More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3239 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3239  zinc protease  100 
 
 		 427 aa  877    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00842119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5951  peptidase M16 domain protein  41.76 
 
 		 426 aa  375  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4248  peptidase M16 domain protein  39.86 
 
 		 426 aa  341  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1590  peptidase M16 domain protein  36.64 
 
 		 424 aa  290  4e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.508475  normal  0.157035 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0534  hypothetical protein  36.26 
 
 		 422 aa  279  6e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0705  peptidase M16 domain protein  34.76 
 
 		 427 aa  260  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0121  peptidase M16 domain protein  26.29 
 
 		 520 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0110  peptidase M16 domain protein  25.82 
 
 		 520 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.282099  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0103  peptidase M16-like  25.59 
 
 		 519 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.968685  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  26.7 
 
 		 943 aa  153  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0082  peptidase M16 domain-containing protein  24.33 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.281002 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  25.29 
 
 		 967 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02700  putative metallopeptidase, M16 family protein  27.61 
 
 		 687 aa  147  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  26.56 
 
 		 479 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  25.29 
 
 		 483 aa  144  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  25.58 
 
 		 945 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3485  peptidase M16-like protein  25 
 
 		 502 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.320343  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  23.67 
 
 		 921 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0109  peptidase M16 domain protein  26.85 
 
 		 456 aa  138  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2774  peptidase M16-like  25.28 
 
 		 494 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171699  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4371  peptidase M16-like  25.36 
 
 		 512 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.325226 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  23.63 
 
 		 767 aa  137  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  27.32 
 
 		 457 aa  136  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0738  peptidase M16 domain-containing protein  25.54 
 
 		 506 aa  136  8e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2752  peptidase M16 domain protein  24.47 
 
 		 494 aa  136  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  25.85 
 
 		 474 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3795  peptidase M16-like  24.94 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.417189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  25.71 
 
 		 495 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  26.01 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  25.48 
 
 		 495 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2329  peptidase M16 domain-containing protein  28.21 
 
 		 427 aa  133  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.504761  normal  0.793459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  26.11 
 
 		 446 aa  133  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  26.39 
 
 		 434 aa  133  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2657  peptidase M16 domain-containing protein  25.3 
 
 		 481 aa  133  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0932  peptidase M16 domain-containing protein  24.47 
 
 		 455 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513926  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  27.31 
 
 		 949 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  26.39 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2606  peptidase M16 domain protein  27.95 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  27.31 
 
 		 949 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  24.25 
 
 		 947 aa  131  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  26.01 
 
 		 429 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  25.4 
 
 		 949 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  26.9 
 
 		 949 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  24.94 
 
 		 947 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  26.67 
 
 		 949 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0928  M16 family peptidase  24.94 
 
 		 478 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  28.24 
 
 		 449 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  26.79 
 
 		 945 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  26.44 
 
 		 944 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4237  peptidase M16 domain protein  23.76 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  27.19 
 
 		 950 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  24.07 
 
 		 954 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  26.56 
 
 		 944 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3492  peptidase M16 domain-containing protein  24.11 
 
 		 477 aa  127  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2284  peptidase M16 domain protein  27.95 
 
 		 427 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.538642 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  26.56 
 
 		 950 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  26.56 
 
 		 950 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  24.42 
 
 		 960 aa  126  6e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  23.91 
 
 		 482 aa  126  9e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  24.83 
 
 		 947 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0893  peptidase M16 domain-containing protein  24.31 
 
 		 451 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0504062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  24.08 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  24.19 
 
 		 958 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  26.03 
 
 		 944 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2345  peptidase M16 domain protein  22.78 
 
 		 490 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.854323 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3741  peptidase M16 domain-containing protein  23.76 
 
 		 486 aa  123  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  26.11 
 
 		 944 aa  123  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2864  peptidase M16 domain protein  23.35 
 
 		 435 aa  123  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0431623 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  24.54 
 
 		 962 aa  123  7e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0243  peptidase M16 domain protein  21.88 
 
 		 450 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3939  DNA-directed RNA polymerase  23.76 
 
 		 487 aa  122  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  23.72 
 
 		 929 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  23.72 
 
 		 949 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  22.47 
 
 		 450 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2216  peptidase M16 domain-containing protein  26.8 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.384434  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  25.69 
 
 		 954 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3814  peptidase M16 domain-containing protein  23.76 
 
 		 487 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  25.46 
 
 		 952 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  24.17 
 
 		 441 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  25.12 
 
 		 434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0261  peptidase M16 domain-containing protein  24.77 
 
 		 481 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0210  peptidase M16 domain protein  23.76 
 
 		 497 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.481547 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0388  putative Zinc protease-like signal peptide protein  22.49 
 
 		 447 aa  121  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  24.94 
 
 		 464 aa  121  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0375  processing protease  23.7 
 
 		 471 aa  121  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0208  peptidase M16 domain-containing protein  23.76 
 
 		 487 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  24.58 
 
 		 969 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3443  peptidase M16-like protein  25.12 
 
 		 473 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4255  peptidase M16 domain-containing protein  23.76 
 
 		 492 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0218  non-proteolytic protein, peptidase family M16  25.8 
 
 		 443 aa  119  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0621  peptidase M16-like  23.48 
 
 		 725 aa  119  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2273  peptidase M16 domain-containing protein  25.06 
 
 		 438 aa  119  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.359911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0658  peptidase M16 domain protein  25 
 
 		 490 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2106  M16 family peptidase  25.8 
 
 		 443 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4129  peptidase M16 domain-containing protein  23.53 
 
 		 492 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  22.43 
 
 		 959 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1802  peptidase M16 domain-containing protein  26.03 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4989  peptidase M16 domain-containing protein  25.07 
 
 		 456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1280  peptidase M16-like  25.06 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0678  peptidase M16 domain protein  24.76 
 
 		 490 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>