More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3721 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  100 
 
 
429 aa  862    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  53.72 
 
 
435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  51.28 
 
 
446 aa  428  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3618  peptidase M16 domain protein  52.21 
 
 
467 aa  424  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  47.49 
 
 
436 aa  398  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0243  peptidase M16 domain protein  48.31 
 
 
450 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  48.2 
 
 
450 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0388  putative Zinc protease-like signal peptide protein  47.83 
 
 
447 aa  388  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886206  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0283  peptidase M16-like protein  47.61 
 
 
454 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0571104  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1280  peptidase M16-like  45.14 
 
 
461 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0336  peptidase M16, C-terminal  47.76 
 
 
453 aa  363  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.469062  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  46.3 
 
 
441 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1670  peptidase M16-like  44.95 
 
 
471 aa  359  5e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  41.26 
 
 
434 aa  352  1e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  44.23 
 
 
438 aa  349  5e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3518  peptidase M16 domain-containing protein  45 
 
 
460 aa  349  6e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4372  peptidase M16 domain protein  47.52 
 
 
448 aa  348  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1926  peptidase M16 domain-containing protein  41.65 
 
 
445 aa  348  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2841  peptidase M16 domain protein  45.45 
 
 
460 aa  347  3e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279982  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0893  peptidase M16 domain-containing protein  41.5 
 
 
451 aa  341  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0504062  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  43.87 
 
 
496 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3871  peptidase M16 domain-containing protein  43.94 
 
 
453 aa  332  6e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  42.89 
 
 
494 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4763  peptidase M16 domain-containing protein  42.14 
 
 
448 aa  327  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1631  peptidase M16 domain protein  40.93 
 
 
445 aa  327  3e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.368966  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  43.87 
 
 
496 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  44.12 
 
 
496 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  40.89 
 
 
453 aa  319  5e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  39.95 
 
 
437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  41.77 
 
 
486 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  41.91 
 
 
496 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  41.67 
 
 
497 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  39.42 
 
 
495 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  38.17 
 
 
434 aa  309  6.999999999999999e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  39.56 
 
 
495 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  37.94 
 
 
434 aa  307  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  41.12 
 
 
494 aa  306  5.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  40.29 
 
 
495 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0218  non-proteolytic protein, peptidase family M16  38.76 
 
 
443 aa  303  4.0000000000000003e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2106  M16 family peptidase  38.76 
 
 
443 aa  303  5.000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0172  peptidase M16 domain protein  37.95 
 
 
441 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2657  peptidase M16 domain-containing protein  39.56 
 
 
481 aa  284  3.0000000000000004e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235444 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2307  peptidase M16 domain-containing protein  37.44 
 
 
451 aa  253  3e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1483  peptidase M16-like  35.08 
 
 
515 aa  251  1e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0660842  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0931  insulinase-like peptidase  35.08 
 
 
528 aa  251  2e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0647883  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  37.65 
 
 
457 aa  247  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1783  peptidase M16 domain-containing protein  33.81 
 
 
504 aa  241  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  32.54 
 
 
454 aa  226  8e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  34.97 
 
 
435 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  32.78 
 
 
451 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1096  putative zinc protease  34.13 
 
 
435 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0917813  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2759  peptidase M16 domain-containing protein  33.89 
 
 
435 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482454  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  31.46 
 
 
457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  31.86 
 
 
464 aa  213  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  33.09 
 
 
460 aa  213  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  32.56 
 
 
437 aa  211  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  33.41 
 
 
449 aa  209  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  32.64 
 
 
465 aa  207  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  33.89 
 
 
456 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  31.62 
 
 
444 aa  205  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  32.2 
 
 
479 aa  203  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  32.19 
 
 
447 aa  202  7e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  31.43 
 
 
479 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  31.62 
 
 
444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  30.39 
 
 
437 aa  199  7e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  30.86 
 
 
495 aa  199  9e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2216  peptidase M16 domain-containing protein  34.16 
 
 
433 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.384434  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  32.28 
 
 
464 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  30.12 
 
 
495 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2284  peptidase M16 domain protein  32.91 
 
 
427 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.538642 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  30.84 
 
 
462 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0395  peptidase M16 domain protein  33.01 
 
 
437 aa  190  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412071  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2864  peptidase M16 domain protein  31.87 
 
 
435 aa  189  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0431623 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  30.77 
 
 
462 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0928  M16 family peptidase  30.02 
 
 
478 aa  187  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1802  peptidase M16 domain-containing protein  34.36 
 
 
431 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4179  peptidase M16 domain-containing protein  32.92 
 
 
430 aa  186  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  30.66 
 
 
477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  31.54 
 
 
439 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0431  peptidase M16-like  31.13 
 
 
451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  31.54 
 
 
439 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2606  peptidase M16 domain protein  31.99 
 
 
427 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2329  peptidase M16 domain-containing protein  32.83 
 
 
427 aa  182  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.504761  normal  0.793459 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4989  peptidase M16 domain-containing protein  29.58 
 
 
456 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  31.3 
 
 
439 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  29.2 
 
 
474 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5116  peptidase M16 domain protein  29.18 
 
 
456 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  29.83 
 
 
896 aa  176  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1010  peptidase M16 domain-containing protein  30.64 
 
 
426 aa  170  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.346738  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0200  peptidase M16 domain protein  31.11 
 
 
412 aa  169  7e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  31.31 
 
 
954 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5166  peptidase M16 domain-containing protein  30.12 
 
 
457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1597  peptidase M16 domain-containing protein  27.98 
 
 
466 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832035  normal  0.315453 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  32.19 
 
 
439 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  28.47 
 
 
767 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  30.37 
 
 
943 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  30.19 
 
 
967 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  28.19 
 
 
471 aa  160  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  27.63 
 
 
945 aa  159  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7811  putative Zn-dependent protease  29.49 
 
 
439 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101927  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>