2259 genes were found for organism Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 23    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Tcr_0001  CDS  NC_007520  1  1404  +  1404  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_390272  unclonable  0.0000000000009849  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0002  CDS  NC_007520  1580  2686  +  1107  DNA polymerase III, beta subunit  YP_390273  unclonable  0.000000000000101704  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0003  CDS  NC_007520  2785  3873  +  1089  DNA replication and repair protein RecF  YP_390274  unclonable  0.000000000000176519  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0004  CDS  NC_007520  3978  4649  +  672  two component transcriptional regulator  YP_390275  unclonable  0.0000000000000117037  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0005  CDS  NC_007520  4646  5986  +  1341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  YP_390276  hitchhiker  0.0000685276  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0006  CDS  NC_007520  6102  7295  +  1194  Outer membrane protein-like  YP_390277  hitchhiker  0.00129905  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0007  CDS  NC_007520  7292  8428  +  1137  secretion protein HlyD  YP_390278  normal  0.0298949  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0008  CDS  NC_007520  8430  11516  +  3087  heavy metal efflux pump CzcA  YP_390279  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0009  CDS  NC_007520  11513  11833  +  321  hypothetical protein  YP_390280  hitchhiker  0.00762738  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0010  CDS  NC_007520  11988  12548  +  561  hypothetical protein  YP_390281  normal  0.019528  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0011  CDS  NC_007520  12559  13596  +  1038  hypothetical protein  YP_390282  normal  0.113943  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0012  CDS  NC_007520  13889  16330  +  2442  DNA gyrase, B subunit  YP_390283  hitchhiker  0.00964713  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0013  CDS  NC_007520  16506  17447  +  942  phosphoribulokinase  YP_390284  unclonable  0.0000000000000450397  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0014  CDS  NC_007520  17520  19403  -  1884  hypothetical protein  YP_390285  hitchhiker  0.000000906355  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0015  CDS  NC_007520  19571  20410  +  840  MltA-interacting MipA  YP_390286  hitchhiker  0.0046334  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0016  CDS  NC_007520  20441  20818  -  378  RNA-binding S4  YP_390287  normal  0.10348  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0017  CDS  NC_007520  20832  21803  -  972  coproporphyrinogen III oxidase  YP_390288  normal  0.208175  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0018  CDS  NC_007520  21893  22711  +  819  peptidase M48, Ste24p  YP_390289  normal  0.273769  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0019  CDS  NC_007520  22708  23268  -  561  SUA5/yciO/yrdC-like  YP_390290  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0020  CDS  NC_007520  23428  24573  +  1146  polysaccharide deacetylase  YP_390291  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0021  CDS  NC_007520  25085  26356  +  1272  diguanylate cyclase  YP_390292  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0022  CDS  NC_007520  26396  26815  +  420  hypothetical protein  YP_390293  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0023  CDS  NC_007520  26823  27452  +  630  lysine exporter protein LysE/YggA  YP_390294  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0024  CDS  NC_007520  27566  28963  +  1398  beta-lactamase-like  YP_390295  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0025  CDS  NC_007520  29245  29964  +  720  hypothetical protein  YP_390296  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0026  CDS  NC_007520  29982  31052  -  1071  hypothetical protein  YP_390297  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0027  CDS  NC_007520  31218  34097  -  2880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_390298  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0028  CDS  NC_007520  34387  35154  -  768  diguanylate phosphodiesterase  YP_390299  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0029  CDS  NC_007520  35332  36684  +  1353  Sodium/sulphate symporter  YP_390300  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0030  CDS  NC_007520  36688  37902  -  1215  Sodium/hydrogen exchanger  YP_390301  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0031  CDS  NC_007520  38186  39412  +  1227  hypothetical protein  YP_390302  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0032  CDS  NC_007520  39663  40460  +  798  ABC transporter related  YP_390303  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0033  CDS  NC_007520  40487  41740  +  1254  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  YP_390304  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0034  CDS  NC_007520  41737  42567  +  831  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  YP_390305  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0035  CDS  NC_007520  42903  44597  +  1695  NifA subfamily transcriptional regulator  YP_390306  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0036  CDS  NC_007520  44664  45698  -  1035  ribosome-associated GTPase  YP_390307  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0037  CDS  NC_007520  46099  47466  -  1368  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  YP_390308  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0038  CDS  NC_007520  47476  48558  -  1083  putative acyl-CoA dehydrogenase  YP_390309  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0039  CDS  NC_007520  48617  49156  -  540  OsmC-like protein  YP_390310  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0040  CDS  NC_007520  49479  49922  +  444  cyanate hydratase  YP_390311  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0041  CDS  NC_007520  50074  50718  +  645  2OG-Fe(II) oxygenase  YP_390312  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0042  CDS  NC_007520  50787  51536  -  750  hypothetical protein  YP_390313  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0043  CDS  NC_007520  51696  52676  -  981  homoserine kinase  YP_390314  normal  0.848383  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0044  CDS  NC_007520  52701  55520  +  2820  DNA polymerase I  YP_390315  hitchhiker  0.00167336  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0045  CDS  NC_007520  55621  56889  +  1269  hypothetical protein  YP_390316  unclonable  0.000000000000224806  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0046  CDS  NC_007520  56983  57711  +  729  hypothetical protein  YP_390317  hitchhiker  0.000000000325595  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0047  CDS  NC_007520  57757  58395  -  639  GTP-binding protein, HSR1-related  YP_390318  hitchhiker  0.00000000165704  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0048  CDS  NC_007520  58499  60493  +  1995  ResB-like  YP_390319  hitchhiker  0.0000246708  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0049  CDS  NC_007520  60490  61665  +  1176  cytochrome c assembly protein  YP_390320  hitchhiker  0.00321304  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0050  CDS  NC_007520  61689  62312  +  624  DSBA oxidoreductase  YP_390321  normal  0.0556342  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0051  CDS  NC_007520  62478  64121  +  1644  acetolactate synthase  YP_390322  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0052  CDS  NC_007520  64175  64513  +  339  hypothetical protein  YP_390323  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0053  CDS  NC_007520  64517  65083  -  567  nitroreductase  YP_390324  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0054  CDS  NC_007520  65366  66280  +  915  LysR family transcriptional regulator  YP_390325  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0055  CDS  NC_007520  66302  67054  +  753  VacJ-like lipoprotein  YP_390326  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0056  CDS  NC_007520  67064  68128  +  1065  secretion protein HlyD  YP_390327  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0057  CDS  NC_007520  68140  71199  +  3060  acriflavin resistance protein  YP_390328  normal  0.663476  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0058  CDS  NC_007520  71226  71543  -  318  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  YP_390329  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0059  CDS  NC_007520  71558  71827  -  270  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  YP_390330  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0060  CDS  NC_007520  71821  72318  -  498  cation antiporter  YP_390331  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0061  CDS  NC_007520  72315  73841  -  1527  NADH dehydrogenase (quinone)  YP_390332  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0062  CDS  NC_007520  73838  74242  -  405  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  YP_390333  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0063  CDS  NC_007520  74242  77085  -  2844  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  YP_390334  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0064  CDS  NC_007520  77383  79143  +  1761  Na+/Pi-cotransporter  YP_390335  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0065  CDS  NC_007520  79637  80056  -  420  hypothetical protein  YP_390336  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0066  CDS  NC_007520  80217  82382  +  2166  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  YP_390337  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0067  CDS  NC_007520  82491  84542  +  2052  oligopeptidase A  YP_390338  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0068  CDS  NC_007520  84682  85935  +  1254  aromatic hydrocarbon degradation protein  YP_390339  normal  0.952244  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0069  CDS  NC_007520  85957  87246  +  1290  major facilitator transporter  YP_390340  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0070  CDS  NC_007520  87297  89450  +  2154  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_390341  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0071  CDS  NC_007520  89481  91181  -  1701  hypothetical protein  YP_390342  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0072  CDS  NC_007520  91213  93207  -  1995  TPR repeat-containing protein  YP_390343  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0073  CDS  NC_007520  93207  94256  -  1050  von Willebrand factor, type A  YP_390344  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0074  CDS  NC_007520  94253  94732  -  480  hypothetical protein  YP_390345  normal  0.863966  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0075  CDS  NC_007520  94732  95646  -  915  hypothetical protein  YP_390346  normal  0.193793  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0076  CDS  NC_007520  95671  96642  -  972  ATPase  YP_390347  hitchhiker  0.00279376  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0077  CDS  NC_007520  96811  99636  -  2826  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_390348  decreased coverage  0.000232315  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0078  CDS  NC_007520  99789  100787  -  999  methyltransferase, putative  YP_390349  normal  0.0228138  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0079  CDS  NC_007520  100812  101567  -  756  methyltransferase  YP_390350  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0080  CDS  NC_007520  101684  102817  -  1134  lytic transglycosylase, catalytic  YP_390351  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0081  CDS  NC_007520  102827  103723  -  897  DNA/RNA non-specific endonuclease  YP_390352  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0082    NC_007520  103749  103991  -  243      normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0083  CDS  NC_007520  104344  108048  -  3705  hypothetical protein  YP_390353  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0084  CDS  NC_007520  108554  109333  +  780  SmtA protein  YP_390354  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0085  CDS  NC_007520  110457  110885  -  429  hypothetical protein  YP_390355  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0086  CDS  NC_007520  110878  113217  -  2340  hypothetical protein  YP_390356  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0087  CDS  NC_007520  113207  114802  -  1596  hypothetical protein  YP_390357  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0088  CDS  NC_007520  114789  116072  -  1284  Phage integrase  YP_390358  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0089  CDS  NC_007520  116229  116828  -  600  SmtA protein  YP_390359  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0090  CDS  NC_007520  117029  118291  +  1263  diguanylate cyclase  YP_390360  normal  0.260319  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0091  CDS  NC_007520  118336  119247  -  912  hypothetical protein  YP_390361  hitchhiker  0.000240765  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0092  CDS  NC_007520  119284  119838  -  555  rhodanese-like protein  YP_390362  hitchhiker  0.000000022207  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0093  CDS  NC_007520  119967  120701  -  735  Beta-lactamase-like  YP_390363  decreased coverage  0.00000000294531  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0094  CDS  NC_007520  120804  122063  +  1260  major facilitator transporter  YP_390364  hitchhiker  0.000000571011  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0095  CDS  NC_007520  122219  123208  +  990  ATPase  YP_390365  normal  0.204442  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0096  CDS  NC_007520  123215  124225  +  1011  hypothetical protein  YP_390366  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0097  CDS  NC_007520  124212  124742  +  531  hypothetical protein  YP_390367  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0098  CDS  NC_007520  124742  125833  +  1092  von Willebrand factor, type A  YP_390368  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0099  CDS  NC_007520  125830  127785  +  1956  von Willebrand factor, type A  YP_390369  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0100  CDS  NC_007520  127779  129284  +  1506  hypothetical protein  YP_390370  normal  1  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 23    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>