More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1592 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1594  M16 family peptidase  77.51 
 
 
418 aa  679    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.326709  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1592  peptidase M16-like  100 
 
 
418 aa  857    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0267121  normal  0.0196738 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1907  peptidase M16 domain-containing protein  68.97 
 
 
419 aa  600  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0978353  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2975  peptidase M16 domain protein  68.72 
 
 
418 aa  596  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000177641 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1309  peptidase M16 domain protein  68.72 
 
 
418 aa  593  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00910612  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2117  processing peptidase  53.81 
 
 
429 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1839  processing peptidase  51.95 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1562  Zn-dependent peptidase  49.14 
 
 
419 aa  423  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000390885  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1235  processing peptidase  46.57 
 
 
418 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3667  peptidase M16 domain protein  42.93 
 
 
424 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1059  peptidase M16-like  44.31 
 
 
421 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0076042  hitchhiker  0.00221195 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0936  peptidase M16 domain-containing protein  44.8 
 
 
420 aa  365  1e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.891405  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2056  peptidase M16 domain protein  44.58 
 
 
413 aa  362  9e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1163  processing peptidase  42.48 
 
 
413 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0385172  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3546  zinc protease  42.82 
 
 
413 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3852  zinc protease, insulinase family  42.82 
 
 
413 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000305728  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3564  zinc protease  43.07 
 
 
413 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3843  zinc protease  42.82 
 
 
413 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3656  zinc protease  42.82 
 
 
413 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.200109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3816  zinc protease, insulinase family  42.82 
 
 
413 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3942  zinc protease  42.82 
 
 
413 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3627  peptidase M16 domain-containing protein  43.07 
 
 
413 aa  355  1e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3903  zinc protease, insulinase family  42.57 
 
 
413 aa  352  5e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141801  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2457  peptidase M16 domain-containing protein  41.12 
 
 
412 aa  348  8e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0190406  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3177  peptidase M16 domain protein  43.56 
 
 
422 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.56337  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1568  peptidase M16-like  41.67 
 
 
425 aa  345  6e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000011969  decreased coverage  0.00224891 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1706  peptidase M16 domain protein  40.39 
 
 
411 aa  345  7e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.425033  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1653  peptidase M16 domain protein  43.07 
 
 
418 aa  342  5e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1341  zinc protease, insulinase family  42.93 
 
 
399 aa  339  5e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.411991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7875  processing peptidase  41.83 
 
 
439 aa  337  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0597317 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1453  peptidase M16 domain protein  41.08 
 
 
417 aa  335  7e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.093065 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1444  processing peptidase  42.16 
 
 
421 aa  331  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1382  peptidase M16 domain-containing protein  42.09 
 
 
466 aa  330  3e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.975318  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0785  mitochondrial processing peptidase  41.15 
 
 
462 aa  328  9e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.346548  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0419  peptidase M16-like protein  40.63 
 
 
419 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1507  peptidase M16 domain-containing protein  42.48 
 
 
451 aa  325  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.583967  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2477  peptidase M16 domain protein  41.13 
 
 
445 aa  324  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424609  normal  0.386088 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1947  peptidase M16 domain-containing protein  40.3 
 
 
422 aa  322  7e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141516  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1340  peptidase M16 domain-containing protein  40.39 
 
 
462 aa  322  7e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000321073 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3323  processing peptidase  40.44 
 
 
441 aa  322  8e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390474  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1069  peptidase M16 domain-containing protein  38.69 
 
 
435 aa  318  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.421262  hitchhiker  0.00357472 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1315  peptidase M16 domain protein  40.86 
 
 
418 aa  317  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4022  peptidase M16 domain-containing protein  39.95 
 
 
424 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0571342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5111  peptidase M16 domain-containing protein  39.75 
 
 
438 aa  313  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591794  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1218  peptidase M16 domain protein  40.29 
 
 
442 aa  311  2e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.37886  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14700  predicted Zn-dependent peptidase  40.15 
 
 
453 aa  311  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.2427  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2351  peptidase M16 domain-containing protein  39.66 
 
 
451 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472755 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3953  peptidase M16 domain protein  40.53 
 
 
459 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870658  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0678  peptidase M16 domain-containing protein  38.97 
 
 
424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.614007  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3554  processing peptidase  40.05 
 
 
467 aa  306  3e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106365  normal  0.417448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3233  peptidase M16 domain protein  40.39 
 
 
426 aa  306  5.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3176  peptidase M16 domain-containing protein  40.85 
 
 
453 aa  306  6e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12795  zinc protease pepR  39.85 
 
 
438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0037  processing peptidase  39.29 
 
 
424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3148  processing peptidase  41.89 
 
 
419 aa  303  3.0000000000000004e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  0.591857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2133  peptidase M16 domain protein  39.04 
 
 
436 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.765752 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0910  processing peptidase  37.65 
 
 
422 aa  301  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1190  peptidase M16 domain-containing protein  39.65 
 
 
477 aa  300  3e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0547363  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23370  predicted Zn-dependent peptidase  39.65 
 
 
441 aa  300  4e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0226628 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1519  peptidase M16 domain protein  41.21 
 
 
441 aa  299  7e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1467  peptidase M16 domain protein  38.21 
 
 
457 aa  298  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5822  peptidase M16 domain protein  42.02 
 
 
461 aa  297  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1440  peptidase M16 domain protein  38.68 
 
 
447 aa  297  3e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000448085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2084  peptidase M16 domain-containing protein  38.18 
 
 
429 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2101  peptidase M16-like protein  38.18 
 
 
429 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0527778  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1435  peptidase M16 domain-containing protein  38.25 
 
 
447 aa  296  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4314  peptidase M16 domain-containing protein  40.29 
 
 
421 aa  296  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518498  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2147  peptidase M16 domain-containing protein  38.18 
 
 
429 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494136  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07110  predicted Zn-dependent peptidase  40.26 
 
 
439 aa  295  7e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.54818  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1419  processing peptidase  35.05 
 
 
424 aa  293  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1786  processing peptidase  38.85 
 
 
421 aa  293  3e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.41523  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3582  peptidase M16 domain protein  40.55 
 
 
444 aa  293  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0621  processing peptidase  38.83 
 
 
419 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1026  processing peptidase  38.56 
 
 
439 aa  290  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2329  peptidase  39.18 
 
 
420 aa  290  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124129  normal  0.969107 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1637  processing peptidase  33.66 
 
 
418 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0481  processing peptidase  39.34 
 
 
419 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130826  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1832  M16 family peptidase  39.34 
 
 
419 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0397  peptidase M16 domain-containing protein  36.91 
 
 
431 aa  286  7e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3234  processing peptidase  39.8 
 
 
421 aa  285  9e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1147  processing peptidase  39.1 
 
 
426 aa  283  6.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4577  peptidase M16-like  35.86 
 
 
429 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2620  peptidase M16 domain-containing protein  37.01 
 
 
422 aa  280  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136175  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0908  peptidase M16 domain protein  35.35 
 
 
429 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4796  peptidase M16-like  34.1 
 
 
429 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1739  peptidase M16 domain protein  38.6 
 
 
443 aa  280  5e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0823  peptidase M16-like  35.62 
 
 
429 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2222  peptidase M16 domain protein  36.54 
 
 
451 aa  279  7e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000128075  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1252  peptidase M16 domain protein  37.43 
 
 
421 aa  275  8e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3525  peptidase M16 domain-containing protein  37.2 
 
 
421 aa  274  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.855558  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1074  peptidase family M16  37.77 
 
 
434 aa  272  6e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0737  M16 family peptidase putative  36.12 
 
 
423 aa  271  1e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1511  peptidase M16 domain protein  36.14 
 
 
424 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.402742 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0535  processing peptidase  35.77 
 
 
434 aa  269  8.999999999999999e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0840  putative zinc protease  35.75 
 
 
429 aa  268  8.999999999999999e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0309  processing peptidase  37.75 
 
 
421 aa  268  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0115276 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0721  peptidase M16 domain-containing protein  37.5 
 
 
421 aa  268  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.257658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1147  peptidase M16 domain-containing protein  35.07 
 
 
431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0759  peptidase M16-like  36.02 
 
 
430 aa  265  8.999999999999999e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0175  M16 family peptidase  35.91 
 
 
423 aa  265  1e-69  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>