More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0578 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2535  GTP-binding protein TypA  52.95 
 
 		 642 aa  655    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000592047 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1122  GTP-binding protein TypA  55.48 
 
 		 633 aa  645    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1107  GTP-binding protein TypA  60.1 
 
 		 617 aa  718    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00406487  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1133  GTP-binding protein TypA  54.82 
 
 		 630 aa  656    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19530  GTP-binding protein TypA/BipA  56.08 
 
 		 629 aa  685    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2515  normal  0.0383098 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0962  GTP-binding protein TypA  54.47 
 
 		 645 aa  651    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0622618  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0759  GTP-binding protein TypA  55.59 
 
 		 633 aa  669    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00250463  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4316  GTP-binding protein TypA  56.34 
 
 		 624 aa  689    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2456  GTP-binding protein TypA  57.19 
 
 		 650 aa  694    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0793  GTP-binding protein TypA  54.96 
 
 		 635 aa  662    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2766  GTP-binding protein TypA  59.7 
 
 		 617 aa  711    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.254596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7974  GTP-binding protein TypA  55.83 
 
 		 617 aa  688    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427033  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2006  GTP-binding protein TypA  54.98 
 
 		 620 aa  660    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3865  GTP-binding protein TypA  59.07 
 
 		 620 aa  710    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0864  GTP-binding protein TypA  58.9 
 
 		 613 aa  702    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3113  GTP-binding protein TypA  56.14 
 
 		 620 aa  673    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218846  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3360  GTP-binding protein TypA  54.5 
 
 		 622 aa  646    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.957899  hitchhiker  0.00356234 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3837  GTP-binding protein TypA  55.37 
 
 		 630 aa  679    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712464  normal  0.953349 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0987  GTP-binding protein TypA  56.43 
 
 		 645 aa  676    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0410239  normal  0.953039 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3132  GTP-binding protein TypA  54.81 
 
 		 641 aa  656    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26090  GTP-binding protein TypA/BipA  52.86 
 
 		 636 aa  652    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.876916 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1268  GTP-binding protein TypA  56.73 
 
 		 629 aa  696    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352532  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15530  small GTP-binding protein domain protein  53.88 
 
 		 636 aa  651    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2817  GTP-binding protein TypA  52.66 
 
 		 642 aa  666    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.664891  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0578  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 609 aa  1199    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0310674  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0751  GTP-binding protein TypA  53.24 
 
 		 630 aa  655    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4060  GTP-binding protein TypA  55.05 
 
 		 631 aa  657    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0939929  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31160  GTP-binding protein TypA/BipA  58.54 
 
 		 640 aa  688    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11090  GTP-binding protein TypA/BipA  52.3 
 
 		 640 aa  630  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0960389  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2431  GTP-binding protein TypA  52.19 
 
 		 608 aa  622  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.318705  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  51.09 
 
 		 614 aa  624  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11190  GTP-binding translation elongation factor typA  53.76 
 
 		 628 aa  621  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 		 606 aa  619  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0246  membrane GTPase for stress response  50 
 
 		 643 aa  614  9.999999999999999e-175  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.107779  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4540  GTP-binding protein TypA  51.69 
 
 		 634 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3331  GTP-binding protein TypA  51.77 
 
 		 636 aa  608  1e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.446831  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2163  GTP-binding protein TypA  52.12 
 
 		 642 aa  611  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  50.34 
 
 		 605 aa  610  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4040  GTP-binding protein TypA  52.12 
 
 		 633 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0480  GTP-binding protein TypA  49.21 
 
 		 641 aa  606  9.999999999999999e-173  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4269  GTP-binding protein TypA  52.12 
 
 		 633 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4115  GTP-binding protein TypA  52.12 
 
 		 633 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1144  GTP-binding protein TypA  50.65 
 
 		 635 aa  603  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  50 
 
 		 605 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  50.49 
 
 		 613 aa  601  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  49.08 
 
 		 616 aa  601  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  49.16 
 
 		 608 aa  595  1e-169  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1843  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 		 614 aa  596  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  49 
 
 		 610 aa  597  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0678  GTP-binding protein TypA  51.97 
 
 		 594 aa  596  1e-169  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0381513  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  50.51 
 
 		 593 aa  594  1e-168  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0969  GTP-binding protein TypA  50.26 
 
 		 613 aa  589  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  50.08 
 
 		 610 aa  591  1e-167  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  48.59 
 
 		 608 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  50 
 
 		 605 aa  590  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  49.58 
 
 		 603 aa  585  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0462  GTP-binding protein TypA  48.67 
 
 		 608 aa  587  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  50.75 
 
 		 632 aa  585  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  52.22 
 
 		 594 aa  587  1e-166  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  50.75 
 
 		 605 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  49.92 
 
 		 627 aa  583  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1891  GTP-binding protein TypA  49.67 
 
 		 615 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  48.75 
 
 		 602 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  48.48 
 
 		 596 aa  583  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1239  GTP-binding protein TypA  48.5 
 
 		 611 aa  584  1.0000000000000001e-165  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  50.26 
 
 		 608 aa  582  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0169  GTP-binding protein TypA  50.08 
 
 		 607 aa  580  1e-164  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0204  GTP-binding protein TypA  49.5 
 
 		 605 aa  581  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.672165  normal  0.152752 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  49.91 
 
 		 592 aa  580  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  49.67 
 
 		 615 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1430  GTP-binding protein TypA  50 
 
 		 609 aa  579  1e-164  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000885386  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0339  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 		 608 aa  579  1e-164  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0649933 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1976  GTP-binding protein TypA  49.67 
 
 		 615 aa  581  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.796307  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  49.58 
 
 		 598 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  47.18 
 
 		 608 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000244002  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1217  GTP-binding protein TypA  49.92 
 
 		 606 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0822  GTP-binding protein TypA  48.51 
 
 		 612 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.447819 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1306  GTP-binding protein TypA  49.83 
 
 		 607 aa  577  1.0000000000000001e-163  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2303  GTP-binding protein TypA  48.68 
 
 		 610 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0308778  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  48.5 
 
 		 623 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  48.15 
 
 		 610 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  47.99 
 
 		 610 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  48.58 
 
 		 603 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0318  GTP-binding protein TypA  51.17 
 
 		 595 aa  574  1.0000000000000001e-162  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  48.68 
 
 		 608 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4202  GTP-binding protein TypA  48.81 
 
 		 597 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  47.87 
 
 		 598 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  48.84 
 
 		 608 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  47.74 
 
 		 602 aa  575  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1533  GTP-binding protein TypA  49.08 
 
 		 614 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.445026  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  48.04 
 
 		 598 aa  575  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  48.68 
 
 		 608 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3551  GTP-binding protein TypA  48.72 
 
 		 597 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119172 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  48.68 
 
 		 608 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1126  GTP-binding protein TypA  49.92 
 
 		 606 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.563047 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  47.87 
 
 		 598 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  48.84 
 
 		 608 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  48.68 
 
 		 608 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  49.23 
 
 		 596 aa  572  1.0000000000000001e-162  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4241  GTP-binding protein TypA  48.81 
 
 		 597 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  hitchhiker  0.000558258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>