More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_15021 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1399  FAD/FMN-containing dehydrogenase  91.29 
 
 		 451 aa  809    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.150639  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14641  FAD/FMN-containing dehydrogenase  81.21 
 
 		 451 aa  714    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14891  FAD/FMN-containing dehydrogenase  97.33 
 
 		 452 aa  855    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15021  FAD/FMN-containing dehydrogenase  100 
 
 		 450 aa  911    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.244066  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13511  FAD/FMN-containing dehydrogenase  56.06 
 
 		 443 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19871  FAD/FMN-containing dehydrogenase  52.76 
 
 		 459 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0370705 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0869  FAD/FMN-containing dehydrogenase  52.73 
 
 		 450 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17231  FAD/FMN-containing dehydrogenase  52.5 
 
 		 450 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0855  hypothetical protein  50.71 
 
 		 449 aa  441  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1537  hypothetical protein  47.52 
 
 		 452 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.90174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3682  FAD linked oxidase-like  37.39 
 
 		 451 aa  263  4e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1380  FAD linked oxidase domain protein  36.53 
 
 		 468 aa  259  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.221073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1475  FAD linked oxidase-like  36.01 
 
 		 468 aa  256  8e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0567  hypothetical protein  35.07 
 
 		 449 aa  253  4.0000000000000004e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.806895  decreased coverage  0.0060454 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1368  FAD linked oxidase-like  35.33 
 
 		 446 aa  252  9.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0179747 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5295  FAD linked oxidase domain protein  36.32 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1414  FAD linked oxidase domain protein  36.73 
 
 		 443 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1443  FAD linked oxidase domain protein  36.73 
 
 		 443 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3051  FAD linked oxidase-like  35.09 
 
 		 469 aa  247  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.89467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4667  FAD linked oxidase domain protein  35.25 
 
 		 469 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.526864 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3554  hypothetical protein  36.28 
 
 		 468 aa  244  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0329887  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1674  FAD linked oxidase domain protein  35.14 
 
 		 468 aa  243  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0159335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1268  hypothetical protein  34.23 
 
 		 448 aa  236  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3144  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.56 
 
 		 463 aa  235  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.720764  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5135  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 454 aa  232  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949399  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4761  FAD linked oxidase domain protein  32.67 
 
 		 457 aa  226  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19101  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2034  FAD linked oxidase domain protein  33.78 
 
 		 462 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0807703  normal  0.594146 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3873  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.5 
 
 		 459 aa  212  7.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.132225  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1715  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.78 
 
 		 462 aa  211  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131468  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1099  FAD linked oxidase domain protein  33.63 
 
 		 456 aa  206  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160498  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0798  putative FAD linked oxidase  27 
 
 		 474 aa  170  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17300  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.75 
 
 		 454 aa  136  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0304649  normal  0.13811 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1980  FAD linked oxidase domain protein  24.83 
 
 		 411 aa  106  6e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1821  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.44 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.778953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2134  hypothetical protein  33.13 
 
 		 1024 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1737  hypothetical protein  32.53 
 
 		 1024 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.522031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  27.42 
 
 		 466 aa  93.6  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.95 
 
 		 464 aa  89.7  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.36 
 
 		 469 aa  88.6  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29 
 
 		 475 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1234  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.94 
 
 		 459 aa  87.8  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3161  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.78 
 
 		 463 aa  87.4  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.07 
 
 		 496 aa  87.4  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  31.61 
 
 		 474 aa  87.4  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12710  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  23.76 
 
 		 470 aa  86.7  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  24.15 
 
 		 480 aa  85.5  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.19 
 
 		 470 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  22.76 
 
 		 499 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  21.91 
 
 		 470 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.13 
 
 		 470 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1013  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  22.44 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  22.13 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.2 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  21.93 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  21.93 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  21.73 
 
 		 470 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  21.73 
 
 		 470 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.61 
 
 		 461 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  22.89 
 
 		 499 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  22.08 
 
 		 499 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  33.09 
 
 		 472 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.09 
 
 		 481 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  22.74 
 
 		 499 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.58 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  24.5 
 
 		 466 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1321  FAD linked oxidase domain protein  35 
 
 		 497 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  30.82 
 
 		 499 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  31.29 
 
 		 470 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  22.83 
 
 		 499 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  22.41 
 
 		 499 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  27.14 
 
 		 499 aa  80.1  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  29.35 
 
 		 499 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2514  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.58 
 
 		 501 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1662  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.78 
 
 		 497 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0727  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.72 
 
 		 989 aa  78.6  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  24.18 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  21.33 
 
 		 470 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.13 
 
 		 499 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.63 
 
 		 493 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  32.63 
 
 		 460 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.77 
 
 		 945 aa  77.4  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1827  FAD linked oxidase-like  33.75 
 
 		 497 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.049746  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0132  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.73 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4137  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.54 
 
 		 497 aa  77  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4736  FAD linked oxidase-like  25.58 
 
 		 497 aa  77  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.369244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3260  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.19 
 
 		 512 aa  77  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.440454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  27.87 
 
 		 499 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0720  FAD linked oxidase domain protein  32.58 
 
 		 497 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.732845 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  22.63 
 
 		 485 aa  76.6  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2453  FAD linked oxidase domain protein  33.69 
 
 		 1017 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.999389  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  23.13 
 
 		 499 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1659  FAD linked oxidase domain protein  33.16 
 
 		 1021 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370272  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.88 
 
 		 511 aa  76.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1695  FAD linked oxidase domain protein  30.49 
 
 		 495 aa  76.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.84126 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0425  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 		 494 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.56 
 
 		 473 aa  75.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  29.55 
 
 		 461 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2755  FAD linked oxidase domain protein  33.69 
 
 		 1017 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.190253  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  23.13 
 
 		 499 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  34.11 
 
 		 457 aa  75.5  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>