More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0261 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0261  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
481 aa  979    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  72.06 
 
 
482 aa  719    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4129  peptidase M16 domain-containing protein  71.13 
 
 
492 aa  697    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0208  peptidase M16 domain-containing protein  71.13 
 
 
487 aa  697    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4255  peptidase M16 domain-containing protein  71.13 
 
 
492 aa  697    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3492  peptidase M16 domain-containing protein  70.7 
 
 
477 aa  699    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3947  peptidase M16 domain-containing protein  70.34 
 
 
481 aa  709    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0210  peptidase M16 domain protein  70.7 
 
 
497 aa  705    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.481547 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3741  peptidase M16 domain-containing protein  72.94 
 
 
486 aa  716    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3814  peptidase M16 domain-containing protein  72.52 
 
 
487 aa  713    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  64.26 
 
 
483 aa  642    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3939  DNA-directed RNA polymerase  72.73 
 
 
487 aa  716    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0262  peptidase M16 domain-containing protein  77.75 
 
 
480 aa  752    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000120782  normal  0.152415 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3443  peptidase M16-like protein  68.18 
 
 
473 aa  633  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3485  peptidase M16-like protein  62.35 
 
 
502 aa  624  1e-177  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.320343  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2704  peptidase M16 domain protein  49.56 
 
 
458 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5792  peptidase M16 domain protein  51.03 
 
 
458 aa  442  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.047663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  31.16 
 
 
439 aa  237  4e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  31.16 
 
 
439 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  31.72 
 
 
439 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  30.48 
 
 
439 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0110  peptidase M16 domain protein  29.55 
 
 
520 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.282099  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0658  peptidase M16 domain protein  29.26 
 
 
490 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0678  peptidase M16 domain protein  29.26 
 
 
490 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0103  peptidase M16-like  29.55 
 
 
519 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.968685  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0121  peptidase M16 domain protein  29.31 
 
 
520 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  26.82 
 
 
471 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2345  peptidase M16 domain protein  27.25 
 
 
490 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.854323 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  26.42 
 
 
767 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  28.41 
 
 
943 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4371  peptidase M16-like  27.27 
 
 
512 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.325226 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  24.55 
 
 
479 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  26.16 
 
 
474 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  25.57 
 
 
495 aa  177  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0738  peptidase M16 domain-containing protein  26.95 
 
 
506 aa  176  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  23.85 
 
 
476 aa  172  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  24.49 
 
 
495 aa  169  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0928  M16 family peptidase  24.04 
 
 
478 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2774  peptidase M16-like  26.75 
 
 
494 aa  167  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171699  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  27.01 
 
 
434 aa  164  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  29.53 
 
 
495 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  26.54 
 
 
954 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  27.77 
 
 
949 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  27.77 
 
 
929 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  26.89 
 
 
952 aa  161  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0621  peptidase M16-like  27.48 
 
 
725 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  25.89 
 
 
449 aa  160  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  27.94 
 
 
486 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  27.5 
 
 
947 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2752  peptidase M16 domain protein  26.09 
 
 
494 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  25.59 
 
 
446 aa  155  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  27.38 
 
 
969 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  28.06 
 
 
945 aa  154  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  28.34 
 
 
896 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  26.91 
 
 
958 aa  150  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  26.79 
 
 
954 aa  150  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  27.76 
 
 
438 aa  149  8e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  26.38 
 
 
495 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  25.9 
 
 
495 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  22.66 
 
 
479 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02700  putative metallopeptidase, M16 family protein  26.6 
 
 
687 aa  148  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0932  peptidase M16 domain-containing protein  24.71 
 
 
455 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513926  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  26.25 
 
 
441 aa  147  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  24.55 
 
 
921 aa  147  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  26.6 
 
 
497 aa  147  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1926  peptidase M16 domain-containing protein  27.21 
 
 
445 aa  146  8.000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  26.86 
 
 
496 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  25.9 
 
 
956 aa  144  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  25.9 
 
 
496 aa  144  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  26.49 
 
 
494 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  26.34 
 
 
434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  23.03 
 
 
457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  25.98 
 
 
945 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2657  peptidase M16 domain-containing protein  25 
 
 
481 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4248  peptidase M16 domain protein  26.04 
 
 
426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  25.06 
 
 
436 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  26.1 
 
 
434 aa  140  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  26.37 
 
 
456 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  25.87 
 
 
950 aa  139  8.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  26.95 
 
 
465 aa  139  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  27.44 
 
 
945 aa  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  26.94 
 
 
429 aa  139  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  25.55 
 
 
937 aa  139  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  24.83 
 
 
494 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3795  peptidase M16-like  23.83 
 
 
448 aa  137  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.417189  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  23.83 
 
 
457 aa  137  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  25.58 
 
 
477 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  23.86 
 
 
444 aa  136  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  24.46 
 
 
444 aa  136  9e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  22.84 
 
 
437 aa  136  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  26.64 
 
 
496 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  22.22 
 
 
454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  24.05 
 
 
947 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  27.02 
 
 
437 aa  134  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0705  peptidase M16 domain protein  24.59 
 
 
427 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  23.9 
 
 
952 aa  134  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  23.41 
 
 
959 aa  133  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  25.12 
 
 
462 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1483  peptidase M16-like  25 
 
 
515 aa  133  6e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0660842  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3239  zinc protease  24.77 
 
 
427 aa  133  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00842119  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>