80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0014 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0014  hypothetical protein  100 
 
 		 627 aa  1272    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000906355  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3511  hypothetical protein  36.73 
 
 		 338 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184743  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3064  hypothetical protein  35.49 
 
 		 465 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000992265  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2040  hypothetical protein  36.71 
 
 		 331 aa  159  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.249953 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0298  hypothetical protein  32.91 
 
 		 341 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2841  hypothetical protein  32 
 
 		 337 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3255  hypothetical protein  32.31 
 
 		 337 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1642  hypothetical protein  34.07 
 
 		 356 aa  144  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.592857 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1409  hypothetical protein  33.33 
 
 		 331 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1275  hypothetical protein  33.66 
 
 		 387 aa  142  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.624785 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1438  hypothetical protein  33.33 
 
 		 331 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1637  hypothetical protein  36.89 
 
 		 376 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176047 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3131  hypothetical protein  38.42 
 
 		 520 aa  134  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04101  hypothetical protein  35.04 
 
 		 395 aa  131  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13461  hypothetical protein  37.76 
 
 		 368 aa  130  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2206  hypothetical protein  33.45 
 
 		 371 aa  127  6e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4796  hypothetical protein  36.32 
 
 		 464 aa  127  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0527  hypothetical protein  33.2 
 
 		 438 aa  126  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0180  hypothetical protein  35.34 
 
 		 456 aa  125  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1736  hypothetical protein  36.02 
 
 		 336 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4664  hypothetical protein  33.33 
 
 		 440 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000775683 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3257  hypothetical protein  37.97 
 
 		 539 aa  120  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.984135  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4404  hypothetical protein  38.16 
 
 		 436 aa  120  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.938906  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1158  hypothetical protein  36.82 
 
 		 335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.826231  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1092  hypothetical protein  36.82 
 
 		 335 aa  117  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1092  hypothetical protein  39.71 
 
 		 335 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1266  hypothetical protein  31.66 
 
 		 292 aa  116  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1399  hypothetical protein  36.14 
 
 		 435 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.465928  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0149  hypothetical protein  30.77 
 
 		 531 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.739878  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_002950  PG0490  hypothetical protein  37.29 
 
 		 446 aa  113  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2943  hypothetical protein  37.3 
 
 		 465 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1382  hypothetical protein  33.33 
 
 		 334 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17576  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1404  hypothetical protein  34.15 
 
 		 436 aa  107  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.504832  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1362  hypothetical protein  35.48 
 
 		 442 aa  106  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.338301  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05070  conserved hypothetical protein TIGR00341  38.83 
 
 		 436 aa  104  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.710534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1240  hypothetical protein  33.64 
 
 		 352 aa  103  8e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05430  putative integral membrane protein  30.35 
 
 		 486 aa  103  9e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.233091  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2462  hypothetical protein  29.55 
 
 		 438 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02040  conserved hypothetical protein TIGR00341  25.43 
 
 		 405 aa  102  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.215693  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2005  hypothetical protein  36.55 
 
 		 352 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.881933 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0322  hypothetical protein  36.22 
 
 		 434 aa  99.4  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1811  membrane protein-like  41.46 
 
 		 400 aa  97.8  6e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0324  hypothetical protein  36.02 
 
 		 434 aa  97.4  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.559062  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0621  hypothetical protein  33.04 
 
 		 427 aa  97.1  9e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.231348  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3466  hypothetical protein  32.28 
 
 		 449 aa  95.9  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3066  hypothetical protein  37.5 
 
 		 430 aa  95.1  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.041816  normal  0.269214 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2346  hypothetical protein  34.5 
 
 		 527 aa  90.9  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0206723  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3348  hypothetical protein  30.04 
 
 		 502 aa  89.4  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0576037  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0647  hypothetical protein  30.66 
 
 		 345 aa  87.8  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0696  hypothetical protein  28.71 
 
 		 348 aa  87  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.884285  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0631  hypothetical protein  24.08 
 
 		 335 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.49684 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2096  hypothetical protein  31.46 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1157  hypothetical protein  33.51 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258093  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2955  hypothetical protein  27.89 
 
 		 354 aa  82.8  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3806  hypothetical protein  33.33 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0192  hypothetical protein  25.69 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2713  hypothetical protein  31.22 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1287  hypothetical protein  24.78 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0523  hypothetical protein  33.85 
 
 		 330 aa  79.7  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.698891 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2300  hypothetical protein  29.86 
 
 		 424 aa  79  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461087 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1741  hypothetical protein  31.61 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.698203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1618  hypothetical protein  28.99 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1610  hypothetical protein  27.64 
 
 		 546 aa  70.9  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000006851 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29666  predicted protein  29.38 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0087  hypothetical protein  28.17 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.102505  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3559  hypothetical protein  31.82 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0724  hypothetical protein  31.98 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00775573  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1813  hypothetical protein  25.51 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2627  hypothetical protein  28.96 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5385  hypothetical protein  27.23 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2366  hypothetical protein  25.59 
 
 		 307 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00393064  normal  0.965104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2358  hypothetical protein  25.59 
 
 		 308 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2319  hypothetical protein  25.59 
 
 		 307 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.902875  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31739  predicted protein  31.76 
 
 		 486 aa  59.7  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.659517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0892  hypothetical protein  26.13 
 
 		 429 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000427125 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2438  hypothetical protein  24.72 
 
 		 431 aa  54.7  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1573  hypothetical protein  28.87 
 
 		 430 aa  54.7  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0618  hypothetical protein  30.61 
 
 		 274 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1136  membrane protein-like protein  24.62 
 
 		 315 aa  53.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.632999 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2882  hypothetical protein  28.35 
 
 		 322 aa  50.8  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.888795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>