12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3557 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3557  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  352  1e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0566  hypothetical protein  93.6 
 
 
172 aa  320  7e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3387  hypothetical protein  95.35 
 
 
172 aa  304  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.493947 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000307  hypothetical protein  37.59 
 
 
192 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0074  hypothetical protein  30.18 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.863966  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  25 
 
 
222 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4533  hypothetical protein  38.1 
 
 
165 aa  45.1  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.129236 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2990  hypothetical protein  35.14 
 
 
228 aa  42.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2889  hypothetical protein  28.88 
 
 
181 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1660  hypothetical protein  24.22 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5139  hypothetical protein  35.29 
 
 
173 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.977257 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3800  hypothetical protein  36.51 
 
 
173 aa  41.2  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>