More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1144 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0759  GTP-binding protein TypA  74.6 
 
 		 633 aa  942    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00250463  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7974  GTP-binding protein TypA  66.45 
 
 		 617 aa  843    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427033  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2163  GTP-binding protein TypA  80.91 
 
 		 642 aa  1008    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2006  GTP-binding protein TypA  60.25 
 
 		 620 aa  737    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1144  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 635 aa  1281    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416962  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0751  GTP-binding protein TypA  66.51 
 
 		 630 aa  833    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31160  GTP-binding protein TypA/BipA  70.11 
 
 		 640 aa  892    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0246  membrane GTPase for stress response  62.07 
 
 		 643 aa  775    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.107779  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3360  GTP-binding protein TypA  66.72 
 
 		 622 aa  828    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.957899  hitchhiker  0.00356234 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4269  GTP-binding protein TypA  82.84 
 
 		 633 aa  1022    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11190  GTP-binding translation elongation factor typA  79.84 
 
 		 628 aa  973    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2456  GTP-binding protein TypA  67.2 
 
 		 650 aa  846    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1122  GTP-binding protein TypA  68.04 
 
 		 633 aa  823    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3113  GTP-binding protein TypA  66.88 
 
 		 620 aa  836    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218846  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4316  GTP-binding protein TypA  67.42 
 
 		 624 aa  834    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0962  GTP-binding protein TypA  69.5 
 
 		 645 aa  848    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0622618  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2766  GTP-binding protein TypA  65.91 
 
 		 617 aa  811    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.254596 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3865  GTP-binding protein TypA  64.1 
 
 		 620 aa  795    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19530  GTP-binding protein TypA/BipA  66.35 
 
 		 629 aa  844    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2515  normal  0.0383098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3837  GTP-binding protein TypA  68.26 
 
 		 630 aa  857    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712464  normal  0.953349 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1133  GTP-binding protein TypA  67.78 
 
 		 630 aa  826    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0793  GTP-binding protein TypA  70.21 
 
 		 635 aa  867    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4040  GTP-binding protein TypA  82.84 
 
 		 633 aa  1022    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1268  GTP-binding protein TypA  61.62 
 
 		 629 aa  786    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352532  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2535  GTP-binding protein TypA  68.76 
 
 		 642 aa  851    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000592047 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26090  GTP-binding protein TypA/BipA  68.93 
 
 		 636 aa  850    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.876916 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11090  GTP-binding protein TypA/BipA  67.93 
 
 		 640 aa  849    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0960389  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3331  GTP-binding protein TypA  87.54 
 
 		 636 aa  1075    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.446831  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15530  small GTP-binding protein domain protein  68.92 
 
 		 636 aa  855    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0864  GTP-binding protein TypA  65.54 
 
 		 613 aa  808    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2817  GTP-binding protein TypA  68.15 
 
 		 642 aa  856    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.664891  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1107  GTP-binding protein TypA  66.77 
 
 		 617 aa  835    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00406487  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0987  GTP-binding protein TypA  69.62 
 
 		 645 aa  852    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0410239  normal  0.953039 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4060  GTP-binding protein TypA  66.61 
 
 		 631 aa  839    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0939929  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3132  GTP-binding protein TypA  67.04 
 
 		 641 aa  838    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4115  GTP-binding protein TypA  82.84 
 
 		 633 aa  1022    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4540  GTP-binding protein TypA  80.25 
 
 		 634 aa  1030    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0480  GTP-binding protein TypA  61.13 
 
 		 641 aa  771    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  51.79 
 
 		 608 aa  628  1e-178  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  52.26 
 
 		 605 aa  619  1e-176  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0578  GTP-binding protein TypA  50.73 
 
 		 609 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0310674  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  52.8 
 
 		 594 aa  600  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0678  GTP-binding protein TypA  50.99 
 
 		 594 aa  596  1e-169  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0381513  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2431  GTP-binding protein TypA  50.71 
 
 		 608 aa  596  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.318705  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  48.88 
 
 		 614 aa  590  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  50.73 
 
 		 593 aa  588  1e-166  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  50.72 
 
 		 616 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  49.6 
 
 		 605 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  49.84 
 
 		 605 aa  580  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0462  GTP-binding protein TypA  49.76 
 
 		 608 aa  581  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  49.84 
 
 		 632 aa  579  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  47.12 
 
 		 616 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1891  GTP-binding protein TypA  49.29 
 
 		 615 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  48.97 
 
 		 615 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1976  GTP-binding protein TypA  49.29 
 
 		 615 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.796307  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  49.03 
 
 		 605 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0864  GTP-binding protein TypA  48.16 
 
 		 619 aa  569  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  48.94 
 
 		 608 aa  570  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  47.9 
 
 		 601 aa  568  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4075  GTP-binding protein TypA  48.24 
 
 		 614 aa  566  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000478887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  48.24 
 
 		 614 aa  566  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  47.92 
 
 		 614 aa  568  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  48.24 
 
 		 614 aa  566  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  48.24 
 
 		 614 aa  566  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  48.24 
 
 		 614 aa  567  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3971  GTP-binding protein TypA  48.24 
 
 		 614 aa  566  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1181  GTP-binding protein TypA  48.24 
 
 		 614 aa  567  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  48.06 
 
 		 602 aa  566  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  47.02 
 
 		 598 aa  565  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  48.24 
 
 		 614 aa  566  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  49.1 
 
 		 597 aa  566  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4059  GTP-binding protein TypA  48.24 
 
 		 614 aa  567  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124295  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  48.24 
 
 		 614 aa  565  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  47.7 
 
 		 599 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  47.6 
 
 		 610 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  47.76 
 
 		 610 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  47.58 
 
 		 601 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  47.29 
 
 		 608 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  47.18 
 
 		 598 aa  561  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  47.13 
 
 		 602 aa  559  1e-158  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  48.42 
 
 		 608 aa  561  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  49.6 
 
 		 608 aa  561  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0771  GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)  47.78 
 
 		 615 aa  559  1e-158  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0726544  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  48.87 
 
 		 610 aa  556  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  47.78 
 
 		 608 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  47.78 
 
 		 608 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  47.78 
 
 		 608 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  46.27 
 
 		 606 aa  555  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  48.79 
 
 		 608 aa  557  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  46.97 
 
 		 600 aa  558  1e-157  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0822  GTP-binding protein TypA  49.27 
 
 		 612 aa  557  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.447819 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  47.78 
 
 		 608 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  46.88 
 
 		 598 aa  557  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  47.94 
 
 		 608 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  47.78 
 
 		 608 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  47.44 
 
 		 600 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  47.94 
 
 		 608 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4502  GTP-binding protein TypA  46.82 
 
 		 607 aa  555  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.622829  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4880  GTP-binding protein TypA  47.01 
 
 		 607 aa  557  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4219  GTP-binding protein  47.17 
 
 		 607 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>