More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_14891 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_14891  FAD/FMN-containing dehydrogenase  100 
 
 
452 aa  916    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1399  FAD/FMN-containing dehydrogenase  91.13 
 
 
451 aa  816    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.150639  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14641  FAD/FMN-containing dehydrogenase  80.49 
 
 
451 aa  714    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15021  FAD/FMN-containing dehydrogenase  97.33 
 
 
450 aa  855    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.244066  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13511  FAD/FMN-containing dehydrogenase  55.84 
 
 
443 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0869  FAD/FMN-containing dehydrogenase  52.95 
 
 
450 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19871  FAD/FMN-containing dehydrogenase  52.07 
 
 
459 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0370705 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17231  FAD/FMN-containing dehydrogenase  52.73 
 
 
450 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0855  hypothetical protein  51.2 
 
 
449 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1537  hypothetical protein  47.52 
 
 
452 aa  419  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.90174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3682  FAD linked oxidase-like  37.44 
 
 
451 aa  266  4e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1368  FAD linked oxidase-like  36.03 
 
 
446 aa  259  9e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0179747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1414  FAD linked oxidase domain protein  36.93 
 
 
443 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1443  FAD linked oxidase domain protein  36.93 
 
 
443 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1380  FAD linked oxidase domain protein  36.53 
 
 
468 aa  258  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.221073  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1475  FAD linked oxidase-like  35.94 
 
 
468 aa  255  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5295  FAD linked oxidase domain protein  36.12 
 
 
446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0567  hypothetical protein  34.17 
 
 
449 aa  252  1e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.806895  decreased coverage  0.0060454 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4667  FAD linked oxidase domain protein  35.84 
 
 
469 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.526864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1674  FAD linked oxidase domain protein  35.56 
 
 
468 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0159335  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3051  FAD linked oxidase-like  35.09 
 
 
469 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.89467  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3554  hypothetical protein  36.04 
 
 
468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0329887  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3144  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.01 
 
 
463 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.720764  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5135  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 
454 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949399  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1268  hypothetical protein  33.56 
 
 
448 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4761  FAD linked oxidase domain protein  33.04 
 
 
457 aa  221  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19101  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3873  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.58 
 
 
459 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.132225  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1715  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.01 
 
 
462 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131468  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1099  FAD linked oxidase domain protein  34.07 
 
 
456 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160498  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2034  FAD linked oxidase domain protein  34.46 
 
 
462 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0807703  normal  0.594146 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0798  putative FAD linked oxidase  26.85 
 
 
474 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17300  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.43 
 
 
454 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0304649  normal  0.13811 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1980  FAD linked oxidase domain protein  24.83 
 
 
411 aa  110  7.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1821  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.41 
 
 
409 aa  106  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.778953  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2134  hypothetical protein  33.13 
 
 
1024 aa  99.8  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1737  hypothetical protein  32.53 
 
 
1024 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.522031  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  26.76 
 
 
466 aa  93.2  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.3 
 
 
464 aa  90.1  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1234  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.94 
 
 
459 aa  87  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.61 
 
 
496 aa  86.7  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.72 
 
 
475 aa  86.3  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  31.03 
 
 
474 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.22 
 
 
470 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.18 
 
 
469 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3161  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.89 
 
 
463 aa  85.1  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.08 
 
 
470 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  22.18 
 
 
499 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.13 
 
 
470 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.38 
 
 
461 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.13 
 
 
470 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  22.58 
 
 
470 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  22.78 
 
 
470 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  23.46 
 
 
480 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.58 
 
 
470 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  22.38 
 
 
470 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  23.34 
 
 
499 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  22.38 
 
 
470 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  24.78 
 
 
466 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  21.08 
 
 
499 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  22.59 
 
 
499 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  28.8 
 
 
499 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12710  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  22.53 
 
 
470 aa  80.9  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.08 
 
 
470 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.34 
 
 
481 aa  80.1  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.5 
 
 
499 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  22.72 
 
 
499 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  31.62 
 
 
472 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  23.89 
 
 
466 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02848  glycolate oxidase subunit, FAD-linked  23.29 
 
 
499 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139975  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.5 
 
 
485 aa  79  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  22.2 
 
 
499 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3257  glycolate oxidase subunit GlcD  23.29 
 
 
496 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  26.63 
 
 
499 aa  79  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.82 
 
 
457 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02798  hypothetical protein  23.29 
 
 
499 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160001  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2514  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.06 
 
 
501 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0727  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.19 
 
 
989 aa  78.2  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  32.63 
 
 
460 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0717  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.25 
 
 
499 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.47 
 
 
470 aa  77  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  22.77 
 
 
499 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0721  glycolate oxidase subunit GlcD  23.06 
 
 
499 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.07 
 
 
945 aa  76.6  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3439  glycolate oxidase subunit GlcD  23.06 
 
 
496 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3152  glycolate oxidase subunit GlcD  23.06 
 
 
496 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0720  FAD linked oxidase domain protein  32.06 
 
 
497 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.732845 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  33.08 
 
 
457 aa  76.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1013  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  21.11 
 
 
466 aa  76.3  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.82 
 
 
473 aa  75.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3304  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.06 
 
 
490 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.563604  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0702  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.3 
 
 
497 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.138361 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  27.62 
 
 
499 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2652  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.3 
 
 
497 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0510945 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3820  FAD linked oxidase-like  30.3 
 
 
497 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0635309  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.16 
 
 
493 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0250  FAD linked oxidase-like  30.3 
 
 
497 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579749  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  30.88 
 
 
499 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.3 
 
 
497 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651197  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0425  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.81 
 
 
494 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0624  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.53 
 
 
497 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.864789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>