More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1347 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1347  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
426 aa  857    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4631  peptidase M16 domain-containing protein  39.1 
 
 
457 aa  288  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  33.87 
 
 
929 aa  265  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2273  peptidase M16 domain-containing protein  34.22 
 
 
438 aa  169  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.359911  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  28.92 
 
 
937 aa  162  8.000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  28.36 
 
 
945 aa  156  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  30.75 
 
 
876 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  29.68 
 
 
896 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  24.54 
 
 
934 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  26.03 
 
 
918 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  29.3 
 
 
457 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  30.02 
 
 
464 aa  140  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  29.88 
 
 
429 aa  139  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  27.72 
 
 
948 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  29.85 
 
 
486 aa  138  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  28.95 
 
 
464 aa  137  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  28.73 
 
 
465 aa  136  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  26.52 
 
 
921 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  27.04 
 
 
451 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  25.45 
 
 
454 aa  134  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  30.83 
 
 
477 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0109  peptidase M16 domain protein  27.89 
 
 
456 aa  133  5e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3546  peptidase M16 domain-containing protein  33.85 
 
 
436 aa  133  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.984037  normal  0.12163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2345  peptidase M16 domain protein  25.97 
 
 
490 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.854323 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0621  peptidase M16-like  25.44 
 
 
725 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  28.53 
 
 
460 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  29.83 
 
 
495 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  27.1 
 
 
444 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  29.47 
 
 
462 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  26.67 
 
 
446 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  28.64 
 
 
497 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  28.89 
 
 
496 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  30.18 
 
 
435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  29.07 
 
 
494 aa  129  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  29.12 
 
 
495 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  26.86 
 
 
942 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  27.75 
 
 
957 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0931  insulinase-like peptidase  26.89 
 
 
528 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0647883  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  28 
 
 
437 aa  127  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  29.57 
 
 
462 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0893  peptidase M16 domain-containing protein  28.44 
 
 
451 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0504062  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5951  peptidase M16 domain protein  26.73 
 
 
426 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  26.05 
 
 
949 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1280  peptidase M16-like  28.44 
 
 
461 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  25.62 
 
 
945 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  29 
 
 
479 aa  124  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  28.87 
 
 
450 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  26.08 
 
 
434 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  28.61 
 
 
456 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1483  peptidase M16-like  26.11 
 
 
515 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0660842  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0388  putative Zinc protease-like signal peptide protein  29.12 
 
 
447 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886206  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  28.35 
 
 
495 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0243  peptidase M16 domain protein  27.64 
 
 
450 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  25.77 
 
 
434 aa  121  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  26.91 
 
 
767 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4248  peptidase M16 domain protein  27 
 
 
426 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  28.84 
 
 
495 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2329  peptidase M16 domain-containing protein  26.89 
 
 
427 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.504761  normal  0.793459 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  25.77 
 
 
434 aa  120  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  27.7 
 
 
441 aa  120  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  25.6 
 
 
919 aa  120  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0283  peptidase M16-like protein  26.59 
 
 
454 aa  120  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0571104  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  28.46 
 
 
495 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0496  processing peptidase  26.63 
 
 
903 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000425054  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0172  peptidase M16 domain protein  28.53 
 
 
441 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0336  peptidase M16, C-terminal  30.31 
 
 
453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.469062  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2606  peptidase M16 domain protein  26.63 
 
 
427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1670  peptidase M16-like  29.48 
 
 
471 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  28.53 
 
 
447 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  28.35 
 
 
439 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  28.35 
 
 
439 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0178  peptidase M16 domain protein  25.76 
 
 
421 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0738  peptidase M16 domain-containing protein  25.83 
 
 
506 aa  116  8.999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02700  putative metallopeptidase, M16 family protein  25.33 
 
 
687 aa  115  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1783  peptidase M16 domain-containing protein  25.66 
 
 
504 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  27.01 
 
 
457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  26.82 
 
 
436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3239  zinc protease  23.95 
 
 
427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00842119  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  26.35 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2106  M16 family peptidase  27.27 
 
 
443 aa  114  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2284  peptidase M16 domain protein  26.89 
 
 
427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.538642 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0218  non-proteolytic protein, peptidase family M16  27.27 
 
 
443 aa  114  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  27.74 
 
 
494 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  29.84 
 
 
453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2864  peptidase M16 domain protein  28.16 
 
 
435 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0431623 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  33.21 
 
 
439 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3618  peptidase M16 domain protein  30.73 
 
 
467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  23.06 
 
 
969 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  28.04 
 
 
439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0431  peptidase M16-like  28.88 
 
 
451 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  24.8 
 
 
483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0705  peptidase M16 domain protein  24.14 
 
 
427 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0121  peptidase M16 domain protein  27.65 
 
 
520 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0110  peptidase M16 domain protein  28.09 
 
 
520 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.282099  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06880  predicted Zn-dependent peptidase  28.69 
 
 
462 aa  110  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408528  normal  0.0872557 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  23.36 
 
 
482 aa  110  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0395  peptidase M16 domain protein  28.19 
 
 
437 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412071  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  28.01 
 
 
435 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  26.46 
 
 
474 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0103  peptidase M16-like  27.49 
 
 
519 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.968685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>