More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0869 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0869  FAD/FMN-containing dehydrogenase  100 
 
 		 450 aa  922    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17231  FAD/FMN-containing dehydrogenase  98.44 
 
 		 450 aa  909    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19871  FAD/FMN-containing dehydrogenase  62.92 
 
 		 459 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0370705 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13511  FAD/FMN-containing dehydrogenase  63.3 
 
 		 443 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0855  hypothetical protein  57.85 
 
 		 449 aa  527  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1537  hypothetical protein  55.96 
 
 		 452 aa  502  1e-141  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.90174  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1399  FAD/FMN-containing dehydrogenase  54.09 
 
 		 451 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.150639  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14891  FAD/FMN-containing dehydrogenase  52.95 
 
 		 452 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14641  FAD/FMN-containing dehydrogenase  53.64 
 
 		 451 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15021  FAD/FMN-containing dehydrogenase  52.73 
 
 		 450 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.244066  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3682  FAD linked oxidase-like  38.08 
 
 		 451 aa  282  9e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0567  hypothetical protein  38.05 
 
 		 449 aa  279  9e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.806895  decreased coverage  0.0060454 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1443  FAD linked oxidase domain protein  39.23 
 
 		 443 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1414  FAD linked oxidase domain protein  39.23 
 
 		 443 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5295  FAD linked oxidase domain protein  38.13 
 
 		 446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1368  FAD linked oxidase-like  37.47 
 
 		 446 aa  267  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0179747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5135  FAD linked oxidase domain protein  37.93 
 
 		 454 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949399  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1475  FAD linked oxidase-like  37.44 
 
 		 468 aa  263  6e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1380  FAD linked oxidase domain protein  37.02 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.221073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3554  hypothetical protein  37.82 
 
 		 468 aa  259  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0329887  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3144  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.41 
 
 		 463 aa  259  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.720764  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1268  hypothetical protein  38.37 
 
 		 448 aa  253  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4667  FAD linked oxidase domain protein  35.81 
 
 		 469 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.526864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1674  FAD linked oxidase domain protein  35.94 
 
 		 468 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0159335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3873  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.01 
 
 		 459 aa  243  7e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.132225  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3051  FAD linked oxidase-like  32.42 
 
 		 469 aa  230  5e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.89467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4761  FAD linked oxidase domain protein  32.67 
 
 		 457 aa  225  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19101  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1715  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.28 
 
 		 462 aa  225  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131468  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2034  FAD linked oxidase domain protein  36.73 
 
 		 462 aa  224  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0807703  normal  0.594146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1099  FAD linked oxidase domain protein  37.16 
 
 		 456 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160498  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0798  putative FAD linked oxidase  28.51 
 
 		 474 aa  183  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17300  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.21 
 
 		 454 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0304649  normal  0.13811 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1980  FAD linked oxidase domain protein  24.59 
 
 		 411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1821  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.4 
 
 		 409 aa  106  7e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.778953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2134  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1024 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  26.36 
 
 		 466 aa  97.4  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.14 
 
 		 466 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1737  hypothetical protein  29.26 
 
 		 1024 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.522031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0727  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.58 
 
 		 989 aa  90.9  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  22.85 
 
 		 499 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  24.55 
 
 		 466 aa  87  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0490  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.27 
 
 		 471 aa  86.7  9e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.450377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  21.89 
 
 		 499 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2889  FAD linked oxidase domain protein  29.44 
 
 		 1000 aa  84.7  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.17 
 
 		 493 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  23.88 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  22.9 
 
 		 499 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  22 
 
 		 499 aa  83.6  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  23.21 
 
 		 485 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  22.14 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  24.65 
 
 		 481 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  22.38 
 
 		 499 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  22.29 
 
 		 499 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.11 
 
 		 461 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  22.22 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  22.38 
 
 		 499 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  22.12 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  24.04 
 
 		 474 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  31.34 
 
 		 470 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.53 
 
 		 499 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3304  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.63 
 
 		 490 aa  81.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.563604  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  22.13 
 
 		 499 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.78 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  22.67 
 
 		 483 aa  80.9  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.41 
 
 		 475 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  22.41 
 
 		 499 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.26 
 
 		 481 aa  80.1  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1885  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.05 
 
 		 492 aa  80.1  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78076  hitchhiker  0.00459775 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1219  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.76 
 
 		 466 aa  79.7  0.00000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.253497 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1650  glycolate oxidase subunit D  23.76 
 
 		 492 aa  79.3  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.054636 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  22.67 
 
 		 482 aa  79.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3919  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.49 
 
 		 493 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.17 
 
 		 459 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3310  FAD linked oxidase domain protein  28.95 
 
 		 470 aa  79.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000594677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  22.59 
 
 		 470 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  22.59 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  22.37 
 
 		 470 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1357  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.62 
 
 		 474 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000325772  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  22.43 
 
 		 499 aa  79  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  24.69 
 
 		 499 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  22.59 
 
 		 470 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.59 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  21.1 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  21.24 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08317  D-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17520)  30.14 
 
 		 560 aa  77.8  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.81 
 
 		 470 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.73 
 
 		 470 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12710  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  22.71 
 
 		 470 aa  78.2  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  21.57 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  20.98 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.22 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.83 
 
 		 470 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1234  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.21 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2260  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.18 
 
 		 485 aa  77.4  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.034873 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  28 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  22.38 
 
 		 480 aa  77  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  21.38 
 
 		 470 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  21.41 
 
 		 500 aa  76.6  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6132  glycolate oxidase subunit GlcD  22.17 
 
 		 499 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4146  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.15 
 
 		 493 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0502455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>