More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4761 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4761  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 457 aa  936    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19101  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1368  FAD linked oxidase-like  47.18 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0179747 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1443  FAD linked oxidase domain protein  45.31 
 
 		 443 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1414  FAD linked oxidase domain protein  45.31 
 
 		 443 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3682  FAD linked oxidase-like  45.91 
 
 		 451 aa  387  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5295  FAD linked oxidase domain protein  44.6 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1268  hypothetical protein  45.52 
 
 		 448 aa  348  9e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1674  FAD linked oxidase domain protein  42.66 
 
 		 468 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0159335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4667  FAD linked oxidase domain protein  41.74 
 
 		 469 aa  329  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.526864 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1715  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.81 
 
 		 462 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131468  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2034  FAD linked oxidase domain protein  40.58 
 
 		 462 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0807703  normal  0.594146 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3554  hypothetical protein  40.67 
 
 		 468 aa  310  5e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0329887  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1099  FAD linked oxidase domain protein  41.26 
 
 		 456 aa  302  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160498  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0567  hypothetical protein  40.09 
 
 		 449 aa  300  4e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.806895  decreased coverage  0.0060454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5135  FAD linked oxidase domain protein  39.59 
 
 		 454 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949399  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1380  FAD linked oxidase domain protein  38.71 
 
 		 468 aa  279  6e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.221073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1475  FAD linked oxidase-like  38.36 
 
 		 468 aa  279  9e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3144  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.59 
 
 		 463 aa  276  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.720764  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3051  FAD linked oxidase-like  36.81 
 
 		 469 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.89467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0798  putative FAD linked oxidase  36.34 
 
 		 474 aa  259  9e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19871  FAD/FMN-containing dehydrogenase  36.08 
 
 		 459 aa  253  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0370705 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3873  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.55 
 
 		 459 aa  250  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.132225  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0855  hypothetical protein  35.8 
 
 		 449 aa  229  9e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13511  FAD/FMN-containing dehydrogenase  34.16 
 
 		 443 aa  229  9e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0869  FAD/FMN-containing dehydrogenase  32.67 
 
 		 450 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15021  FAD/FMN-containing dehydrogenase  32.67 
 
 		 450 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.244066  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17231  FAD/FMN-containing dehydrogenase  32.45 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1537  hypothetical protein  35.39 
 
 		 452 aa  219  6e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.90174  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14891  FAD/FMN-containing dehydrogenase  33.04 
 
 		 452 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1399  FAD/FMN-containing dehydrogenase  31.97 
 
 		 451 aa  216  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.150639  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14641  FAD/FMN-containing dehydrogenase  33.04 
 
 		 451 aa  214  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17300  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.01 
 
 		 454 aa  136  9e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0304649  normal  0.13811 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1980  FAD linked oxidase domain protein  25.45 
 
 		 411 aa  107  6e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1821  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.76 
 
 		 409 aa  90.9  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.778953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0425  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.99 
 
 		 494 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0417  FAD linked oxidase domain protein  32.99 
 
 		 500 aa  80.9  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.589159  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  30.37 
 
 		 484 aa  78.2  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  30.85 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  30.13 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0727  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.57 
 
 		 989 aa  75.9  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3638  putative glycolate oxidase (FAD-linked subunit) oxidoreductase protein  30.63 
 
 		 504 aa  76.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147047  normal  0.472178 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  30 
 
 		 499 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3260  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.44 
 
 		 512 aa  75.1  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.440454 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  25.94 
 
 		 499 aa  74.7  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  30 
 
 		 499 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.48 
 
 		 469 aa  74.3  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  29.74 
 
 		 499 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  30.16 
 
 		 499 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  30.73 
 
 		 499 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1082  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1015 aa  73.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.32 
 
 		 485 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  31.25 
 
 		 500 aa  72  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.03 
 
 		 499 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  29.26 
 
 		 499 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2134  hypothetical protein  26.46 
 
 		 1024 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0645  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.1 
 
 		 511 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2889  FAD linked oxidase domain protein  25.65 
 
 		 1000 aa  70.5  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1637  FAD linked oxidase domain protein  24.47 
 
 		 503 aa  70.5  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114103  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.88 
 
 		 496 aa  70.5  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  32.59 
 
 		 499 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1737  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1024 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.522031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  26.14 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0717  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.38 
 
 		 499 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1083  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.57 
 
 		 517 aa  69.3  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  29.23 
 
 		 499 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3257  glycolate oxidase subunit GlcD  27.38 
 
 		 496 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3152  glycolate oxidase subunit GlcD  27.38 
 
 		 496 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0222  FAD linked oxidase domain protein  35.1 
 
 		 502 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3439  glycolate oxidase subunit GlcD  27.38 
 
 		 496 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0721  glycolate oxidase subunit GlcD  27.38 
 
 		 499 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0702  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.69 
 
 		 497 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138361 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3304  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.92 
 
 		 490 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.563604  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02848  glycolate oxidase subunit, FAD-linked  27.49 
 
 		 499 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139975  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3315  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  34.39 
 
 		 496 aa  68.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.422643  hitchhiker  0.00320306 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3820  FAD linked oxidase-like  25.46 
 
 		 497 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0635309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.22 
 
 		 481 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0250  FAD linked oxidase-like  31.55 
 
 		 497 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.55 
 
 		 497 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651197  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02798  hypothetical protein  27.49 
 
 		 499 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160001  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2652  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.58 
 
 		 497 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0510945 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  24.54 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.06 
 
 		 511 aa  67.8  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  28.65 
 
 		 499 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2666  glycolate oxidase FAD-linked subunit oxidoreductase  25.39 
 
 		 497 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06950  D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein, putative  28.23 
 
 		 565 aa  66.2  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2496  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.23 
 
 		 499 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2902  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.23 
 
 		 497 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.495619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  36.36 
 
 		 945 aa  66.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7454  glycolate oxidase subunit GlcD  25.92 
 
 		 499 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0650  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.59 
 
 		 497 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0624  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.59 
 
 		 497 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.864789  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12303  dehydrogenase  30.52 
 
 		 459 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  24.43 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04382  D-lactate dehydrogenase  32.7 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2514  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.82 
 
 		 501 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  33.33 
 
 		 1013 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.9 
 
 		 973 aa  65.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  27.65 
 
 		 459 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.25 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  28.12 
 
 		 503 aa  65.1  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>