13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0086 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0086  hypothetical protein  100 
 
 		 779 aa  1613    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2177  hypothetical protein  24.73 
 
 		 734 aa  192  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4013  hypothetical protein  25.39 
 
 		 751 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0330  putative integrase  21.77 
 
 		 676 aa  87  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0517  integrase family protein  26.9 
 
 		 689 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4605  hypothetical protein  22.08 
 
 		 745 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.468839  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1124  hypothetical protein  25.76 
 
 		 655 aa  60.5  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3232  integrase family protein  21.83 
 
 		 681 aa  54.3  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0324  hypothetical protein  25.23 
 
 		 667 aa  50.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.669728 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0559  hypothetical protein  22.45 
 
 		 693 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0584  hypothetical protein  22.45 
 
 		 693 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.286852 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0590  hypothetical protein  22.45 
 
 		 693 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1600  DNA-binding protein  35.78 
 
 		 561 aa  45.4  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>