29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0074 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0074  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  326  1.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.863966  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3800  hypothetical protein  34.76 
 
 
173 aa  87.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  32.68 
 
 
161 aa  80.5  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  32.68 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1947  hypothetical protein  27.81 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2814  hypothetical protein  33.76 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1745  hypothetical protein  32.56 
 
 
238 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0566  hypothetical protein  27.71 
 
 
172 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1625  hypothetical protein  28.66 
 
 
171 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100987 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3557  hypothetical protein  28.74 
 
 
172 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3387  hypothetical protein  28.92 
 
 
172 aa  50.8  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.493947 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2889  hypothetical protein  32.95 
 
 
181 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5139  hypothetical protein  29.57 
 
 
173 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.977257 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2859  hypothetical protein  29.11 
 
 
206 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2463  hypothetical protein  28.66 
 
 
187 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4533  hypothetical protein  27.85 
 
 
165 aa  48.5  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.129236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2137  putative transmembrane protein  32.1 
 
 
170 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00280947 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1203  hypothetical protein  27.22 
 
 
164 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  27.52 
 
 
222 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3084  hypothetical protein  28.24 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223372  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2171  hypothetical protein  26.97 
 
 
179 aa  45.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2764  hypothetical protein  28.76 
 
 
218 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.572683  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2784  hypothetical protein  29.03 
 
 
218 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1594  hypothetical protein  28.76 
 
 
212 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.869699  hitchhiker  0.000000510539 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2429  hypothetical protein  31.97 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05145  hypothetical protein  27.87 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2680  hypothetical protein  29.63 
 
 
182 aa  43.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3056  alpha-2 type XI collagen  35.44 
 
 
165 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.245138  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2602  hypothetical protein  26.32 
 
 
170 aa  42  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>