More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_00072 on replicon BN001308
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00072  pseudouridine synthase (AFU_orthologue; AFUA_5G12310)  100 
 
 		 392 aa  799    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01370  pseudouridylate synthase 4, putative  37.25 
 
 		 443 aa  197  3e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63360  predicted protein  35.99 
 
 		 397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0493336 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11965  predicted protein  51.97 
 
 		 194 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  34.74 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1642  tRNA pseudouridine synthase B  38.34 
 
 		 283 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2418  tRNA pseudouridine synthase B  37.37 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0980712  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1973  tRNA pseudouridine synthase B  46.4 
 
 		 558 aa  116  7.999999999999999e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1222  tRNA pseudouridine synthase B  47.62 
 
 		 294 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.732593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  37.97 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0823  tRNA pseudouridine synthase B  35.26 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.939729  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0491  tRNA pseudouridine synthase B  36.02 
 
 		 314 aa  112  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.164014  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  35.83 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  34.85 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  36.84 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3473  tRNA pseudouridine synthase B  37.3 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  43.88 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2825  tRNA pseudouridine synthase B  43.66 
 
 		 315 aa  111  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.791691  hitchhiker  0.00423146 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0612  tRNA pseudouridine synthase B  34.38 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.259864  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3542  tRNA pseudouridine synthase B  37.3 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3473  tRNA pseudouridine synthase B  37.3 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3641  tRNA pseudouridine synthase B  37.3 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3579  tRNA pseudouridine synthase B  36.76 
 
 		 314 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.911389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0076  tRNA pseudouridine synthase B  36.46 
 
 		 359 aa  110  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.908993 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  35.29 
 
 		 308 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl282  tRNA pseudouridine 5S synthase  33.51 
 
 		 286 aa  108  2e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000650748  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3603  tRNA pseudouridine synthase B  35.87 
 
 		 314 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0328137 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3463  tRNA pseudouridine synthase B  34.22 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0963  tRNA pseudouridine synthase B  34.76 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0397132  normal  0.0378785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  42.52 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3327  tRNA pseudouridine synthase B  43.9 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212932  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04550  putative tRNA pseudouridine synthase  34.67 
 
 		 238 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  42.26 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03033  tRNA pseudouridine synthase B  36.41 
 
 		 314 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.975802  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0539  tRNA pseudouridine synthase B  36.41 
 
 		 314 aa  107  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3358  tRNA pseudouridine synthase B  36.41 
 
 		 314 aa  107  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0532  tRNA pseudouridine synthase B  36.41 
 
 		 314 aa  107  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405191 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02984  hypothetical protein  36.41 
 
 		 314 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3462  tRNA pseudouridine synthase B  36.41 
 
 		 314 aa  107  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.266438 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  35.83 
 
 		 294 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0071  tRNA pseudouridine synthase B  33.18 
 
 		 380 aa  107  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3031  tRNA pseudouridine synthase B  32.5 
 
 		 303 aa  107  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4487  tRNA pseudouridine synthase B  36.41 
 
 		 314 aa  107  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0287  tRNA pseudouridine synthase B  35 
 
 		 367 aa  107  5e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  32.02 
 
 		 298 aa  106  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3605  tRNA pseudouridine synthase B  36.41 
 
 		 314 aa  106  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3346  tRNA pseudouridine synthase B  35.11 
 
 		 307 aa  106  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  41.07 
 
 		 307 aa  106  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  36.9 
 
 		 299 aa  106  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0810  tRNA pseudouridine synthase B  34.76 
 
 		 314 aa  106  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.384443  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0587  tRNA pseudouridine synthase B  35.29 
 
 		 314 aa  106  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  41.07 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1031  tRNA pseudouridine synthase B  35.08 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0981  tRNA pseudouridine synthase B  35.8 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2227  tRNA pseudouridine synthase B  33.86 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00164056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  41.67 
 
 		 307 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  41.67 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1694  tRNA pseudouridine synthase B  47.2 
 
 		 328 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00112277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  41.67 
 
 		 307 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  41.67 
 
 		 307 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5113  tRNA pseudouridine synthase B  45.19 
 
 		 308 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1311  tRNA pseudouridine synthase B  42.74 
 
 		 249 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0354136  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3650  tRNA pseudouridine synthase B  35.87 
 
 		 314 aa  104  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  41.67 
 
 		 307 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  41.67 
 
 		 307 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0570  tRNA pseudouridine synthase B  45.97 
 
 		 229 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1237  tRNA pseudouridine synthase B  38.92 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.657883  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0159  tRNA pseudouridine synthase B  35.39 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3344  tRNA pseudouridine synthase B  33.69 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  41.07 
 
 		 307 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  36.36 
 
 		 307 aa  102  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3387  tRNA pseudouridine synthase B  40.85 
 
 		 321 aa  102  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448784 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3058  tRNA pseudouridine synthase B  42.96 
 
 		 315 aa  102  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.538597  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3728  tRNA pseudouridine synthase B  33.87 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124557  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3783  tRNA pseudouridine synthase B  32.82 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711171  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3995  tRNA pseudouridine synthase B  33.87 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.866434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0491  tRNA pseudouridine synthase B  41.3 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.444271 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3594  tRNA pseudouridine synthase B  33.87 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0311816  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1512  tRNA pseudouridine synthase B  38.56 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.467082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2009  tRNA pseudouridine synthase B  42.31 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.845229  normal  0.607065 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1125  tRNA pseudouridine synthase B  31.55 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1091  tRNA pseudouridine synthase B  32.84 
 
 		 303 aa  102  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0150332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  33.69 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3559  tRNA pseudouridine synthase B  40.85 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000961174 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1028  tRNA pseudouridine synthase B  42.25 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000142961 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1009  tRNA pseudouridine synthase B  42.25 
 
 		 317 aa  101  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32966  predicted protein  41.18 
 
 		 279 aa  101  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1703  tRNA pseudouridine synthase B  37.04 
 
 		 339 aa  101  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000149412 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1021  tRNA pseudouridine synthase B  32.28 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  43.51 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1093  tRNA pseudouridine synthase B  42.25 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0247742 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1000  tRNA pseudouridine synthase B  41.01 
 
 		 280 aa  100  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.263341  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  35.68 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1213  tRNA pseudouridine synthase B  33.51 
 
 		 325 aa  100  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1053  tRNA pseudouridine synthase B  34.9 
 
 		 305 aa  100  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253025  hitchhiker  0.00000016309 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  43.88 
 
 		 310 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  43.88 
 
 		 310 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1032  tRNA pseudouridine synthase B  42.86 
 
 		 317 aa  100  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.358719  hitchhiker  0.0000301922 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  37.36 
 
 		 322 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1692  tRNA pseudouridine synthase B  38.92 
 
 		 305 aa  100  7e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>