More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3682 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5295  FAD linked oxidase domain protein  70.05 
 
 		 446 aa  659    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3682  FAD linked oxidase-like  100 
 
 		 451 aa  935    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1414  FAD linked oxidase domain protein  66.06 
 
 		 443 aa  605  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1443  FAD linked oxidase domain protein  66.06 
 
 		 443 aa  605  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1368  FAD linked oxidase-like  64.3 
 
 		 446 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0179747 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0567  hypothetical protein  48.2 
 
 		 449 aa  418  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.806895  decreased coverage  0.0060454 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4667  FAD linked oxidase domain protein  49.32 
 
 		 469 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.526864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1268  hypothetical protein  48.74 
 
 		 448 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1674  FAD linked oxidase domain protein  49.1 
 
 		 468 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0159335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2034  FAD linked oxidase domain protein  46.62 
 
 		 462 aa  397  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0807703  normal  0.594146 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3554  hypothetical protein  47.29 
 
 		 468 aa  395  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0329887  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1715  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.39 
 
 		 462 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131468  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4761  FAD linked oxidase domain protein  45.91 
 
 		 457 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19101  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1099  FAD linked oxidase domain protein  45.7 
 
 		 456 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160498  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1380  FAD linked oxidase domain protein  44.44 
 
 		 468 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.221073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1475  FAD linked oxidase-like  43.16 
 
 		 468 aa  348  1e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0798  putative FAD linked oxidase  40.32 
 
 		 474 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5135  FAD linked oxidase domain protein  41.4 
 
 		 454 aa  336  3.9999999999999995e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949399  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3144  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.29 
 
 		 463 aa  333  3e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.720764  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3051  FAD linked oxidase-like  36.14 
 
 		 469 aa  320  3e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.89467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3873  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.83 
 
 		 459 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.132225  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19871  FAD/FMN-containing dehydrogenase  35.96 
 
 		 459 aa  289  9e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0370705 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1537  hypothetical protein  37 
 
 		 452 aa  287  2e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.90174  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0869  FAD/FMN-containing dehydrogenase  38.08 
 
 		 450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17231  FAD/FMN-containing dehydrogenase  37.69 
 
 		 450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1399  FAD/FMN-containing dehydrogenase  37.67 
 
 		 451 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.150639  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14891  FAD/FMN-containing dehydrogenase  37.44 
 
 		 452 aa  265  8e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0855  hypothetical protein  35.48 
 
 		 449 aa  265  2e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15021  FAD/FMN-containing dehydrogenase  37.39 
 
 		 450 aa  263  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.244066  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14641  FAD/FMN-containing dehydrogenase  37.53 
 
 		 451 aa  262  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13511  FAD/FMN-containing dehydrogenase  37.24 
 
 		 443 aa  259  7e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17300  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.41 
 
 		 454 aa  156  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0304649  normal  0.13811 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1980  FAD linked oxidase domain protein  25.23 
 
 		 411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1821  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.36 
 
 		 409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.778953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2134  hypothetical protein  31.22 
 
 		 1024 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2889  FAD linked oxidase domain protein  33.52 
 
 		 1000 aa  103  6e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1737  hypothetical protein  33.15 
 
 		 1024 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.522031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0727  FAD linked oxidase domain-containing protein  25 
 
 		 989 aa  99.8  9e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.82 
 
 		 485 aa  89  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  30 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  25.35 
 
 		 503 aa  84.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  29.96 
 
 		 466 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.24 
 
 		 499 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  28.45 
 
 		 499 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3820  FAD linked oxidase-like  24.06 
 
 		 497 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0635309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0702  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.06 
 
 		 497 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138361 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0250  FAD linked oxidase-like  24.06 
 
 		 497 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579749  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  29.59 
 
 		 466 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3665  hypothetical protein  82.61 
 
 		 61 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.06 
 
 		 497 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651197  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1082  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1015 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0650  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.65 
 
 		 497 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0624  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.65 
 
 		 497 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.864789  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12710  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.64 
 
 		 470 aa  76.6  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  27.64 
 
 		 499 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10360  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.31 
 
 		 472 aa  75.9  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1885  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.8 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78076  hitchhiker  0.00459775 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30 
 
 		 496 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  26.56 
 
 		 499 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2652  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.1 
 
 		 497 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0510945 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1650  glycolate oxidase subunit D  28.8 
 
 		 492 aa  74.3  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.054636 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1637  FAD linked oxidase domain protein  24.32 
 
 		 503 aa  74.3  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114103  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  38.02 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6132  glycolate oxidase subunit GlcD  28.87 
 
 		 499 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  28.87 
 
 		 499 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2666  glycolate oxidase FAD-linked subunit oxidoreductase  29.63 
 
 		 497 aa  73.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0959  putative glycolate oxidase (FAD-linked subunit) oxidoreductase protein  25.28 
 
 		 501 aa  73.6  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.967814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  26.83 
 
 		 499 aa  73.6  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1142  FAD linked oxidase-like protein  22.09 
 
 		 1015 aa  73.6  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00601773  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0436  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.11 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3315  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  27.81 
 
 		 496 aa  73.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.422643  hitchhiker  0.00320306 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0047  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.78 
 
 		 483 aa  73.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.424124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.4 
 
 		 469 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.31 
 
 		 457 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.06 
 
 		 890 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  36.29 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  24.14 
 
 		 484 aa  72  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2902  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.63 
 
 		 497 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.495619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3304  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.54 
 
 		 490 aa  72.4  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.563604  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2496  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.63 
 
 		 499 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  35.2 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0417  FAD linked oxidase domain protein  31.38 
 
 		 500 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.589159  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2790  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.41 
 
 		 506 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2514  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.75 
 
 		 501 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3978  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.27 
 
 		 497 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  28.04 
 
 		 500 aa  71.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  31.64 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  31.64 
 
 		 495 aa  70.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2410  FAD linked oxidase-like  28.65 
 
 		 474 aa  70.9  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0222  FAD linked oxidase domain protein  32.11 
 
 		 502 aa  70.9  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0720  FAD linked oxidase domain protein  28.27 
 
 		 497 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.732845 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  29.85 
 
 		 499 aa  70.5  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  27.81 
 
 		 499 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  27.81 
 
 		 499 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_46355  predicted protein  23.21 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111321  normal  0.450226 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  28.34 
 
 		 499 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1234  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.55 
 
 		 459 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0717  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.85 
 
 		 499 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0425  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.32 
 
 		 494 aa  70.1  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3257  glycolate oxidase subunit GlcD  28.85 
 
 		 496 aa  70.1  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>