More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1821 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1980  FAD linked oxidase domain protein  76.85 
 
 		 411 aa  652    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1821  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 409 aa  823    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.778953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2134  hypothetical protein  30.54 
 
 		 1024 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1414  FAD linked oxidase domain protein  26.61 
 
 		 443 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1443  FAD linked oxidase domain protein  26.61 
 
 		 443 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1737  hypothetical protein  32.79 
 
 		 1024 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.522031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3051  FAD linked oxidase-like  23.11 
 
 		 469 aa  94.4  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.89467  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2889  FAD linked oxidase domain protein  30.47 
 
 		 1000 aa  92.8  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5295  FAD linked oxidase domain protein  26.37 
 
 		 446 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13511  FAD/FMN-containing dehydrogenase  25.34 
 
 		 443 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1368  FAD linked oxidase-like  24.76 
 
 		 446 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0179747 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0727  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.34 
 
 		 989 aa  88.2  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0567  hypothetical protein  23.56 
 
 		 449 aa  85.9  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.806895  decreased coverage  0.0060454 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3682  FAD linked oxidase-like  25.6 
 
 		 451 aa  84  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1674  FAD linked oxidase domain protein  26.74 
 
 		 468 aa  83.2  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0159335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3873  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.94 
 
 		 459 aa  83.2  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.132225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1082  hypothetical protein  31.35 
 
 		 1015 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0869  FAD/FMN-containing dehydrogenase  23.4 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2178  FAD linked oxidase domain protein  33.61 
 
 		 452 aa  79.7  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393978  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0855  hypothetical protein  22.75 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0798  putative FAD linked oxidase  29.31 
 
 		 474 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14891  FAD/FMN-containing dehydrogenase  25.41 
 
 		 452 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1399  FAD/FMN-containing dehydrogenase  26.44 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.150639  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17300  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.38 
 
 		 454 aa  77.8  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0304649  normal  0.13811 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15021  FAD/FMN-containing dehydrogenase  26.67 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.244066  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17231  FAD/FMN-containing dehydrogenase  23.17 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5135  FAD linked oxidase domain protein  25.53 
 
 		 454 aa  77.4  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949399  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  24.54 
 
 		 528 aa  77.4  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4667  FAD linked oxidase domain protein  26.98 
 
 		 469 aa  77.4  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.526864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  26.45 
 
 		 525 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  32.33 
 
 		 499 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  30.26 
 
 		 503 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  26.45 
 
 		 525 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1715  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.1 
 
 		 462 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131468  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  26.45 
 
 		 525 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.33 
 
 		 499 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  25.06 
 
 		 532 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  24.2 
 
 		 521 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1099  FAD linked oxidase domain protein  29.59 
 
 		 456 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160498  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  30.43 
 
 		 499 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4399  FAD linked oxidase domain-containing protein  30 
 
 		 484 aa  71.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177563  normal  0.114484 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4761  FAD linked oxidase domain protein  24.76 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19101  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1142  FAD linked oxidase-like protein  29.35 
 
 		 1015 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00601773  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  31.47 
 
 		 499 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3144  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.99 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.720764  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0208  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.55 
 
 		 477 aa  70.5  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.23565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  33.91 
 
 		 499 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1380  FAD linked oxidase domain protein  28.23 
 
 		 468 aa  69.7  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.221073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.17 
 
 		 485 aa  69.3  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14641  FAD/FMN-containing dehydrogenase  24.37 
 
 		 451 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  31.25 
 
 		 499 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0221  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.04 
 
 		 501 aa  68.9  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.120176  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  33.04 
 
 		 499 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  32.12 
 
 		 484 aa  68.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2034  FAD linked oxidase domain protein  30.1 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0807703  normal  0.594146 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 996 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  30.77 
 
 		 499 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  33.04 
 
 		 499 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1268  FAD linked oxidase domain protein  32.17 
 
 		 497 aa  67.8  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  32.33 
 
 		 499 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.91 
 
 		 497 aa  68.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.75 
 
 		 470 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2896  FAD-binding oxidoreductase/transferase  30.16 
 
 		 480 aa  67.8  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0866  FAD linked oxidase domain protein  32.89 
 
 		 1020 aa  67.8  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.39 
 
 		 496 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2548  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.94 
 
 		 470 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.77 
 
 		 456 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1537  hypothetical protein  24.41 
 
 		 452 aa  67  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.90174  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0436  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.08 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  31.58 
 
 		 499 aa  66.6  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1268  hypothetical protein  23.68 
 
 		 448 aa  66.6  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3554  hypothetical protein  27.85 
 
 		 468 aa  66.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0329887  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  30.53 
 
 		 460 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1020  putative glycolate oxidase subunit protein  29.07 
 
 		 477 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0835602  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  34.97 
 
 		 1052 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3010  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.04 
 
 		 498 aa  66.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2680  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.07 
 
 		 477 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.152379 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  36.17 
 
 		 967 aa  65.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  34.36 
 
 		 1050 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7454  glycolate oxidase subunit GlcD  30.77 
 
 		 499 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  28.65 
 
 		 466 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6133  putative D-lactate dehydrogenase (D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase)  28.57 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750595 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.26 
 
 		 485 aa  64.7  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.09 
 
 		 531 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  36.13 
 
 		 945 aa  64.3  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2550  FAD linked oxidase domain-containing protein  30 
 
 		 486 aa  64.3  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  29.17 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  30.83 
 
 		 499 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.62 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.82 
 
 		 1007 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  23.6 
 
 		 521 aa  63.9  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  33.79 
 
 		 999 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1894  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.62 
 
 		 500 aa  63.9  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140191 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6132  glycolate oxidase subunit GlcD  30.83 
 
 		 499 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0650  FAD linked oxidase domain-containing protein  32 
 
 		 497 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.47 
 
 		 496 aa  63.9  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10573  normal  0.191937 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.1 
 
 		 999 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0624  FAD linked oxidase domain-containing protein  32 
 
 		 497 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.864789  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  32 
 
 		 497 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651197  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0702  FAD linked oxidase domain-containing protein  32 
 
 		 497 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>