More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5135 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3144  FAD linked oxidase domain-containing protein  84.38 
 
 		 463 aa  755    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.720764  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5135  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 454 aa  935    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949399  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3873  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.14 
 
 		 459 aa  476  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.132225  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3051  FAD linked oxidase-like  40.27 
 
 		 469 aa  341  1e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.89467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3682  FAD linked oxidase-like  41.4 
 
 		 451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1674  FAD linked oxidase domain protein  43.27 
 
 		 468 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0159335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1414  FAD linked oxidase domain protein  44.44 
 
 		 443 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1443  FAD linked oxidase domain protein  44.44 
 
 		 443 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5295  FAD linked oxidase domain protein  44.24 
 
 		 446 aa  333  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4667  FAD linked oxidase domain protein  42.6 
 
 		 469 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.526864 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3554  hypothetical protein  43.53 
 
 		 468 aa  320  3.9999999999999996e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0329887  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1368  FAD linked oxidase-like  42.96 
 
 		 446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0179747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1268  hypothetical protein  44.8 
 
 		 448 aa  312  7.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2034  FAD linked oxidase domain protein  42.31 
 
 		 462 aa  299  7e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0807703  normal  0.594146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1715  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.08 
 
 		 462 aa  296  4e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131468  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1380  FAD linked oxidase domain protein  40.47 
 
 		 468 aa  295  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.221073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1099  FAD linked oxidase domain protein  42.53 
 
 		 456 aa  293  4e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160498  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4761  FAD linked oxidase domain protein  39.59 
 
 		 457 aa  283  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19101  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1475  FAD linked oxidase-like  39.31 
 
 		 468 aa  282  7.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19871  FAD/FMN-containing dehydrogenase  38.39 
 
 		 459 aa  276  6e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0370705 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0567  hypothetical protein  38.46 
 
 		 449 aa  271  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.806895  decreased coverage  0.0060454 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17231  FAD/FMN-containing dehydrogenase  38.39 
 
 		 450 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0855  hypothetical protein  39.29 
 
 		 449 aa  267  2e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0869  FAD/FMN-containing dehydrogenase  37.93 
 
 		 450 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13511  FAD/FMN-containing dehydrogenase  37.92 
 
 		 443 aa  266  7e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1537  hypothetical protein  38.88 
 
 		 452 aa  264  2e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.90174  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0798  putative FAD linked oxidase  37.19 
 
 		 474 aa  250  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1399  FAD/FMN-containing dehydrogenase  33.79 
 
 		 451 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.150639  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15021  FAD/FMN-containing dehydrogenase  33.33 
 
 		 450 aa  233  6e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.244066  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14891  FAD/FMN-containing dehydrogenase  33.33 
 
 		 452 aa  232  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14641  FAD/FMN-containing dehydrogenase  34.62 
 
 		 451 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17300  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  37.04 
 
 		 454 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0304649  normal  0.13811 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1821  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.53 
 
 		 409 aa  106  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.778953  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1980  FAD linked oxidase domain protein  23.45 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2134  hypothetical protein  30.93 
 
 		 1024 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0727  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.54 
 
 		 989 aa  91.7  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1737  hypothetical protein  31.05 
 
 		 1024 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.522031  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2889  FAD linked oxidase domain protein  24.1 
 
 		 1000 aa  89  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1082  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1015 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06950  D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein, putative  25.7 
 
 		 565 aa  80.9  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1142  FAD linked oxidase-like protein  25.55 
 
 		 1015 aa  77  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00601773  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  29.15 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.54 
 
 		 523 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.34 
 
 		 516 aa  70.5  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.64 
 
 		 493 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.88 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1997  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.8 
 
 		 466 aa  67.8  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.88 
 
 		 469 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.88 
 
 		 469 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  27.88 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  29.67 
 
 		 517 aa  67.4  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  27.88 
 
 		 452 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  34.71 
 
 		 470 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.71 
 
 		 470 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.71 
 
 		 470 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.71 
 
 		 470 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  33.88 
 
 		 470 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  33.88 
 
 		 470 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  33.88 
 
 		 470 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.88 
 
 		 470 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.05 
 
 		 481 aa  66.6  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.13 
 
 		 464 aa  66.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  35.8 
 
 		 462 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  26.41 
 
 		 474 aa  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  31.71 
 
 		 466 aa  66.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.88 
 
 		 469 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  29.38 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  31.65 
 
 		 520 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.88 
 
 		 469 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  27.83 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.88 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.05 
 
 		 496 aa  65.1  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  31.71 
 
 		 466 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  35.88 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0221  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 		 501 aa  64.3  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.120176  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  28.57 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  28.57 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.32 
 
 		 485 aa  64.7  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  28.57 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.05 
 
 		 516 aa  64.3  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.1 
 
 		 485 aa  64.3  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3919  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.9 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  33.07 
 
 		 499 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.43 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  28.72 
 
 		 513 aa  63.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.06 
 
 		 470 aa  63.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0332  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  28.11 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2415  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  28.11 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2602  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  28.11 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1193  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  28.11 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  30.73 
 
 		 503 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  34.78 
 
 		 456 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.94 
 
 		 485 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  28.57 
 
 		 469 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  27.81 
 
 		 471 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  27.81 
 
 		 471 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2875  FAD linked oxidase domain protein  31.93 
 
 		 474 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  29.66 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.84 
 
 		 456 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6132  glycolate oxidase subunit GlcD  32.37 
 
 		 499 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>