More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0567 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0567  hypothetical protein  100 
 
 
449 aa  917    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.806895  decreased coverage  0.0060454 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3682  FAD linked oxidase-like  48.2 
 
 
451 aa  417  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5295  FAD linked oxidase domain protein  48.2 
 
 
446 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1368  FAD linked oxidase-like  47.11 
 
 
446 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0179747 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1443  FAD linked oxidase domain protein  48.06 
 
 
443 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1414  FAD linked oxidase domain protein  48.06 
 
 
443 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1268  hypothetical protein  46.53 
 
 
448 aa  348  8e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4667  FAD linked oxidase domain protein  40.22 
 
 
469 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.526864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1674  FAD linked oxidase domain protein  39.46 
 
 
468 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0159335  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3554  hypothetical protein  39.46 
 
 
468 aa  307  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0329887  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2034  FAD linked oxidase domain protein  41 
 
 
462 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0807703  normal  0.594146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1715  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.52 
 
 
462 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131468  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4761  FAD linked oxidase domain protein  40.09 
 
 
457 aa  302  7.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19101  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1099  FAD linked oxidase domain protein  41 
 
 
456 aa  296  4e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160498  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0798  putative FAD linked oxidase  37.3 
 
 
474 aa  292  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0855  hypothetical protein  43.56 
 
 
449 aa  291  1e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1380  FAD linked oxidase domain protein  39.04 
 
 
468 aa  291  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.221073  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3873  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.15 
 
 
459 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.132225  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19871  FAD/FMN-containing dehydrogenase  39.6 
 
 
459 aa  289  7e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0370705 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1475  FAD linked oxidase-like  38.36 
 
 
468 aa  282  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0869  FAD/FMN-containing dehydrogenase  38.05 
 
 
450 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17231  FAD/FMN-containing dehydrogenase  37.83 
 
 
450 aa  279  9e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13511  FAD/FMN-containing dehydrogenase  39.06 
 
 
443 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3144  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.67 
 
 
463 aa  272  8.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.720764  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5135  FAD linked oxidase domain protein  38.46 
 
 
454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949399  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1537  hypothetical protein  39.5 
 
 
452 aa  270  4e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.90174  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3051  FAD linked oxidase-like  33.41 
 
 
469 aa  260  4e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.89467  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14641  FAD/FMN-containing dehydrogenase  37.05 
 
 
451 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15021  FAD/FMN-containing dehydrogenase  34.47 
 
 
450 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.244066  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14891  FAD/FMN-containing dehydrogenase  34.25 
 
 
452 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1399  FAD/FMN-containing dehydrogenase  35.08 
 
 
451 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.150639  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17300  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.08 
 
 
454 aa  124  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0304649  normal  0.13811 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1980  FAD linked oxidase domain protein  23.92 
 
 
411 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1821  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.56 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.778953  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2134  hypothetical protein  30.39 
 
 
1024 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1737  hypothetical protein  30.05 
 
 
1024 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.522031  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0727  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.72 
 
 
989 aa  92  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2889  FAD linked oxidase domain protein  27 
 
 
1000 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  26.59 
 
 
498 aa  77  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.23 
 
 
469 aa  75.9  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  30.88 
 
 
484 aa  75.1  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0705  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.02 
 
 
457 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3260  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.61 
 
 
512 aa  75.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.440454 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10360  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  24.74 
 
 
472 aa  75.5  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  30.86 
 
 
499 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  25.45 
 
 
466 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1149  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.38 
 
 
467 aa  73.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.930112 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2120  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome), FAD/FMN-containing oxidoreductase  25.47 
 
 
457 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312623  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0795  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.47 
 
 
457 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.442237  normal  0.447341 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  31.43 
 
 
499 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1082  hypothetical protein  25.68 
 
 
1015 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.95 
 
 
496 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1747  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.71 
 
 
1018 aa  71.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186842 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3315  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  30.48 
 
 
496 aa  71.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.422643  hitchhiker  0.00320306 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2316  FAD linked oxidase-like protein  38.57 
 
 
1091 aa  71.2  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0331253  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  25 
 
 
466 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.92 
 
 
485 aa  70.5  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1142  FAD linked oxidase-like protein  25.79 
 
 
1015 aa  70.5  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00601773  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0645  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.8 
 
 
511 aa  70.1  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1550  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.01 
 
 
1026 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.273909  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0203  glycolate oxidase subunit GlcD  31.64 
 
 
499 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.60934 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1650  glycolate oxidase subunit D  27.27 
 
 
492 aa  70.1  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.054636 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  32.52 
 
 
480 aa  69.7  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.4 
 
 
473 aa  69.7  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  30.34 
 
 
499 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  29.81 
 
 
499 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1997  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.88 
 
 
466 aa  69.3  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  29.93 
 
 
527 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.78 
 
 
475 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1807  FAD linked oxidase  31.93 
 
 
1018 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.354547  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3919  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.94 
 
 
493 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0436  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  21.5 
 
 
447 aa  68.6  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1234  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.25 
 
 
459 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0222  FAD linked oxidase domain protein  30.43 
 
 
502 aa  68.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  28.35 
 
 
454 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  24.77 
 
 
460 aa  68.2  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1013  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  20.26 
 
 
466 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  28.85 
 
 
499 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.251033 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01656  predicted FAD-linked oxidoreductase  31.52 
 
 
1018 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1955  FAD linked oxidase domain protein  31.52 
 
 
1018 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181771  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01645  hypothetical protein  31.52 
 
 
1018 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1888  oxidoreductase, FAD-binding  31.52 
 
 
1018 aa  67.8  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2402  oxidoreductase, FAD-binding  31.52 
 
 
1018 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0186702 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1885  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.1 
 
 
492 aa  67.8  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78076  hitchhiker  0.00459775 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1944  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.52 
 
 
1018 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150005 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1768  oxidoreductase, FAD-binding  31.52 
 
 
1018 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1903  oxidoreductase, FAD-binding  31.52 
 
 
1018 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.610317  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  28.57 
 
 
499 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3257  glycolate oxidase subunit GlcD  30.29 
 
 
496 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1509  oxidoreductase, FAD-binding  32.12 
 
 
1018 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.784999  hitchhiker  0.0000155929 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0717  glycolate oxidase, subunit GlcD  30.29 
 
 
499 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1083  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.27 
 
 
517 aa  67  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3152  glycolate oxidase subunit GlcD  30.29 
 
 
496 aa  67.4  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3439  glycolate oxidase subunit GlcD  30.29 
 
 
496 aa  67.4  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0721  glycolate oxidase subunit GlcD  30.29 
 
 
499 aa  67.4  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  30.29 
 
 
499 aa  67  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02848  glycolate oxidase subunit, FAD-linked  30.29 
 
 
499 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139975  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02798  hypothetical protein  30.29 
 
 
499 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160001  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1978  FAD linked oxidase  32.45 
 
 
1018 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000994047 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3638  putative glycolate oxidase (FAD-linked subunit) oxidoreductase protein  31.43 
 
 
504 aa  66.6  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147047  normal  0.472178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>