		 495 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  34.45 
 
 		 495 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0218  non-proteolytic protein, peptidase family M16  33.57 
 
 		 443 aa  219  7.999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2106  M16 family peptidase  33.5 
 
 		 443 aa  217  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  32.16 
 
 		 441 aa  205  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  30.75 
 
 		 434 aa  204  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  29.83 
 
 		 434 aa  203  5e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  29.83 
 
 		 434 aa  202  9e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  33.01 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  30 
 
 		 446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2657  peptidase M16 domain-containing protein  33.01 
 
 		 481 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235444 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  29.27 
 
 		 435 aa  188  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  28.64 
 
 		 437 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  29.51 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  28.68 
 
 		 436 aa  180  4.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0243  peptidase M16 domain protein  29.59 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0172  peptidase M16 domain protein  28.88 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2307  peptidase M16 domain-containing protein  30.99 
 
 		 451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3518  peptidase M16 domain-containing protein  30.39 
 
 		 460 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  29.12 
 
 		 450 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0283  peptidase M16-like protein  27.71 
 
 		 454 aa  163  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0571104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1783  peptidase M16 domain-containing protein  28.27 
 
 		 504 aa  162  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0388  putative Zinc protease-like signal peptide protein  29.36 
 
 		 447 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2841  peptidase M16 domain protein  29.93 
 
 		 460 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279982  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0893  peptidase M16 domain-containing protein  29.02 
 
 		 451 aa  160  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0504062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1280  peptidase M16-like  30.66 
 
 		 461 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0336  peptidase M16, C-terminal  28.43 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.469062  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0931  insulinase-like peptidase  27.82 
 
 		 528 aa  155  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0647883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1483  peptidase M16-like  27.82 
 
 		 515 aa  155  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0660842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  29.58 
 
 		 453 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4372  peptidase M16 domain protein  28.16 
 
 		 448 aa  151  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1926  peptidase M16 domain-containing protein  28.5 
 
 		 445 aa  150  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3618  peptidase M16 domain protein  29.83 
 
 		 467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  26.34 
 
 		 451 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1670  peptidase M16-like  27.61 
 
 		 471 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1631  peptidase M16 domain protein  27.14 
 
 		 445 aa  140  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.368966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3871  peptidase M16 domain-containing protein  29.38 
 
 		 453 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  26.19 
 
 		 454 aa  136  8e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  26.72 
 
 		 460 aa  133  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4763  peptidase M16 domain-containing protein  27.99 
 
 		 448 aa  133  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  25.99 
 
 		 462 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  28.12 
 
 		 437 aa  131  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  27.34 
 
 		 462 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  25.9 
 
 		 464 aa  129  8.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  26.32 
 
 		 457 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  25.69 
 
 		 464 aa  127  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  27.48 
 
 		 921 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  25.19 
 
 		 465 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  25.12 
 
 		 477 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  25.99 
 
 		 969 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0121  peptidase M16 domain protein  28.78 
 
 		 520 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  23.66 
 
 		 483 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  27.7 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0110  peptidase M16 domain protein  30.02 
 
 		 520 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.282099  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0178  peptidase M16 domain protein  25.6 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5792  peptidase M16 domain protein  24.4 
 
 		 458 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.047663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  26.65 
 
 		 439 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  26.65 
 
 		 439 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1597  peptidase M16 domain-containing protein  28.81 
 
 		 466 aa  117  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832035  normal  0.315453 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  26.72 
 
 		 444 aa  117  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3239  zinc protease  25.26 
 
 		 427 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00842119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  25.19 
 
 		 476 aa  116  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  27.8 
 
 		 471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  28.18 
 
 		 943 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  25.92 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  25 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  25.62 
 
 		 495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0850  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  23.77 
 
 		 451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.669926  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1058  M16 family peptidase  23.58 
 
 		 451 aa  114  5e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1802  peptidase M16 domain-containing protein  25.24 
 
 		 431 aa  113  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0395  peptidase M16 domain protein  25.3 
 
 		 437 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412071  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  25.53 
 
 		 474 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  24.68 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  25.06 
 
 		 945 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  25.62 
 
 		 954 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  25.37 
 
 		 495 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0103  peptidase M16-like  29.3 
 
 		 519 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.968685  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  25.71 
 
 		 437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  25.78 
 
 		 447 aa  111  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  23.92 
 
 		 482 aa  111  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  28.12 
 
 		 439 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3492  peptidase M16 domain-containing protein  23.7 
 
 		 477 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  25.36 
 
 		 952 aa  110  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0431  peptidase M16-like  27.48 
 
 		 451 aa  110  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4255  peptidase M16 domain-containing protein  25.19 
 
 		 492 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3485  peptidase M16-like protein  24.08 
 
 		 502 aa  110  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.320343  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  26.79 
 
 		 479 aa  109  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>