More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0542 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0542  Oligopeptidase B  100 
 
 
690 aa  1368    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.586621  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  37.94 
 
 
686 aa  395  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  35.97 
 
 
682 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  38.48 
 
 
706 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  32.89 
 
 
686 aa  383  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  38.48 
 
 
706 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  36.78 
 
 
688 aa  382  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  38.72 
 
 
706 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  34.18 
 
 
711 aa  381  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  33.68 
 
 
688 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  36.31 
 
 
683 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  33.38 
 
 
686 aa  372  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  36.26 
 
 
683 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  35.93 
 
 
698 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  34.76 
 
 
698 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  33.92 
 
 
683 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  33.04 
 
 
705 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  33.92 
 
 
683 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  33.92 
 
 
683 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  34.17 
 
 
711 aa  371  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  35.13 
 
 
683 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  35.23 
 
 
690 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  36.47 
 
 
683 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  35.57 
 
 
695 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  34.17 
 
 
696 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03460  oligopeptidase B  36.31 
 
 
703 aa  364  2e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  32.73 
 
 
721 aa  364  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  36.52 
 
 
726 aa  363  4e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  36.47 
 
 
683 aa  363  6e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  35.02 
 
 
686 aa  362  2e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  35.33 
 
 
680 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  36.66 
 
 
719 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  32.34 
 
 
671 aa  357  5e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5137  oligopeptidase B  35.51 
 
 
712 aa  357  5e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613036  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  35.8 
 
 
686 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  34.25 
 
 
677 aa  354  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  33.38 
 
 
696 aa  354  2.9999999999999997e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  34.62 
 
 
709 aa  353  4e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  35.69 
 
 
680 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  36.34 
 
 
678 aa  353  5e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1617  oligopeptidase B  36.43 
 
 
706 aa  353  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  32.54 
 
 
719 aa  353  7e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  34.94 
 
 
696 aa  352  8.999999999999999e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4763  oligopeptidase B  33.67 
 
 
722 aa  353  8.999999999999999e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  35.45 
 
 
680 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32900  Oligopeptidase B protein  36.21 
 
 
682 aa  352  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  33.14 
 
 
715 aa  350  7e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  35.4 
 
 
685 aa  347  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1464  oligopeptidase B  37 
 
 
693 aa  343  5.999999999999999e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  35.54 
 
 
710 aa  342  9e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  33.83 
 
 
685 aa  343  9e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  35.55 
 
 
680 aa  343  9e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16430  protease II  36.64 
 
 
726 aa  340  5e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.33763  normal  0.0433895 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  32.11 
 
 
697 aa  340  5e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  32.33 
 
 
725 aa  339  9.999999999999999e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0144  oligopeptidase B  35.43 
 
 
703 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  33.68 
 
 
691 aa  338  2.9999999999999997e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0836  Oligopeptidase B  33.04 
 
 
690 aa  337  5e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1343  protease 2  34.35 
 
 
686 aa  337  5.999999999999999e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.790431  normal  0.26509 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  33.72 
 
 
702 aa  336  7e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  36.01 
 
 
696 aa  336  7e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2579  protease 2  34.21 
 
 
686 aa  336  9e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.639161  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  33.91 
 
 
702 aa  335  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0135  oligopeptidase B  34.3 
 
 
711 aa  334  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1399  oligopeptidase B  34.38 
 
 
684 aa  334  4e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357658  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1787  protease 2  33.78 
 
 
686 aa  333  5e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.13117 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2073  protease 2  34.21 
 
 
686 aa  333  5e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  33.78 
 
 
686 aa  333  5e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0437  oligopeptidase B  33.43 
 
 
691 aa  332  1e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.365567  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  34.49 
 
 
702 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  35.2 
 
 
702 aa  332  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01816  protease II  34.06 
 
 
686 aa  332  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01804  hypothetical protein  34.06 
 
 
686 aa  332  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1245  protease 2  34.31 
 
 
683 aa  332  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  33.24 
 
 
701 aa  331  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  33.19 
 
 
711 aa  330  4e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  34.85 
 
 
678 aa  330  6e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3026  protease II  30.99 
 
 
704 aa  330  7e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2038  protease 2  34.16 
 
 
683 aa  330  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.387089  normal  0.101545 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  33.19 
 
 
711 aa  330  7e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0109  Oligopeptidase B  33.6 
 
 
782 aa  329  8e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  34.57 
 
 
709 aa  329  9e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1370  protease 2  34.16 
 
 
683 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364308  hitchhiker  0.00000000160982 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2033  protease 2  34.16 
 
 
683 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2093  protease 2  34.16 
 
 
683 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.559794  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  33.53 
 
 
700 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  33.19 
 
 
711 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1797  Oligopeptidase B  33.92 
 
 
686 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4371  oligopeptidase B  32.95 
 
 
729 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0132  oligopeptidase B  32.85 
 
 
716 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  35.88 
 
 
698 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  33.05 
 
 
711 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  34.64 
 
 
702 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0144  protease II  32.86 
 
 
700 aa  325  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0135  oligopeptidase B  33.24 
 
 
711 aa  326  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.231322 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0136  oligopeptidase B  33.24 
 
 
711 aa  325  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0268176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0130  oligopeptidase B  33.09 
 
 
711 aa  324  3e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1423  oligopeptidase B  33.86 
 
 
697 aa  323  5e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0258557 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17850  oligopeptidase B  32.8 
 
 
748 aa  323  7e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.652383  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0821  oligopeptidase B  34.22 
 
 
717 aa  321  3e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>