13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0022 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0022  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  278  1e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1104  hypothetical protein  36.92 
 
 
147 aa  90.5  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000403669  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0568  hypothetical protein  35.16 
 
 
133 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0168206  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0290  hypothetical protein  33.6 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1877  hypothetical protein  30.83 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0432  hypothetical protein  31.93 
 
 
156 aa  60.8  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0522  hypothetical protein  32.11 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.62682  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0682  hypothetical protein  36.7 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.798662  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2727  hypothetical protein  28.46 
 
 
133 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3050  hypothetical protein  28.45 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3072  hypothetical protein  28.45 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.283945  normal  0.874986 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1202  hypothetical protein  27.88 
 
 
139 aa  47  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000142447  hitchhiker  0.00000387981 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1628  hypothetical protein  28.93 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>