More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_14641 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_14641  FAD/FMN-containing dehydrogenase  100 
 
 		 451 aa  912    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1399  FAD/FMN-containing dehydrogenase  81.37 
 
 		 451 aa  721    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.150639  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15021  FAD/FMN-containing dehydrogenase  81.21 
 
 		 450 aa  716    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.244066  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14891  FAD/FMN-containing dehydrogenase  80.49 
 
 		 452 aa  714    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13511  FAD/FMN-containing dehydrogenase  54.92 
 
 		 443 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0869  FAD/FMN-containing dehydrogenase  53.64 
 
 		 450 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19871  FAD/FMN-containing dehydrogenase  51.84 
 
 		 459 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0370705 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17231  FAD/FMN-containing dehydrogenase  53.64 
 
 		 450 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0855  hypothetical protein  49.76 
 
 		 449 aa  428  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1537  hypothetical protein  47.14 
 
 		 452 aa  403  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.90174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3682  FAD linked oxidase-like  37.53 
 
 		 451 aa  263  4.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0567  hypothetical protein  37.05 
 
 		 449 aa  261  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.806895  decreased coverage  0.0060454 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1368  FAD linked oxidase-like  36.64 
 
 		 446 aa  259  9e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0179747 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1380  FAD linked oxidase domain protein  35.51 
 
 		 468 aa  256  4e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.221073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5295  FAD linked oxidase domain protein  36.63 
 
 		 446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4667  FAD linked oxidase domain protein  35.75 
 
 		 469 aa  250  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.526864 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1475  FAD linked oxidase-like  35.44 
 
 		 468 aa  249  9e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1414  FAD linked oxidase domain protein  36.14 
 
 		 443 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1443  FAD linked oxidase domain protein  36.14 
 
 		 443 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1674  FAD linked oxidase domain protein  35.68 
 
 		 468 aa  249  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0159335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3554  hypothetical protein  36.51 
 
 		 468 aa  245  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0329887  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3051  FAD linked oxidase-like  34.7 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.89467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3144  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.32 
 
 		 463 aa  232  9e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.720764  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1268  hypothetical protein  33.87 
 
 		 448 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5135  FAD linked oxidase domain protein  34.46 
 
 		 454 aa  230  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949399  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3873  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.32 
 
 		 459 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.132225  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2034  FAD linked oxidase domain protein  33.11 
 
 		 462 aa  219  7e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0807703  normal  0.594146 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4761  FAD linked oxidase domain protein  33.63 
 
 		 457 aa  218  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19101  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1715  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.64 
 
 		 462 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131468  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1099  FAD linked oxidase domain protein  33.56 
 
 		 456 aa  210  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160498  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0798  putative FAD linked oxidase  27.78 
 
 		 474 aa  176  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17300  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.14 
 
 		 454 aa  150  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0304649  normal  0.13811 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1980  FAD linked oxidase domain protein  27.15 
 
 		 411 aa  116  6e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1821  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.31 
 
 		 409 aa  97.1  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.778953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2134  hypothetical protein  27.24 
 
 		 1024 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1234  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.23 
 
 		 459 aa  87  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  25.38 
 
 		 466 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1737  hypothetical protein  27 
 
 		 1024 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.522031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  24.73 
 
 		 466 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  37.5 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  31.14 
 
 		 474 aa  84  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.21 
 
 		 475 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.79 
 
 		 470 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.7 
 
 		 470 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.86 
 
 		 470 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.8 
 
 		 469 aa  79.7  0.00000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  23.69 
 
 		 470 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  24.11 
 
 		 470 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  23.69 
 
 		 470 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0132  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.25 
 
 		 472 aa  79.7  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  32.04 
 
 		 470 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.04 
 
 		 470 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.12 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.11 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.73 
 
 		 470 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.88 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  28.33 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  22.57 
 
 		 499 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  31.49 
 
 		 470 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  24.58 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  22.27 
 
 		 499 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.5 
 
 		 485 aa  74.3  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.81 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  22.13 
 
 		 499 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1321  FAD linked oxidase domain protein  24.95 
 
 		 497 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3161  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.65 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1878  D-lactate dehydrogenase  36.84 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127884  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  30.46 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12710  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  23.48 
 
 		 470 aa  73.6  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  22.4 
 
 		 496 aa  73.2  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0727  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.29 
 
 		 989 aa  73.6  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1997  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.54 
 
 		 466 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  28.57 
 
 		 462 aa  73.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  21.61 
 
 		 499 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  33.59 
 
 		 453 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.49 
 
 		 460 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.34 
 
 		 945 aa  72.4  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1801  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.09 
 
 		 461 aa  72  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00393033  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1659  FAD linked oxidase domain protein  32.62 
 
 		 1021 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370272  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  22.37 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.71 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  32.59 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.49 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  34.04 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3257  glycolate oxidase subunit GlcD  21.64 
 
 		 496 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  30.3 
 
 		 461 aa  70.5  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3536  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  30.94 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04382  D-lactate dehydrogenase  35.07 
 
 		 461 aa  70.1  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1142  FAD linked oxidase-like protein  27.93 
 
 		 1015 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00601773  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2514  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.6 
 
 		 501 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.21 
 
 		 473 aa  70.1  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3226  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.88 
 
 		 463 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.339169  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02848  glycolate oxidase subunit, FAD-linked  21.85 
 
 		 499 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139975  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3315  glycolate oxidase subunit GlcD  30.94 
 
 		 463 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  22.93 
 
 		 461 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2453  FAD linked oxidase domain protein  33.96 
 
 		 1017 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.999389  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  27.41 
 
 		 499 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3575  glycolate oxidase subunit GlcD  30.94 
 
 		 463 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02798  hypothetical protein  21.85 
 
 		 499 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160001  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3530  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  30.94 
 
 		 463 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>