More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4667 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3554  hypothetical protein  82.8 
 
 		 468 aa  806    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0329887  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4667  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 469 aa  972    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.526864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1674  FAD linked oxidase domain protein  93.59 
 
 		 468 aa  899    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0159335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1380  FAD linked oxidase domain protein  59.07 
 
 		 468 aa  535  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.221073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1475  FAD linked oxidase-like  56.07 
 
 		 468 aa  496  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3682  FAD linked oxidase-like  49.32 
 
 		 451 aa  403  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1443  FAD linked oxidase domain protein  47.38 
 
 		 443 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1414  FAD linked oxidase domain protein  47.38 
 
 		 443 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5295  FAD linked oxidase domain protein  46.17 
 
 		 446 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1268  hypothetical protein  48.51 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2034  FAD linked oxidase domain protein  47.14 
 
 		 462 aa  365  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0807703  normal  0.594146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1715  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.14 
 
 		 462 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131468  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1099  FAD linked oxidase domain protein  46.91 
 
 		 456 aa  354  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160498  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1368  FAD linked oxidase-like  46.74 
 
 		 446 aa  354  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0179747 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3051  FAD linked oxidase-like  39.86 
 
 		 469 aa  333  5e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.89467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4761  FAD linked oxidase domain protein  41.74 
 
 		 457 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19101  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3873  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.67 
 
 		 459 aa  322  6e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.132225  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5135  FAD linked oxidase domain protein  42.6 
 
 		 454 aa  322  7e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949399  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3144  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.93 
 
 		 463 aa  314  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.720764  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0567  hypothetical protein  40.22 
 
 		 449 aa  313  3.9999999999999997e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.806895  decreased coverage  0.0060454 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0798  putative FAD linked oxidase  36.77 
 
 		 474 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19871  FAD/FMN-containing dehydrogenase  39.26 
 
 		 459 aa  276  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0370705 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0855  hypothetical protein  37.26 
 
 		 449 aa  258  2e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1537  hypothetical protein  36.85 
 
 		 452 aa  249  9e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.90174  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13511  FAD/FMN-containing dehydrogenase  35.62 
 
 		 443 aa  246  8e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0869  FAD/FMN-containing dehydrogenase  35.81 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17231  FAD/FMN-containing dehydrogenase  35.58 
 
 		 450 aa  242  9e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14641  FAD/FMN-containing dehydrogenase  36.18 
 
 		 451 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14891  FAD/FMN-containing dehydrogenase  35.84 
 
 		 452 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15021  FAD/FMN-containing dehydrogenase  35.25 
 
 		 450 aa  236  8e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.244066  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1399  FAD/FMN-containing dehydrogenase  35.16 
 
 		 451 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.150639  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17300  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.7 
 
 		 454 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0304649  normal  0.13811 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1980  FAD linked oxidase domain protein  32.34 
 
 		 411 aa  110  7.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1737  hypothetical protein  34.76 
 
 		 1024 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.522031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2134  hypothetical protein  35.23 
 
 		 1024 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.5 
 
 		 475 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  34.86 
 
 		 466 aa  103  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0727  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.42 
 
 		 989 aa  103  6e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.11 
 
 		 473 aa  98.2  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  27.58 
 
 		 503 aa  98.2  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1821  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.98 
 
 		 409 aa  97.4  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.778953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1082  hypothetical protein  33.71 
 
 		 1015 aa  96.7  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  32.35 
 
 		 474 aa  94.7  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  34.69 
 
 		 500 aa  94.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3304  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.57 
 
 		 490 aa  92.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.563604  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  36.08 
 
 		 499 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  31.75 
 
 		 466 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  36.08 
 
 		 499 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.15 
 
 		 485 aa  92.4  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  25.34 
 
 		 484 aa  91.7  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2496  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.44 
 
 		 499 aa  91.3  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2902  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.03 
 
 		 497 aa  90.9  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.495619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  31.75 
 
 		 466 aa  90.9  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.33 
 
 		 469 aa  90.5  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  34.03 
 
 		 499 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0132  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.18 
 
 		 472 aa  89.7  9e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.78 
 
 		 457 aa  90.1  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  34.55 
 
 		 499 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.02 
 
 		 499 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  35.42 
 
 		 499 aa  89.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  30.18 
 
 		 472 aa  89  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3536  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  29.96 
 
 		 463 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.39 
 
 		 458 aa  89  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3978  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.18 
 
 		 497 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.65 
 
 		 457 aa  89  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  29.1 
 
 		 459 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2889  FAD linked oxidase domain protein  27.31 
 
 		 1000 aa  88.2  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  32.99 
 
 		 499 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.08 
 
 		 464 aa  88.2  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1013  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.39 
 
 		 466 aa  88.2  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2514  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.18 
 
 		 501 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  32.8 
 
 		 460 aa  87.8  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  32.98 
 
 		 499 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 498 aa  87.8  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3278  glycolate oxidase, GlcD subunit  30.38 
 
 		 463 aa  87.4  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0069912  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  30.18 
 
 		 472 aa  87.4  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0720  FAD linked oxidase domain protein  33.18 
 
 		 497 aa  87.4  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.732845 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2666  glycolate oxidase FAD-linked subunit oxidoreductase  32.46 
 
 		 497 aa  87  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.38 
 
 		 481 aa  86.7  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  33.16 
 
 		 499 aa  86.7  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  33 
 
 		 495 aa  86.7  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.28 
 
 		 496 aa  86.7  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  27.13 
 
 		 499 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2652  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.46 
 
 		 497 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0510945 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0047  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.67 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.424124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12303  dehydrogenase  32.39 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1142  FAD linked oxidase-like protein  23.18 
 
 		 1015 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00601773  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.39 
 
 		 485 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2790  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.33 
 
 		 506 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  24.84 
 
 		 466 aa  85.1  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  34.2 
 
 		 457 aa  85.1  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1637  FAD linked oxidase domain protein  32.18 
 
 		 503 aa  84.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114103  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3315  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  34.97 
 
 		 496 aa  84.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.422643  hitchhiker  0.00320306 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3820  FAD linked oxidase-like  31.94 
 
 		 497 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0635309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.49 
 
 		 468 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  27.27 
 
 		 499 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  30.59 
 
 		 454 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0425  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 494 aa  84.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  33.16 
 
 		 499 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0624  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.46 
 
 		 497 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.864789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>