40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1660 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1660  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  345  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  34.87 
 
 
222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2602  hypothetical protein  32.93 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3161  hypothetical protein  39.35 
 
 
200 aa  77.8  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1625  hypothetical protein  35.51 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3030  hypothetical protein  37.96 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  0.12237 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2680  hypothetical protein  32.41 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1526  hypothetical protein  37.72 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1947  hypothetical protein  28.99 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2814  hypothetical protein  34.31 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2463  hypothetical protein  34.78 
 
 
187 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3092  hypothetical protein  39.32 
 
 
197 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1594  hypothetical protein  36.28 
 
 
212 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.869699  hitchhiker  0.000000510539 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2764  hypothetical protein  32.23 
 
 
218 aa  61.6  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.572683  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2859  hypothetical protein  34.51 
 
 
206 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1469  hypothetical protein  37.61 
 
 
197 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188437 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1562  hypothetical protein  27.88 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2784  hypothetical protein  31.4 
 
 
218 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1457  hypothetical protein  36.75 
 
 
197 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000911468 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1404  hypothetical protein  37.61 
 
 
197 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000195716 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3761  hypothetical protein  27.88 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2429  hypothetical protein  31.87 
 
 
164 aa  59.3  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2171  hypothetical protein  29.94 
 
 
179 aa  58.5  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  25.81 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2030  hypothetical protein  27.27 
 
 
164 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1719  hypothetical protein  25.6 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820837  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3712  hypothetical protein  27.27 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69074  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3084  hypothetical protein  32.06 
 
 
158 aa  53.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223372  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  25.49 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0525  hypothetical protein  28.12 
 
 
183 aa  52.4  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3210  hypothetical protein  26.04 
 
 
165 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1105  hypothetical protein  30.39 
 
 
162 aa  48.5  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1590  hypothetical protein  26.79 
 
 
164 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125319  hitchhiker  0.0000367551 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5139  hypothetical protein  32.08 
 
 
173 aa  47.4  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.977257 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2137  putative transmembrane protein  32.09 
 
 
170 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00280947 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3115  hypothetical protein  32.71 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0723929  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24410  hypothetical protein  26.67 
 
 
164 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284104  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2068  hypothetical protein  26.06 
 
 
164 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.737914  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1203  hypothetical protein  26.28 
 
 
164 aa  41.6  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2931  hypothetical protein  30.4 
 
 
164 aa  40.8  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.977948  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>