More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2163 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4269  GTP-binding protein TypA  95.26 
 
 
633 aa  1191    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0864  GTP-binding protein TypA  64.91 
 
 
613 aa  795    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2535  GTP-binding protein TypA  66.83 
 
 
642 aa  823    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000592047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4316  GTP-binding protein TypA  65.35 
 
 
624 aa  824    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279225  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7974  GTP-binding protein TypA  66.35 
 
 
617 aa  836    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427033  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2006  GTP-binding protein TypA  61.65 
 
 
620 aa  752    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2163  GTP-binding protein TypA  100 
 
 
642 aa  1296    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1144  GTP-binding protein TypA  80.48 
 
 
635 aa  997    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416962  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3132  GTP-binding protein TypA  66.14 
 
 
641 aa  811    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0751  GTP-binding protein TypA  66.25 
 
 
630 aa  823    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2456  GTP-binding protein TypA  65.83 
 
 
650 aa  832    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1122  GTP-binding protein TypA  66.14 
 
 
633 aa  801    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4540  GTP-binding protein TypA  97.46 
 
 
634 aa  1244    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19530  GTP-binding protein TypA/BipA  65.26 
 
 
629 aa  823    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2515  normal  0.0383098 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0480  GTP-binding protein TypA  62.17 
 
 
641 aa  763    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0246  membrane GTPase for stress response  61.22 
 
 
643 aa  760    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.107779  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0759  GTP-binding protein TypA  71.56 
 
 
633 aa  907    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00250463  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3865  GTP-binding protein TypA  63.87 
 
 
620 aa  790    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15530  small GTP-binding protein domain protein  67.68 
 
 
636 aa  836    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11090  GTP-binding protein TypA/BipA  66.72 
 
 
640 aa  829    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0960389  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11190  GTP-binding translation elongation factor typA  85.11 
 
 
628 aa  1034    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0987  GTP-binding protein TypA  66.56 
 
 
645 aa  821    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0410239  normal  0.953039 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0962  GTP-binding protein TypA  67.56 
 
 
645 aa  831    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0622618  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3113  GTP-binding protein TypA  63.82 
 
 
620 aa  803    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218846  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3331  GTP-binding protein TypA  80.38 
 
 
636 aa  997    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.446831  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0793  GTP-binding protein TypA  68.69 
 
 
635 aa  838    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2766  GTP-binding protein TypA  64.66 
 
 
617 aa  789    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.254596 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1133  GTP-binding protein TypA  67.82 
 
 
630 aa  826    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4040  GTP-binding protein TypA  95.26 
 
 
633 aa  1191    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3837  GTP-binding protein TypA  66.19 
 
 
630 aa  823    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712464  normal  0.953349 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1107  GTP-binding protein TypA  66.67 
 
 
617 aa  827    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00406487  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26090  GTP-binding protein TypA/BipA  67.39 
 
 
636 aa  833    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.876916 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1268  GTP-binding protein TypA  62.44 
 
 
629 aa  784    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352532  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3360  GTP-binding protein TypA  65.75 
 
 
622 aa  798    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.957899  hitchhiker  0.00356234 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2817  GTP-binding protein TypA  66.46 
 
 
642 aa  831    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.664891  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4060  GTP-binding protein TypA  66.03 
 
 
631 aa  826    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0939929  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31160  GTP-binding protein TypA/BipA  69.89 
 
 
640 aa  899    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4115  GTP-binding protein TypA  95.26 
 
 
633 aa  1191    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  52.5 
 
 
608 aa  630  1e-179  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  52.09 
 
 
605 aa  620  1e-176  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  52.44 
 
 
594 aa  605  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2431  GTP-binding protein TypA  50.8 
 
 
608 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.318705  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0578  GTP-binding protein TypA  52.17 
 
 
609 aa  601  1e-170  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0310674  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  51.05 
 
 
593 aa  596  1e-169  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  48.81 
 
 
614 aa  590  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  50.24 
 
 
616 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0678  GTP-binding protein TypA  50.41 
 
 
594 aa  581  1e-164  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0381513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1891  GTP-binding protein TypA  49.37 
 
 
615 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  46.75 
 
 
616 aa  580  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  49.37 
 
 
615 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1976  GTP-binding protein TypA  49.37 
 
 
615 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.796307  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  47.79 
 
 
614 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  47.79 
 
 
614 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  47.79 
 
 
614 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  47.79 
 
 
614 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3971  GTP-binding protein TypA  47.79 
 
 
614 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4075  GTP-binding protein TypA  47.79 
 
 
614 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000478887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  47.79 
 
 
614 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1181  GTP-binding protein TypA  47.79 
 
 
614 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15687  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  48.97 
 
 
605 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  47.95 
 
 
614 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4059  GTP-binding protein TypA  47.79 
 
 
614 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124295  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0462  GTP-binding protein TypA  49.04 
 
 
608 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  47.79 
 
 
614 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  47.52 
 
 
608 aa  565  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4094  GTP-binding protein TypA  46.34 
 
 
607 aa  562  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  48.03 
 
 
599 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0864  GTP-binding protein TypA  47.92 
 
 
619 aa  560  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  48.28 
 
 
602 aa  560  1e-158  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4241  GTP-binding protein TypA  47.95 
 
 
597 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  hitchhiker  0.000558258 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4202  GTP-binding protein TypA  47.95 
 
 
597 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1843  GTP-binding protein TypA  48.8 
 
 
614 aa  559  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4219  GTP-binding protein TypA  46.58 
 
 
607 aa  556  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  46.35 
 
 
615 aa  558  1e-157  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4502  GTP-binding protein TypA  46.41 
 
 
607 aa  557  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.622829  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  47.13 
 
 
600 aa  557  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  46.99 
 
 
613 aa  558  1e-157  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  47.67 
 
 
603 aa  555  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4155  GTP-binding protein TypA  46.5 
 
 
607 aa  558  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.785099  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  47.62 
 
 
600 aa  556  1e-157  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3958  GTP-binding protein TypA  46.34 
 
 
607 aa  555  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.41781  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2298  membrane GTPase for stress response  47.54 
 
 
613 aa  556  1e-157  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0771  GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)  47.38 
 
 
615 aa  555  1e-157  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0726544  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0822  GTP-binding protein TypA  49.05 
 
 
612 aa  556  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.447819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  47.61 
 
 
613 aa  552  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  46.48 
 
 
598 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  46.48 
 
 
598 aa  554  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1239  GTP-binding protein TypA  48.15 
 
 
611 aa  554  1e-156  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  47.13 
 
 
610 aa  555  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  47.38 
 
 
610 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  47.51 
 
 
603 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  47.51 
 
 
603 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  47.27 
 
 
603 aa  553  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  47.67 
 
 
603 aa  552  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  46.48 
 
 
598 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1010  GTP-binding protein TypA  49.11 
 
 
613 aa  550  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  48.33 
 
 
608 aa  549  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  47.76 
 
 
608 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  47.5 
 
 
605 aa  549  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4240  GTP-binding protein  46.1 
 
 
607 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.7005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>